| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 629,078 | A→G | I63M (ATA→ATG) | SAUSA300_RS02960 → | 3‑hexulose‑6‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 629,078 | 0 | A | G | 99.7% | 898.7 / ‑5.7 | 310 | I63M (ATA→ATG) | SAUSA300_RS02960 | 3‑hexulose‑6‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (308/1); total (309/1) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.38e-01 | |||||||||||
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
CGGTACGCCAATCATTTACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATAGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTAAAGCAGCT > NC_007793/628982‑629174 | tACGCCAATCATTTACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCa > 1:3462292/1‑100 (MQ=255) aCGCCAATCATTTACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAg > 1:3476783/1‑100 (MQ=255) aCGCCAATCATTTACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAg > 1:1929596/1‑100 (MQ=255) gctgctACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTa > 1:3220448/6‑100 (MQ=255) ttACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGaa > 1:2295870/1‑100 (MQ=255) aCAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGt > 1:3443192/1‑100 (MQ=255) aCAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGt > 1:5170071/1‑100 (MQ=255) taaCGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGtt > 1:1727337/2‑100 (MQ=255) aaGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCa > 1:4944437/1‑100 (MQ=255) tACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATTCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAAt > 1:1090240/1‑100 (MQ=255) tACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCaga > 1:4456478/1‑98 (MQ=255) tACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAAt > 1:3244733/1‑100 (MQ=255) tACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAAt > 1:3525697/1‑100 (MQ=255) tACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAAt > 1:520152/1‑100 (MQ=255) aCCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAAtt > 1:273586/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTa > 1:5239753/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTa > 1:340896/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTa > 1:2357736/1‑100 (MQ=255) cagcagTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTaa > 1:1260305/1‑100 (MQ=255) cagcagTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTaa > 1:1277848/1‑100 (MQ=255) gcagTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAAt > 1:5135666/1‑100 (MQ=255) tccaCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgc > 1:5226148/4‑100 (MQ=255) tAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgc > 1:1131272/1‑100 (MQ=255) aaaCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgcg > 1:2961177/1‑100 (MQ=255) aaaCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgcg > 1:253105/1‑100 (MQ=255) aaaCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgcg > 1:4588306/1‑100 (MQ=255) aaaCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTAGgcg > 1:28719/1‑100 (MQ=255) aaCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgcgc > 1:2967604/1‑100 (MQ=255) gtgtatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGcgcg > 1:5159870/4‑100 (MQ=255) aCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGCATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGcgcg > 1:2904198/1‑100 (MQ=255) tgtatGGCAGACACCATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCgg > 1:1861956/3‑100 (MQ=255) cATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCgg > 1:3739863/1‑100 (MQ=255) cATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATT‑AATTTGGCGCGGa > 1:4599740/1‑100 (MQ=255) ttatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTAGGCGCAGa > 1:3827495/2‑100 (MQ=255) gtatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa > 1:5294616/2‑100 (MQ=255) ctatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa > 1:775794/2‑100 (MQ=255) ctatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa > 1:4127086/2‑100 (MQ=255) ctatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa > 1:5260371/2‑100 (MQ=255) atatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa > 1:3906002/1‑100 (MQ=255) agatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTAAGCCAAGCAATTAAATTTGCcgcgag > 1:3670505/3‑98 (MQ=255) tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt > 1:3113748/1‑100 (MQ=255) tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt > 1:4085306/1‑100 (MQ=255) tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt > 1:3372327/1‑100 (MQ=255) tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt > 1:2539439/1‑100 (MQ=255) tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt > 1:3162450/1‑100 (MQ=255) tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCAGAt > 1:5655753/1‑100 (MQ=255) tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATACAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt > 1:2639076/1‑100 (MQ=255) catGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt > 1:4023810/2‑100 (MQ=255) catGGCAGACAACATTAGAAGTGTAAAAGTATTAGCAGTCATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt > 1:83288/2‑100 (MQ=255) actGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCAGAt > 1:1431924/3‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg > 1:4366585/1‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg > 1:4517770/1‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg > 1:4287537/1‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg > 1:1963928/1‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg > 1:4406938/1‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg > 1:4689637/1‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg > 1:4744376/1‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg > 1:508637/1‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg > 1:1001082/1‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg > 1:1186297/1‑100 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCAGAtc > 1:1381071/1‑99 (MQ=255) atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTCGGCGCAGAtc > 1:3971602/1‑99 (MQ=255) ggCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTa > 1:2249949/1‑100 (MQ=255) ggCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTa > 1:4211517/1‑100 (MQ=255) ggCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTa > 1:5448776/1‑100 (MQ=255) gCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTaa > 1:4791944/1‑100 (MQ=255) cAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAAt > 1:532675/1‑100 (MQ=255) cAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAAt > 1:2041947/1‑100 (MQ=255) aGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGACAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAAtt > 1:3271329/1‑100 (MQ=255) acaacaTTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTAc > 1:2852623/1‑100 (MQ=255) ctAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAgg > 1:1607189/2‑100 (MQ=255) tAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGgt > 1:3790327/1‑100 (MQ=255) gTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTg > 1:3560868/1‑100 (MQ=255) ttAGAAGACATGAAAATTATGGATGAAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGGAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATg > 1:3723148/1‑100 (MQ=255) tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCGATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGc > 1:2161065/1‑100 (MQ=255) tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGAtcg > 1:5371106/1‑98 (MQ=255) tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGc > 1:5529967/1‑100 (MQ=255) tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGc > 1:5773278/1‑100 (MQ=255) tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGc > 1:4896138/1‑100 (MQ=255) tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGc > 1:2459518/1‑100 (MQ=255) tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGc > 1:639383/1‑100 (MQ=255) gtgtggACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGAAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGc > 1:1657309/6‑100 (MQ=255) tgCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCa > 1:4143864/2‑100 (MQ=255) ggCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTCGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGAGTTGCAGAAGATGCa > 1:1802631/2‑100 (MQ=255) aGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCa > 1:57275/1‑100 (MQ=255) aGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCa > 1:304263/1‑100 (MQ=255) aGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTCGCAGAAGAtcgg > 1:5570283/1‑97 (MQ=255) aGCACACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCa > 1:5006880/1‑100 (MQ=255) ccAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCAt > 1:2772114/2‑100 (MQ=255) ccAGACATGAAAATTATAGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCAt > 1:1551640/2‑100 (MQ=255) cAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGTGCGGATGTAATTACAATACTAGGGGTTGCAGAAGATGCATc > 1:4564395/1‑100 (MQ=255) cAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGAtcggaa > 1:2814684/1‑95 (MQ=255) cAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGATAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGAGTTGCAGAAGATGCATc > 1:1449391/1‑100 (MQ=255) aGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCa > 1:2095238/1‑100 (MQ=255) aTGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTa > 1:1308997/1‑100 (MQ=255) gAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTaaa > 1:3992711/1‑100 (MQ=255) aaaTTATGGATGCAGCTAATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTAAagc > 1:713419/1‑100 (MQ=255) cttATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTAAagcag > 1:908225/2‑100 (MQ=255) ttATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTAAagcagc > 1:4303536/1‑100 (MQ=255) tatgGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTAAagcagca < 1:153886/100‑2 (MQ=255) | CGGTACGCCAATCATTTACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATAGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTAAAGCAGCT > NC_007793/628982‑629174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |