D66 :: BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_007793	579,538	A→G	I216V (ATT→GTT)	SAUSA300_RS02770 →	RNA methyltransferase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_007793	579,538	0	A	G	100.0%	497.4 / NA	171	I216V (ATT→GTT)	SAUSA300_RS02770	RNA methyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (168/3); total (168/3)

Only 100 of 171 total aligned reads displayed.

AATCTAGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGATTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGTTGGAGAAA  >  NC_007793/579442‑579634

caTCTAGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTc                                                                                               >  1:4312897/2‑100 (MQ=255)

aaTCTAGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTc                                                                                               >  1:4271502/1‑100 (MQ=255)

 aTCTAGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGAAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGGGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTcc                                                                                              >  1:4148164/1‑100 (MQ=255)

   cTAGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCaa                                                                                            >  1:3521008/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGTCATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:2600360/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGTTGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:2511855/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:1737339/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:236790/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:2643625/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:318772/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:3881445/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:1835451/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:411376/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:1768870/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:4516337/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:4628548/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:4716444/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:4773086/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:4927215/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:1223991/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:627941/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:919150/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGCAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:1043809/1‑100 (MQ=255)

     aGAAGCGGACATGTCACTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATg                                                                                          >  1:3839786/1‑100 (MQ=255)

          cGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTgg                                                                                     >  1:3717369/1‑100 (MQ=255)

            gACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTCTATTAAGGTTCCAATGGTTGGAc                                                                                   >  1:5011568/1‑100 (MQ=255)

               gtgccATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATg                                                                                >  1:1949157/5‑100 (MQ=255)

                   tgttGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGAATGAGTCGCCTAGTAAGTGATACATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTaaa                                                                            >  1:5744302/3‑100 (MQ=255)

                   cATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTaaa                                                                            >  1:3629973/1‑100 (MQ=255)

                      tGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAg                                                                         >  1:1412982/1‑100 (MQ=255)

                      tGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGAACATGTAAACAg                                                                         >  1:3697732/1‑100 (MQ=255)

                       ggCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAGTGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGt                                                                        >  1:1275847/1‑100 (MQ=255)

                       ggCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGt                                                                        >  1:5124750/1‑100 (MQ=255)

                           aTTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGa                                                                    >  1:1046695/1‑100 (MQ=255)

                           aTTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGa                                                                    >  1:1698906/1‑100 (MQ=255)

                            gggTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGaa                                                                   >  1:512216/3‑100 (MQ=255)

                             tGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAAt                                                                  >  1:3751685/1‑100 (MQ=255)

                              gTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATg                                                                 >  1:1604895/1‑100 (MQ=255)

                              gTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATg                                                                 >  1:4864593/1‑100 (MQ=255)

                                aaTTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGGTAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCt                                                               >  1:21116/1‑100 (MQ=255)

                                 cttGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCtt                                                              >  1:4903456/2‑100 (MQ=255)

                                 actGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCtt                                                              >  1:2209770/3‑100 (MQ=255)

                                 aTTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCtt                                                              >  1:5594518/1‑100 (MQ=255)

                                  ttGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTc                                                             >  1:2235927/1‑100 (MQ=255)

                                   tGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTTCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCg                                                            >  1:5739183/1‑100 (MQ=255)

                                   tGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCg                                                            >  1:776330/1‑100 (MQ=255)

                                   tGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCg                                                            >  1:4953588/1‑100 (MQ=255)

                                   tGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCg                                                            >  1:3272003/1‑100 (MQ=255)

                                   tGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCg                                                            >  1:1916546/1‑100 (MQ=255)

                                   tGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCg                                                            >  1:1781280/1‑100 (MQ=255)

                                    ggTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCgg                                                           >  1:85876/1‑100 (MQ=255)

                                    ggTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCgg                                                           >  1:698287/1‑100 (MQ=255)

                                    ggTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCgg                                                           >  1:4040763/1‑100 (MQ=255)

                                       aGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTg                                                        >  1:575742/1‑100 (MQ=255)

                                       aGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTg                                                        >  1:2362293/1‑100 (MQ=255)

                                       aGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTg                                                        >  1:2745666/1‑100 (MQ=255)

                                         ccaaGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTgca                                                      >  1:5331984/3‑100 (MQ=255)

                                         cGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTgca                                                      >  1:5597036/1‑100 (MQ=255)

                                          taaGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTgcag                                                     >  1:1380546/2‑100 (MQ=255)

                                          caaGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTgcag                                                     >  1:1926523/2‑100 (MQ=255)

                                           gaGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTgcagc                                                    >  1:50232/2‑100 (MQ=255)

                                           aaGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTgcagc                                                    >  1:2654195/1‑100 (MQ=255)

                                           aaGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTgcagc                                                    >  1:4715922/1‑100 (MQ=255)

                                            aGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGGTTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTgcagca                                                   >  1:3887745/1‑100 (MQ=255)

                                             ggACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCaa                                                  >  1:3023917/1‑100 (MQ=255)

                                             ctaCAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCaa                                                  >  1:1580322/3‑100 (MQ=255)

                                              gACAGGGTATGCGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAg                                                 >  1:661096/1‑100 (MQ=255)

                                              gACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAg                                                 >  1:5414365/1‑100 (MQ=255)

                                               ccAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGt                                                >  1:739911/2‑100 (MQ=255)

                                               ccAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGt                                                >  1:1106965/2‑100 (MQ=255)

                                               ccAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGCTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGATgcagatcgg                                                >  1:2272804/2‑95 (MQ=255)

                                               aCAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGt                                                >  1:3375194/1‑100 (MQ=255)

                                               aCAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGt                                                >  1:3444639/1‑100 (MQ=255)

                                                 aGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGttt                                              >  1:2106474/1‑100 (MQ=255)

                                                 aGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGttt                                              >  1:618920/1‑100 (MQ=255)

                                                  gggTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTa                                             >  1:3470666/1‑100 (MQ=255)

                                                    gTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAat                                           >  1:2681174/1‑100 (MQ=255)

                                                         aGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGt                                      >  1:5508726/1‑100 (MQ=255)

                                                            cGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACg                                   >  1:1866730/1‑100 (MQ=255)

                                                            cGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACg                                   >  1:4703364/1‑100 (MQ=255)

                                                            agCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACg                                   >  1:2920991/2‑100 (MQ=255)

                                                             gCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGa                                  >  1:4834461/1‑100 (MQ=255)

                                                                 aGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTa                              >  1:4871274/1‑100 (MQ=255)

                                                                 aGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTa                              >  1:4002263/1‑100 (MQ=255)

                                                                 aGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTa                              >  1:5076347/1‑100 (MQ=255)

                                                                 aGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCAGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTa                              >  1:5039878/1‑100 (MQ=255)

                                                                    aaGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTAttt                           >  1:1435784/1‑100 (MQ=255)

                                                                     aGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTc                          >  1:4323084/1‑100 (MQ=255)

                                                                          tAAATGCGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGaaaa                     >  1:82034/1‑100 (MQ=255)

                                                                                cGATTTTTATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAAACat               <  1:5164404/100‑1 (MQ=255)

                                                                                      ttATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACTTGATGtt         >  1:4974754/1‑100 (MQ=255)

                                                                                      ttATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGtt         >  1:456246/1‑100 (MQ=255)

                                                                                      ttATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGtt         >  1:1505227/1‑100 (MQ=255)

                                                                                      ttATATTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGtt         >  1:2512294/1‑100 (MQ=255)

                                                                                        atatTAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGTTgg       <  1:2982883/100‑1 (MQ=255)

                                                                                          tctAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTCCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGTTGgag     >  1:4656854/3‑100 (MQ=255)

                                                                                            tAAGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGTTGGAGaa   >  1:2632288/1‑100 (MQ=255)

                                                                                             aaGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCATGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGTTGGAGaaa  >  1:3312734/1‑100 (MQ=255)

                                                                                             aaGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGTTGGAGaaa  >  1:2799344/1‑100 (MQ=255)

                                                                                             aaGGTTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGTTGGAGaaa  >  1:5250981/1‑100 (MQ=255)

AATCTAGAAGCGGACATGTCATTGGCTATTGTAATTGGTAGCGAAGGACAGGGTATGAGTCGCCTAGTAAGTGATAAATGCGATTTTTATATTAAGATTCCAATGGTTGGACATGTAAACAGTTTGAATGCTTCGGTTGCAGCAAGTTTAATGATGTACGAAGTATTTCGAAAAAGACATGATGTTGGAGAAA  >  NC_007793/579442‑579634

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 17 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG` `< 39 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`