D66 :: BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_007793	571,607	A→G	Q16R (CAA→CGA)	SAUSA300_RS02740 →	DNA repair protein RadA

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_007793	571,607	0	A	G	99.7%	1022.7 / ‑6.9	361	Q16R (CAA→CGA)	SAUSA300_RS02740	DNA repair protein RadA
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (354/6); total (355/6)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.72e-01

Only 100 of 361 total aligned reads displayed.

GAATGTGCGTTTAAAATAGATTTGTTCAAAGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCAATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATGGAGTTAA  >  NC_007793/571512‑571703

                      tGTTCAAAGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAG‑AAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTcc                                                                       >  1:3171657/1‑100 (MQ=255)

                         tCAAAGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTa                                                                     >  1:1134919/1‑100 (MQ=255)

                         acAAAGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTa                                                                     >  1:3547725/2‑100 (MQ=255)

                           aaaGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAAt                                                                   >  1:1852660/1‑100 (MQ=255)

                            aaGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAAtt                                                                  >  1:5647435/1‑100 (MQ=255)

                            aaGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAAtt                                                                  >  1:153411/1‑100 (MQ=255)

                             aGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATtg                                                                 >  1:4640013/1‑100 (MQ=255)

                              ggAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATtgt                                                                >  1:1193276/1‑100 (MQ=255)

                              gcaaaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATtgt                                                                >  1:1264979/3‑100 (MQ=255)

                                aaaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTCGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTgg                                                              >  1:1038424/1‑100 (MQ=255)

                                 caGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                             >  1:1550576/2‑100 (MQ=255)

                                 aaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                             >  1:2005405/1‑100 (MQ=255)

                                 aaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                             >  1:3252861/1‑100 (MQ=255)

                                 aaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                             >  1:264854/1‑100 (MQ=255)

                                  aGTGGAGGTGCCATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgcg                                                            >  1:2141259/1‑100 (MQ=255)

                                      caGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTg                                                        >  1:1589638/2‑100 (MQ=255)

                                        ggTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGa                                                      >  1:2502783/1‑100 (MQ=255)

                                        ggTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGa                                                      >  1:3660180/1‑100 (MQ=255)

                                        ggTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTACGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGa                                                      >  1:5496774/1‑100 (MQ=255)

                                         gTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGaa                                                     >  1:402279/1‑100 (MQ=255)

                                         gTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGaa                                                     >  1:2852092/1‑100 (MQ=255)

                                           gCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATc                                                   >  1:5368411/1‑100 (MQ=255)

                                           gCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGAAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATc                                                   >  1:5197321/1‑100 (MQ=255)

                                           ctgtgcttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGTTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATc                                                   >  1:4707913/7‑100 (MQ=255)

                                             gtgtttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGAGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGCGGCGCTTGGAATCaa                                                 >  1:2537553/4‑100 (MQ=255)

                                                tttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATg                                              >  1:4599002/1‑100 (MQ=255)

                                                cttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATg                                              >  1:3649437/2‑100 (MQ=255)

                                                actGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATg                                              >  1:941137/3‑100 (MQ=255)

                                                 ttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgg                                             >  1:4467823/1‑100 (MQ=255)

                                                 ttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgg                                             >  1:2716860/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:2955727/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:1916098/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:4873003/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:5125940/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:538997/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:1874013/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:5544257/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:3987896/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:2925745/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:5704934/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:5749344/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:2688460/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:624546/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:4336975/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAACgga                                            >  1:5443703/1‑100 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGGGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGCTATCGATCTCCTAAATGGACGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAACggc                                            >  1:5566220/1‑99 (MQ=255)

                                                  tGGCCAAGAAAAAAGCGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:4092345/1‑100 (MQ=255)

                                                  aggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                            >  1:3855010/2‑100 (MQ=255)

                                                   ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                           >  1:3932799/1‑100 (MQ=255)

                                                   ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                           >  1:4812290/1‑100 (MQ=255)

                                                   ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                           >  1:3504288/1‑100 (MQ=255)

                                                   ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                           >  1:429443/1‑100 (MQ=255)

                                                   ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                           >  1:558476/1‑100 (MQ=255)

                                                   ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                           >  1:106581/1‑100 (MQ=255)

                                                   ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                           >  1:71508/1‑100 (MQ=255)

                                                   ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                           >  1:788139/1‑100 (MQ=255)

                                                   ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                           >  1:4279143/1‑100 (MQ=255)

                                                   ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATcgag                                           >  1:3392236/1‑100 (MQ=255)

                                                    cccAAGAAAAAAGCGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAGAtcggaa                                          >  1:4205605/2‑95 (MQ=255)

                                                     ccAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggagga                                         >  1:1740842/1‑100 (MQ=255)

                                                                        tGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGcc                      >  1:577751/1‑100 (MQ=255)

                                                                        tGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGcc                      >  1:821359/1‑100 (MQ=255)

                                                                         gAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCa                     >  1:2442127/1‑100 (MQ=255)

                                                                         gAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCa                     >  1:2343004/1‑100 (MQ=255)

                                                                            tGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATc                  >  1:2092893/1‑100 (MQ=255)

                                                                            attATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGGTGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATc                  >  1:4584948/3‑100 (MQ=255)

                                                                             ttATGGCTTGTGGGTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc                 >  1:3724768/2‑100 (MQ=255)

                                                                             gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAagatcggaagag                 >  1:1354149/1‑90 (MQ=255)

                                                                             gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc                 >  1:2353366/1‑100 (MQ=255)

                                                                             gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc                 >  1:3422526/1‑100 (MQ=255)

                                                                             gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc                 >  1:4745191/1‑100 (MQ=255)

                                                                             gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc                 >  1:5282806/1‑100 (MQ=255)

                                                                             gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc                 >  1:1433990/1‑100 (MQ=255)

                                                                             gTATGGCTTGTGGTTATCGATCACCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc                 >  1:1344461/1‑100 (MQ=255)

                                                                             ctATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc                 >  1:4255776/2‑100 (MQ=255)

                                                                             atATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc                 >  1:491791/2‑100 (MQ=255)

                                                                              gaTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCt                >  1:2232818/2‑100 (MQ=255)

                                                                              aaTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCt                >  1:1945813/2‑100 (MQ=255)

                                                                              aaTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCt                >  1:3121303/2‑100 (MQ=255)

                                                                               gtGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTa               >  1:3692176/2‑100 (MQ=255)

                                                                               gtGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTa               >  1:3761006/2‑100 (MQ=255)

                                                                               aTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTa               >  1:5058608/1‑100 (MQ=255)

                                                                               aTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTa               >  1:3609038/1‑100 (MQ=255)

                                                                               aTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTa               >  1:1644137/1‑100 (MQ=255)

                                                                               aTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTa               >  1:2518584/1‑100 (MQ=255)

                                                                                tGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTaa              >  1:5008805/1‑100 (MQ=255)

                                                                                tGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTaa              >  1:3463352/1‑100 (MQ=255)

                                                                                tGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTaa              >  1:1498845/1‑100 (MQ=255)

                                                                                 ggCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCGAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTaaa             >  1:1986484/1‑100 (MQ=255)

                                                                                 ggCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTaaa             >  1:655885/1‑100 (MQ=255)

                                                                                 ggCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTaaa             >  1:68744/1‑100 (MQ=255)

                                                                                 ggCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTaaa             >  1:1002508/1‑100 (MQ=255)

                                                                                  gCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAAc            >  1:1704665/1‑100 (MQ=255)

                                                                                    gtgtgGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACAt          >  1:237726/2‑100 (MQ=255)

                                                                                     tgtgGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATg         >  1:4436618/1‑100 (MQ=255)

                                                                                     tgtgGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATg         >  1:4388522/1‑100 (MQ=255)

                                                                                      gtgGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATgg        >  1:2793109/1‑100 (MQ=255)

                                                                                        ggTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATGGAg      >  1:330535/1‑100 (MQ=255)

                                                                                        ggTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATGGAg      >  1:1728238/1‑100 (MQ=255)

                                                                                            aTCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGAGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATGGAGTTaa  >  1:3292674/1‑100 (MQ=255)

GAATGTGCGTTTAAAATAGATTTGTTCAAAGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCAATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATGGAGTTAA  >  NC_007793/571512‑571703

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 16 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG` `< 39 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`