Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_007793 529,026 A→C E98D (GAA→GAC)  SAUSA300_RS02520 → ribonuclease M5

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_007793529,0260AC100.0% 157.1 / NA 60E98D (GAA→GAC) SAUSA300_RS02520ribonuclease M5
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base C (53/7);  total (53/7)

ATTACTGAACATGTCAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGAATTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATAAATCTGTGCTAATAGAGTTGGGGTTA  >  NC_007793/528934‑529122
                                                                                            |                                                                                                
aTTACTGAACATGTCAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAGGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTg                                                                                           <  1:1875673/100‑1 (MQ=255)
  gtgtGAACAAGTCAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGat                                                                                         >  1:5561384/4‑100 (MQ=255)
      gAACATGTCAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAGAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTa                                                                                     >  1:37187/1‑100 (MQ=255)
      gAACATGTCAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTa                                                                                     >  1:928189/1‑100 (MQ=255)
      gAACATGTCAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTa                                                                                     >  1:458946/1‑100 (MQ=255)
       gaCATGTCAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTaa                                                                                    >  1:3595105/2‑100 (MQ=255)
        aCATGTCAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTaaa                                                                                   >  1:3395515/1‑100 (MQ=255)
           tGTCAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAaagaa                                                                                >  1:1691183/1‑100 (MQ=255)
              cAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCg                                                                             >  1:4123714/1‑100 (MQ=255)
                taGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGtt                                                                           >  1:4963264/2‑100 (MQ=255)
                aaGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGtt                                                                           >  1:346349/1‑100 (MQ=255)
                 aGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGttg                                                                          <  1:2728993/100‑2 (MQ=255)
                         aaCATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGt                                                                  >  1:1149618/1‑100 (MQ=255)
                           cATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTa                                                                >  1:2529190/1‑100 (MQ=255)
                           aaTGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTa                                                                >  1:3390016/2‑100 (MQ=255)
                            gtGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAACAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAg                                                               >  1:4438072/2‑100 (MQ=255)
                            ctGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAACAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAg                                                               >  1:604869/2‑100 (MQ=255)
                             tGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGt                                                              >  1:4541102/1‑100 (MQ=255)
                              gCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTCAATGCATGTTAGtt                                                             >  1:4671751/1‑100 (MQ=255)
                                        aTAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTtga                                                   <  1:1660475/100‑1 (MQ=255)
                                        aTAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTtga                                                   >  1:5529437/1‑100 (MQ=255)
                                                ccaGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCtt                                           >  1:1595247/3‑100 (MQ=255)
                                                  aGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTAt                                         >  1:4839462/1‑100 (MQ=255)
                                                  aGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCATTTGATGAAGCTTAt                                         >  1:2265664/1‑100 (MQ=255)
                                                   ccTAAAAATAAAAGAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATg                                        >  1:4832576/2‑100 (MQ=255)
                                                      aaaaataaaaaAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAAt                                     >  1:2751333/1‑100 (MQ=255)
                                                      aaaaataaaaaAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAAt                                     >  1:4297541/1‑100 (MQ=255)
                                                             ttgcaGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGa                              >  1:3163743/5‑100 (MQ=255)
                                                               ccaGGGAAAATTGGTGTTGAACACGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATa                            >  1:2993927/3‑100 (MQ=255)
                                                               aaaGGGAAAATTGGTGTCGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATa                            >  1:817701/1‑100 (MQ=255)
                                                                caGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATaa                           >  1:2720479/2‑100 (MQ=255)
                                                                aaGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATaa                           >  1:2352580/1‑100 (MQ=255)
                                                                 aGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATaaa                          >  1:3734231/1‑100 (MQ=255)
                                                                  gggAAAATTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATAAAt                         >  1:3850205/1‑100 (MQ=255)
                                                                     aaaaTTGGTGTTGAACATGCCGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATAAATCtg                      >  1:3940525/1‑100 (MQ=255)
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                                                                                        ccGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATAAATCTGTGCTAATAGAGTTGGGGtt   <  1:5342371/100‑1 (MQ=255)
                                                                                         cGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATAAATCTGTGCTAATAGAGTTGGGGTTa  <  1:2524440/100‑1 (MQ=255)
                                                                                         cGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATAAATCTGTGCTAATAGAGTTGGGGTTa  >  1:4739124/1‑100 (MQ=255)
                                                                                         cGACTTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATAAATCTGTGCTAATAGAGTTGGGGTTa  <  1:5715946/100‑1 (MQ=255)
                                                                                            |                                                                                                
ATTACTGAACATGTCAAAGGTGTTAAACATGCGTATATTGATAGAGAAAAAGCTAAAAATAAAAAAGGGAAAATTGGTGTTGAACATGCCGAATTAATTGATATTAAAGAAGCGTTAATGCATGTTAGTTCACCCTTTGATGAAGCTTATGAATCAATTGATAAATCTGTGCTAATAGAGTTGGGGTTA  >  NC_007793/528934‑529122

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑