| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 428,281 | G→A | T372I (ACA→ATA) | SAUSA300_RS02020 ← | alkyl hydroperoxide reductase subunit F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 428,281 | 0 | G | A | 99.8% | 22544.7 / NA | 7448 | T372I (ACA→ATA) | SAUSA300_RS02020 | alkyl hydroperoxide reductase subunit F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/12); new base A (182/7250); total (183/7265) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 7467 total aligned reads displayed.
AGTTTTGGCATTTGTTTTGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATGTAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCTTTATTTTCAAATAGAGGTC > NC_007793/428184‑428377 | gTTTTGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCACTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACgg < 1:5257212/100‑2 (MQ=255) tGATATCAACATTTGATAAATAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATAcc < 1:408642/100‑1 (MQ=255) tGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATAcc < 1:4525613/100‑1 (MQ=255) tGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATAcc < 1:241019/100‑1 (MQ=255) tGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATAcc < 1:2677892/100‑1 (MQ=255) tGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATAcc < 1:3219618/100‑1 (MQ=255) tGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATAcc < 1:3654936/100‑1 (MQ=255) tGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATAcc < 1:3715972/100‑1 (MQ=255) tGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATAcc < 1:5572298/100‑1 (MQ=255) tGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATAcc < 1:1092968/100‑1 (MQ=255) gATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGC‑TTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACAAg < 1:616392/100‑1 (MQ=255) atatCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAg < 1:950359/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:895572/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:230687/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:3071286/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:1144504/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:32811/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:3503472/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:1419659/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:5618205/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:4410047/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:4726245/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:5476932/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCa < 1:1466387/100‑1 (MQ=255) atCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGAGTAACGATACCAGCa < 1:204252/100‑1 (MQ=255) aaCATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAgg < 1:316212/100‑1 (MQ=255) aaCATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAgg < 1:3608320/100‑1 (MQ=255) aaCATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAgc < 1:4148529/100‑2 (MQ=255) aCATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAggc < 1:22605/100‑2 (MQ=255) aCATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGt < 1:4940192/100‑1 (MQ=255) aCATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGt < 1:3923873/100‑1 (MQ=255) aTTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCa < 1:5029689/100‑1 (MQ=255) tttGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCaa < 1:4629719/100‑1 (MQ=255) aaGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATtgctgc < 1:382297/100‑1 (MQ=255) aaCGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAAcccc < 1:1896837/100‑1 (MQ=255) aaCGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAAcccc < 1:4028913/100‑1 (MQ=255) aaCGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAAcccc < 1:161934/100‑1 (MQ=255) aaCGATCTTGTAACACGTTGTCAGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAAcccc < 1:5423339/100‑1 (MQ=255) ccGATC‑TGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCat < 1:1315663/99‑2 (MQ=255) aCGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAAccccg < 1:3395005/100‑2 (MQ=255) aCGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCa < 1:2769763/100‑1 (MQ=255) aCGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCa < 1:3763086/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAGCACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAAcccagg < 1:2201948/100‑4 (MQ=255) cGATCTTGTAGCACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCag < 1:4473790/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCTCag < 1:784244/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCag < 1:1993412/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCag < 1:3559469/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCag < 1:1679328/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCag < 1:2864688/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCag < 1:137161/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCag < 1:2573090/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCag < 1:1734650/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCag < 1:2517072/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCag < 1:4299875/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCac < 1:3331624/100‑2 (MQ=255) aTCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCagag < 1:467923/100‑1 (MQ=255) aTCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCagag < 1:3030954/100‑1 (MQ=255) cTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCaaaacg < 1:156735/100‑6 (MQ=255) cTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGtt < 1:4883618/100‑1 (MQ=255) cTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGtt < 1:5080541/100‑1 (MQ=255) cTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGtt < 1:2354218/100‑1 (MQ=255) cTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGtt < 1:3874721/100‑1 (MQ=255) ttGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTa < 1:5119183/100‑1 (MQ=255) tGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTat < 1:5371331/100‑2 (MQ=255) tGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTAc < 1:1789663/100‑1 (MQ=255) tGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTAc < 1:5206614/100‑1 (MQ=255) aaCACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGc < 1:397850/100‑1 (MQ=255) acacGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATACCATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGcc < 1:2816078/100‑1 (MQ=255) acacGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGcc < 1:5667647/100‑1 (MQ=255) acacGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGcc < 1:2982684/100‑1 (MQ=255) cacGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGcag < 1:1944846/100‑3 (MQ=255) gatctGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCag < 1:2096152/96‑2 (MQ=255) acGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCaa < 1:2151317/100‑2 (MQ=255) acGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCAc < 1:2723307/100‑1 (MQ=255) acGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCAc < 1:5164249/100‑1 (MQ=255) gTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCAcct < 1:3444518/100‑2 (MQ=255) gTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCACAGAGTTACCGCCagct < 1:4252039/100‑4 (MQ=255) ttGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCAccag < 1:4983845/100‑3 (MQ=255) tGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGAt < 1:577533/100‑1 (MQ=255) tCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATat < 1:731014/100‑2 (MQ=255) cTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGaggag < 1:4358148/100‑5 (MQ=255) tGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACt > 1:457430/1‑100 (MQ=255) cTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCACCCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGc < 1:1849018/100‑1 (MQ=255) ttttAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCt < 1:5523606/100‑1 (MQ=255) ttttAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCt < 1:5724095/100‑1 (MQ=255) ttttAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCt < 1:840248/100‑1 (MQ=255) tttAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCtt < 1:1516435/100‑2 (MQ=255) tttAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTa < 1:4830237/100‑1 (MQ=255) tAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTAct < 1:4784107/100‑2 (MQ=255) aaTTCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGt < 1:119465/100‑1 (MQ=255) tCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCtt < 1:2935253/100‑1 (MQ=255) tCGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCtt < 1:4198815/100‑1 (MQ=255) cGCTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGtgcac < 1:669436/100‑5 (MQ=255) cTAGCGAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCTTTAt < 1:5312316/100‑1 (MQ=255) gAATTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCTTTAttttag < 1:1259484/100‑3 (MQ=255) aaTTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCTTTAtttttat < 1:2618920/100‑4 (MQ=255) aaTTCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCTTTATTTTCaa < 1:1039563/100‑1 (MQ=255) ttCGAATAATATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCTTTATTTTCAAAt < 1:100052/100‑1 (MQ=255) aataatATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCTTTATTTTCAAATagag < 1:3121200/100‑1 (MQ=255) aatATAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCTTTATTTTCAAATAGAGGTc < 1:2473508/100‑1 (MQ=255) | AGTTTTGGCATTTGTTTTGATATCAACATTTGATAAAGAACGTAAACGATCTTGTAACACGTTGTCTGCTTTTAATTCGCTAGCGAATTCGAATAATGTAACATGATTAACGATACCAGCAAGGTCAATTGCTGCTTCAACCCCAGAGTTACCGCCACCGATAACTGCTACGTCTTTATTTTCAAATAGAGGTC > NC_007793/428184‑428377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |