| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 115,248 | T→G | G565G (GGT→GGG) | SAUSA300_RS00540 → | AraC family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 115,248 | 0 | T | G | 100.0% | 52.5 / NA | 21 | G565G (GGT→GGG) | SAUSA300_RS00540 | AraC family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (20/1); total (20/1) | |||||||||||
TGACGGGTGATACATTTATTACAAACGGCGAATATTTTAGAGGTGGTATCATCATTGAGCAATTATTAAAATTAAGTTCTAAAGTAGAGGGTATCGGTTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAATGGAAAACGT > NC_007793/115151‑115344 | tGACGGGTGATACATTTATTACAAACGGCGAATATTTTAGAGGTGGTATCATCATTGAGCAATTATTAAAATTAAGTTCTAAAGTAGAGGGTATCGGGTa > 1:4037964/1‑100 (MQ=255) gggTGATACATTTATTACAAACGGCGAATATTTTAGAGGTGGCATCATCATTGAGCAATTATTAAAACTAAGTTCTAAAGTAGAGGGCATCGGGTATTgg > 1:5091913/1‑100 (MQ=255) gTGATACATTTATTACAAACGGCGAATATTTTAGAGGTGGTATCATCATTGAGCAATTATTAAAATTAAGTTCTAAAGTAGAGGGTATCGGGTaagatcg > 1:162172/1‑94 (MQ=255) gTGATACATTTATTACAAACGGCGAATATTTTAGAGGTGGTATCATCATTGAGCAATTATTAAAATTAAGTTCTAAAGTAGAGGGTATCGGGTATTGGta < 1:4599893/100‑2 (MQ=255) aCATTTATTACAAACGGCGAATATTTTAGAGGTGGTATCATCATTGAGCAATTATTAAAATTAAGTTCTAAAGTAGAGGGTATCGGGTATTGGTTGAAtt > 1:2750119/1‑100 (MQ=255) tggtATCATCATTGAGCAATTATTAAAATTAAGTTCTAAAGTAGAGGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGaa > 1:1865244/1‑100 (MQ=255) tGAGCAATTATTAAAATTAAGTTCTAAAGTAGAGGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATg > 1:908532/1‑100 (MQ=255) aaaGTAGAGGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAat > 1:828815/1‑100 (MQ=255) aaaGTAGAGGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAat > 1:4109477/1‑100 (MQ=255) aaaGTAGAGGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAat > 1:4533993/1‑100 (MQ=255) aGTAGAGGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAatat > 1:4711033/1‑100 (MQ=255) ctagGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAAt > 1:2336484/3‑100 (MQ=255) agGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAATgg > 1:4276440/1‑100 (MQ=255) agGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAATgg > 1:4407293/1‑100 (MQ=255) agGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAATgg > 1:2385985/1‑100 (MQ=255) agGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAATgg > 1:2195650/1‑100 (MQ=255) agGGTATCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTACTGAACTATTTCATCAATATAATgg > 1:5257694/1‑100 (MQ=255) ccaTCGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGT‑AAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAATGGaaaa > 1:1082588/3‑100 (MQ=255) tgcGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAATGGAAAAc > 1:503803/3‑100 (MQ=255) cGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAATGGAAAACGt > 1:209038/1‑100 (MQ=255) cGGGTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAATGGAAAACGt > 1:949608/1‑100 (MQ=255) | TGACGGGTGATACATTTATTACAAACGGCGAATATTTTAGAGGTGGTATCATCATTGAGCAATTATTAAAATTAAGTTCTAAAGTAGAGGGTATCGGTTATTGGTTGAATTATGATTTGCACGTCAGTCATTGTAAAAATGAACGGGATTATATGAATTCTATTGAACTATTTCATCAATATAATGGAAAACGT > NC_007793/115151‑115344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |