Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_007793 2,817,595 A→G N196N (AAT→AAC)  SAUSA300_RS14395 ← serine‑rich adhesin for platelets

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0077932,817,5950AG97.4% 97.4 / ‑4.6 39N196N (AAT→AAC) SAUSA300_RS14395serine‑rich adhesin for platelets
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/1);  new base G (2/36);  total (2/37)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.68e-01

GCTAGTTGACGTTGTGCTAGTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTATTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTGATTCTGATGT  >  NC_007793/2817499‑2817684
                                                                                                |                                                                                         
gcTAGTTGACGTTGTGCTAGTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGttg                                                                                        <  1:388598/100‑2 (MQ=255)
           ttGTGCTAGTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGgttgttt                                                                             <  1:4537060/100‑2 (MQ=255)
              tgCTAGTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTgg                                                                          <  1:3053308/100‑2 (MQ=255)
              tgCTAGTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGt                                                                          <  1:5254458/100‑1 (MQ=255)
              tgCTAGTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGt                                                                          <  1:4688098/100‑1 (MQ=255)
                 atgTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACt                                                                       <  1:1315803/98‑1 (MQ=255)
                   gTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACttg                                                                     <  1:3561223/100‑1 (MQ=255)
                   gTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTATTAATTGGTTGTTCTGTACttg                                                                     <  1:4182248/100‑1 (MQ=255)
                   gTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTGGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACttg                                                                     <  1:2225171/100‑1 (MQ=255)
                      ttGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACttgaag                                                                  <  1:469161/100‑1 (MQ=255)
                         tttAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACttgaagttg                                                               <  1:2772561/100‑1 (MQ=255)
                              gTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCt                                                          <  1:3281614/100‑1 (MQ=255)
                              gTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCt                                                          <  1:168959/100‑1 (MQ=255)
                                cttccgatcttGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTAc                                                        <  1:3038951/90‑1 (MQ=255)
                                       aGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTa                                                 <  1:4285061/100‑1 (MQ=255)
                                            gCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATc                                            <  1:5061340/100‑1 (MQ=255)
                                            gCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATc                                            <  1:2483246/100‑1 (MQ=255)
                                            gCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATc                                            <  1:2834855/100‑1 (MQ=255)
                                            gCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATc                                            <  1:2335527/100‑1 (MQ=255)
                                            gCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATc                                            <  1:2510264/100‑1 (MQ=255)
                                                        gtgAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATgt                                <  1:78742/100‑1 (MQ=255)
                                                        gtgAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATgt                                <  1:4950163/100‑1 (MQ=255)
                                                          tctgggtTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATgtag                              <  1:4729583/95‑1 (MQ=255)
                                                           aaGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATgtagt                             <  1:2243420/100‑1 (MQ=255)
                                                                      taTGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAgg                  >  1:4883676/2‑100 (MQ=255)
                                                                      gATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAgg                  <  1:274430/100‑1 (MQ=255)
                                                                       aTGCAGCACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGa                 <  1:4739424/100‑1 (MQ=255)
                                                                         gCAGTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATg               >  1:2251713/1‑100 (MQ=255)
                                                                            gTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTg            <  1:352967/100‑1 (MQ=255)
                                                                            gTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTg            <  1:1036755/100‑1 (MQ=255)
                                                                            gTACTTTGATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTg            <  1:1481003/100‑1 (MQ=255)
                                                                             tcttccgATCTGGTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTgg           <  1:3615244/94‑2 (MQ=255)
                                                                                  gatcttgttgATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTGATTCTg      <  1:2131804/96‑1 (MQ=255)
                                                                                   gATTTGTTGATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTGATTCTgg     <  1:1865132/100‑2 (MQ=255)
                                                                                      ttgttgATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTGATTCTGATGt  <  1:3821895/100‑1 (MQ=255)
                                                                                      ttgttgATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTGATTCTGATGt  <  1:3820506/100‑1 (MQ=255)
                                                                                      ttgttgATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTGATTCCGATGt  <  1:1832095/100‑1 (MQ=255)
                                                                                      ttgttgATGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAATATTCTTTGAGGAGGTTGATTCTGATGt  <  1:5426865/100‑1 (MQ=255)
                                                                                      ctgttgGTGTGTTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTGATTCTGATGt  <  1:2672052/99‑1 (MQ=255)
                                                                                                |                                                                                         
GCTAGTTGACGTTGTGCTAGTTTTGTTTAAGTTGACCGAAGATGGCGTTGTGCTTTGTGAAGTGTTATTTGATGCAGTACTTTGATTTGTTGATGTATTAATTGGTTGTTCTGTACTTGAAGTTGAAGCTACAGATTTAGTATCAGAACTTGATGTAGTATTCTTTGAGGATGTTGATTCTGATGT  >  NC_007793/2817499‑2817684

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑