| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,763,955 | C→T | intergenic (‑62/‑133) | SAUSA300_RS14195 ← / → SAUSA300_RS14200 | sulfite reductase subunit alpha/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,763,955 | 0 | C | T | 100.0% | 30.5 / NA | 13 | intergenic (‑62/‑133) | SAUSA300_RS14195/SAUSA300_RS14200 | sulfite reductase subunit alpha/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (0/13); total (0/13) | |||||||||||
TTAGATGTATTTAATTTCAAATGTTTTCACCTCAATAAACTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTCAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTCTGATAGTTATACTTGCAAATATTTACAACCTTCATGTTGCTTG > NC_007793/2763874‑2764046 | ttAGATGTATTTAATTTCAAATGTTTTCACCTCAATAAACTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAAtatgtatg < 1:5104297/100‑1 (MQ=255) tAGATGTATTTAATTTCAAATGTTTTCACCTCAATAAACTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAAtatgtatga < 1:3956258/100‑2 (MQ=255) gATGTATTTAATTTCAAATGTTTTCACCTCAATAAACTTGAAATAGATGATTGACTCTTTTTTTTATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATGGt < 1:4486480/100‑1 (MQ=255) tCAATAAACTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGCTGTGTCt < 1:1702690/100‑1 (MQ=255) cAATAAACTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTCTg < 1:5018680/100‑1 (MQ=255) aaTAAACTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTcggg < 1:1343784/100‑4 (MQ=255) aTAAACTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTCTGAt < 1:2866266/100‑1 (MQ=255) aTAAACTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTCTGAt < 1:3534015/100‑1 (MQ=255) aTAAACTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTCTGAt < 1:850796/100‑1 (MQ=255) aaaCTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTCTGATAg < 1:1733086/100‑1 (MQ=255) tttttATCGATAGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATAGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTCTGATAGTTATACTTGCAAATATTTACAACCtt < 1:2601483/100‑1 (MQ=255) aTAGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTCTGATAGTTATACTTGCAAATATTTACAACCTTCATGTTGCt < 1:3485573/100‑1 (MQ=255) aGTTTAGTTAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTCTGATAGTTATACTTGCAAATATTTACAACCTTCATGTTGCTTg < 1:3248099/100‑1 (MQ=255) | TTAGATGTATTTAATTTCAAATGTTTTCACCTCAATAAACTTGAAATAGATGATTGACTC‑TTTTTTTATCGATAGTTTAGTCAATTTTTTAATATGTATGGTATAAATTAAAACAAACTTGAGTTGTGTCTGATAGTTATACTTGCAAATATTTACAACCTTCATGTTGCTTG > NC_007793/2763874‑2764046 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |