| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,478,750 | T→C | P3109P (CCA→CCG) | SAUSA300_RS07235 ← | hyperosmolarity resistance protein Ebh |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,478,750 | 0 | T | C | 100.0% | 12.3 / NA | 6 | P3109P (CCA→CCG) | SAUSA300_RS07235 | hyperosmolarity resistance protein Ebh |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (0/6); total (0/6) | |||||||||||
GCAGCATGATTTTGAGCAGCATTAATTTGTTGCGTGAAATTATTTTGTTGTGCTTGGTTTAAGTTAGATGCACCATGTAATGTTGTTAACGCTGGCTGTCTATCTAATGTTAAACCTTGACGTGCTGTATTTAATTGATCCTTAGCTTGGTTTGCCTCTGTC > NC_007793/1478658‑1478819 | gcagcaTGATTTTGAGCAGCATTAATTTGTTGCGTGAAATTATTTTGTTGTGCTTGGTTTAAGTTAGATGCACCATGTAATGTTGTTAACGCCGGCTGta < 1:2621105/100‑2 (MQ=255) tctgCGTGAAATTATTTTGTTGTGCTTGGTTTAAGTTAGATGCACCATGTAATGTTGTTAACGCCGGCTGTCTATCTAATGTTAAACCTTGACGTGCTgg < 1:233215/98‑2 (MQ=255) gttgCGTGAAATTATTTTGTTGTGCTTGGTTTAAGTTAGATGCACCATGTAATGTTGTTAACGCCGGCTGTCTATCTAATGTTAAACCTTGACGTGCTGt < 1:4387752/100‑1 (MQ=255) gttgCGTGAAATTATTTTGTTGTGCTCGGTTTAAGTTAGATGCACCATGTAATGTTGTTAACGCCGGCTGTCTATCTAATGTTAAACCTTGACGTGCTGt < 1:5490414/100‑1 (MQ=255) tttGTTGTGCTTGGTTTAAGTTAGATGCACCATGTAATGTTGTTAACGCCGGCTGTCTATCTAATGTTAAACCTTGACGTGCTGTATTTAATTGATCCtt < 1:2182758/100‑1 (MQ=255) gTTAGATGCACCATGTAATGTTGTTAACGCCGGCTGTCTATCTAATGTTAAACCTTGACGTGCTGTATTTAATTGATCCTTAGCTTGGTTTGCCTCTGTc < 1:1553633/100‑1 (MQ=255) | GCAGCATGATTTTGAGCAGCATTAATTTGTTGCGTGAAATTATTTTGTTGTGCTTGGTTTAAGTTAGATGCACCATGTAATGTTGTTAACGCTGGCTGTCTATCTAATGTTAAACCTTGACGTGCTGTATTTAATTGATCCTTAGCTTGGTTTGCCTCTGTC > NC_007793/1478658‑1478819 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |