Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_007793 1,215,913 T→C Y306H (TAT→CAT)  SAUSA300_RS06010 → 16S rRNA (cytosine(967)‑C(5))‑methyltransferase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0077931,215,9130TC100.0% 226.3 / NA 80Y306H (TAT→CAT) SAUSA300_RS0601016S rRNA (cytosine(967)‑C(5))‑methyltransferase
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                                                                                           ttttCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATGAGACATAAGCCGgag  <  1:1405178/100‑1 (MQ=255)
                                                                                                  |                                                                                            
AGGGCAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATAT‑AAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAATATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATGAGACATAAGCCGGAG  >  NC_007793/1215816‑1216005

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑