| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 429,073 | C→T | G108D (GGC→GAC) | SAUSA300_RS02020 ← | alkyl hydroperoxide reductase subunit F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 429,073 | 0 | C | T | 99.8% | 3477.4 / NA | 1096 | G108D (GGC→GAC) | SAUSA300_RS02020 | alkyl hydroperoxide reductase subunit F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (10/1084); minor base A (0/2); total (10/1086) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1100 total aligned reads displayed.
TCATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGCCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCAA > NC_007793/428975‑429169 | cATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCa < 1:4315997/100‑1 (MQ=255) cATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCa < 1:4793712/100‑1 (MQ=255) cATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCa < 1:3240041/100‑1 (MQ=255) cATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCa < 1:3194349/100‑1 (MQ=255) cATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCa < 1:5442796/100‑1 (MQ=255) cATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCa < 1:1978024/100‑1 (MQ=255) aTTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCag < 1:5071174/100‑2 (MQ=255) ttaagttaagTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAAt < 1:1323838/100‑1 (MQ=255) taagttaagtGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATg < 1:538459/100‑1 (MQ=255) aagttaagtGCTCGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATgc < 1:3363689/100‑2 (MQ=255) agttaagtGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGcgggctag < 1:2704711/100‑8 (MQ=255) cGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCttt < 1:4368044/100‑1 (MQ=255) cGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCttt < 1:2259184/100‑1 (MQ=255) cATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAgg < 1:1858317/100‑1 (MQ=255) tCAGGACATTTTTGACGCGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAgggg < 1:2430170/100‑3 (MQ=255) tCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAggct < 1:315367/100‑3 (MQ=255) tCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAggcc < 1:275068/100‑3 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGATTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:5911541/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTCGGTGc < 1:1486018/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:1062066/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:1649920/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:422140/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:876707/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:2914994/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:5570487/100‑1 (MQ=255) cAGGACA‑TTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGcg < 1:259031/100‑2 (MQ=255) aGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAggggtg < 1:1540875/100‑5 (MQ=255) aGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAggcgtt < 1:2017669/100‑5 (MQ=255) aGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCa < 1:1212453/100‑1 (MQ=255) aGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCa < 1:2102354/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGcgt < 1:109440/100‑3 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGcct < 1:3923121/100‑3 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGcct < 1:757720/100‑3 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCag < 1:2488460/100‑2 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAc < 1:5312702/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAc < 1:2644166/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAc < 1:4065803/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAc < 1:3280766/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAc < 1:3400821/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTCTAGGTGCAc < 1:3026692/100‑1 (MQ=255) ggACATTGTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCag < 1:4605886/100‑2 (MQ=255) ggACA‑TTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:3682006/100‑1 (MQ=255) ggACA‑TTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:5527072/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAGCTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:2864311/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAggcctggc < 1:2300552/100‑7 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAca < 1:3601385/100‑2 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:5973213/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:4027273/100‑1 (MQ=255) cATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGag < 1:5104027/100‑2 (MQ=255) aTTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTTAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGaaa < 1:4258841/100‑3 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCaat < 1:580222/100‑3 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCAca < 1:2210007/100‑2 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACt < 1:4481913/100‑1 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACt < 1:3971360/100‑1 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACt < 1:720238/100‑1 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACt < 1:3882829/100‑1 (MQ=255) ttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCTATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTa < 1:631125/100‑1 (MQ=255) tGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTac < 1:4552366/100‑2 (MQ=255) cacGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAAccg < 1:2793745/100‑2 (MQ=255) cacGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCt < 1:1449241/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCtcg < 1:5684577/100‑3 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTgc < 1:5613963/100‑2 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTgc < 1:939150/100‑2 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTgc < 1:1263355/100‑2 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:4107873/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:1390970/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:5944971/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAAccaggc < 1:5150024/100‑5 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGtt < 1:526312/100‑2 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGtt < 1:3528283/100‑2 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:5726659/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:815514/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:4718692/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:5013905/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:18079/100‑1 (MQ=255) ttAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGtg < 1:2972797/100‑2 (MQ=255) ttAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTaa < 1:584940/100‑1 (MQ=255) ttAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTaa < 1:2166390/100‑1 (MQ=255) ttAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTaa < 1:2543220/100‑1 (MQ=255) aatgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCt < 1:6027436/100‑1 (MQ=255) aatgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCt < 1:1000749/100‑1 (MQ=255) aatgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCt < 1:4165010/100‑1 (MQ=255) atgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:4428055/100‑1 (MQ=255) atgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:4874720/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGACCCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:3782284/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:3722342/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:518546/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:1578233/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:1689204/100‑1 (MQ=255) aaaTGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGt < 1:2998646/100‑1 (MQ=255) aaTGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGtt < 1:4938881/100‑1 (MQ=255) cTTCTAA‑TTCTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGAcc < 1:4655329/100‑1 (MQ=255) aaTTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAGCTCGTGACCTAATGGacggagc < 1:1923507/100‑7 (MQ=255) tttGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGc < 1:3835705/100‑1 (MQ=255) tttGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGc < 1:2361438/100‑1 (MQ=255) ttGGTCAATGATTGGCTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCa < 1:2070501/100‑1 (MQ=255) ttGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCa < 1:3106864/100‑1 (MQ=255) tGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCag < 1:5219109/100‑2 (MQ=255) tGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCaa < 1:175528/100‑1 (MQ=255) tGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCaa < 1:3439965/100‑1 (MQ=255) | TCATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTTAATTTGGCCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCAA > NC_007793/428975‑429169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |