Predicted mutation
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RA	NC_007793	76,319	C→T	A17A (GCC→GCT)	SAUSA300_RS00345 →	transposase

Read alignment evidence...
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*	NC_007793	76,319	0	C	T	96.5%	120.3 / ‑2.9	58	A17A (GCC→GCT)	SAUSA300_RS00345	transposase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/2);  new base T (1/55);  total (1/57)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.54e-01

ATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGT  >  NC_007793/76285‑76415                                   |                                                                                                 ataAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACgtgg                                 <  1:4316434/100‑1 (MQ=17)  taAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACgtggt                                <  1:4815803/100‑1 (MQ=17)  taAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACgtggt                                <  1:3672364/100‑1 (MQ=17)  taAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACgtggg                                <  1:105751/100‑2 (MQ=17) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑