| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 5,010 | C→G | P358A (CCT→GCT) | SAUSA300_RS00025 → | DNA recombination protein RecF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 5,010 | 0 | C | G | 99.7% | 1053.7 / ‑5.4 | 348 | P358A (CCT→GCT) | SAUSA300_RS00025 | DNA recombination protein RecF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (332/15); minor base A (1/0); total (333/15) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 348 total aligned reads displayed.
CGTCAAACGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACCCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAATTATGGTG > NC_007793/4914‑5106 | agccAAACGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTa > 1:4193162/4‑100 (MQ=255) cAAGCGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAAt > 1:1430869/1‑100 (MQ=255) cAAACGCATTTATTAAGTACTATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAAt > 1:2118185/1‑100 (MQ=255) cAAACGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAAt > 1:1714471/1‑100 (MQ=255) aaaCGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAAtt > 1:3819831/1‑100 (MQ=255) aaaCGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAAtt > 1:2345455/1‑100 (MQ=255) aaCGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTg > 1:5978976/1‑100 (MQ=255) aaCGCATTTATTAACTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTg > 1:830241/1‑100 (MQ=255) tattaAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTAt > 1:4733522/1‑100 (MQ=255) aCGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAg > 1:442129/1‑100 (MQ=255) gATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGt > 1:2512287/1‑100 (MQ=255) aTTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGta < 1:5599010/100‑2 (MQ=255) ttCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGa > 1:5185676/1‑100 (MQ=255) ttCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGa > 1:3680911/1‑100 (MQ=255) ttCAGCATAAAGAACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAAGCAAGGTGa > 1:4638052/1‑100 (MQ=255) tCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGag < 1:1599551/100‑2 (MQ=255) tCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaa > 1:132839/1‑100 (MQ=255) tCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaa > 1:4516480/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGtagat > 1:3511618/1‑96 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTgggg > 1:283645/1‑97 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:3597130/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:3385443/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:496341/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:4134689/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:3305151/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:4309539/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:4571211/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:3243054/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:5408796/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:624373/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:1624192/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:5757047/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:5886711/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:1819401/1‑100 (MQ=255) aGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTGGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAAt > 1:2949342/1‑100 (MQ=255) aGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAGCGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAAt > 1:5495333/1‑100 (MQ=255) aGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAAt > 1:514201/1‑100 (MQ=255) aGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAAt > 1:4481089/1‑100 (MQ=255) aGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGGATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAAt > 1:700210/1‑100 (MQ=255) aaaGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATaa > 1:1228524/1‑100 (MQ=255) aaaGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATaa > 1:304886/1‑100 (MQ=255) taGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATaaa > 1:3355620/2‑100 (MQ=255) ttGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGTAAGc < 1:2549010/100‑1 (MQ=255) aCGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGa > 1:2678510/1‑100 (MQ=255) aCGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGa > 1:2875426/1‑100 (MQ=255) aCGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGa > 1:3750084/1‑100 (MQ=255) aCGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGCATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGa > 1:5168714/1‑100 (MQ=255) gtGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCAtt > 1:5112688/2‑100 (MQ=255) cTGTAGATGGTATTGATTATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCAtt > 1:2720003/1‑100 (MQ=255) cTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCAtt > 1:3956800/1‑100 (MQ=255) ttAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:5078779/2‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGGTCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:2002908/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAATGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:2240854/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGGAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:1949609/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGGTGGTGACTGCATTGt > 1:2373016/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCagtca > 1:3854029/1‑96 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTgg > 1:2082573/1‑99 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:5630809/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:4908485/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:5222857/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:5903946/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:5293950/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:5449813/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:5949517/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:603991/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:1018680/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:1087897/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:1530905/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:4032267/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:1702886/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:3985687/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:2058640/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:2192685/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:3484428/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:3339020/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:770508/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:2625436/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:3021219/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTCCATTGt > 1:4840525/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGAATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:4977158/1‑100 (MQ=255) tAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTc < 1:3643592/100‑1 (MQ=255) tAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTc < 1:6016222/100‑1 (MQ=255) ttaTGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGAATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCa > 1:1917682/3‑100 (MQ=255) aGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCa > 1:2605048/1‑100 (MQ=255) aGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCa > 1:3920007/1‑100 (MQ=255) aGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCa > 1:653901/1‑100 (MQ=255) aGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCa > 1:4668537/1‑100 (MQ=255) cctGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAg > 1:2450800/3‑100 (MQ=255) aaTGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAg > 1:3133937/2‑100 (MQ=255) aaTGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAg > 1:1043639/2‑100 (MQ=255) aTGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGa > 1:740572/1‑100 (MQ=255) aTGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGa > 1:1138388/1‑100 (MQ=255) aTGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGCAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGa > 1:4071545/1‑100 (MQ=255) tGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGAt > 1:87939/1‑100 (MQ=255) tGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGAt > 1:1892796/1‑100 (MQ=255) ggTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTGTTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATg > 1:5844879/1‑100 (MQ=255) ggTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATg > 1:5707991/1‑100 (MQ=255) tgaaatcatgaaTAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACg > 1:102832/1‑100 (MQ=255) ctAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAATTATgg > 1:3197248/2‑100 (MQ=255) aTAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAATTATgg > 1:5344852/1‑100 (MQ=255) | CGTCAAACGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACCCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAATTATGGTG > NC_007793/4914‑5106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |