Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_007793	865967	866109	143	20 [0]	[0] 1	SAUSA300_RS04180/SAUSA300_RS04185	hypothetical protein/thermonuclease

AACGCTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGATATAGAGACA  >  NC_007793/865867‑865975                                                                                                     |          aaCGCTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGat           >  1:5936263/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGat           >  1:1749327/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGat           >  1:1883596/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGat           >  1:492023/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGat           >  1:2602224/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGat           >  1:3697113/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGat           >  1:3676296/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCAAC‑ACAGat           >  1:5397877/1‑100 (MQ=255)     cTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCag‑atagatcgga       >  1:3097687/1‑96 (MQ=255)     cTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCACAATAGatcgg        >  1:346835/1‑97 (MQ=255)     cTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGatcgga       >  1:1764379/1‑96 (MQ=255)     cTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGatcgga       >  1:1698392/1‑96 (MQ=255)      ccaTCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGatcggaa      >  1:3842066/3‑95 (MQ=255)       aaTCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTTCAC‑ATAGatcggaag     >  1:3317347/1‑94 (MQ=255)       aaTCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGatcggaag     >  1:2981924/1‑94 (MQ=255)       aaTCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGatcggaag     >  1:3950293/1‑94 (MQ=255)       aaTCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGatcggaag     >  1:4976118/1‑94 (MQ=255)          ccAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCTC‑ATAGatcggaagagc  >  1:1885591/1‑91 (MQ=255)          ccAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGatcgggagagc  >  1:142568/1‑91 (MQ=255)          ccAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGatcggaagagc  >  1:4238911/1‑91 (MQ=255)                                                                                                     |          AACGCTAATCCAAAGTAAATTATAAGTTATACATCTCGTTTTTAAATGACAATTTATCCCCGTAAATATTATAAATAATCTTTTCAAATTCCAC‑ATAGATATAGAGACA  >  NC_007793/865867‑865975

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑