| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,614,365 | T→C | Y54C (TAT→TGT) | SAUSA300_RS07970 ← | phosphogluconate dehydrogenase (NADP(+)‑dependent, decarboxylating) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,614,365 | 0 | T | C | 99.8% | 1375.8 / NA | 480 | Y54C (TAT→TGT) | SAUSA300_RS07970 | phosphogluconate dehydrogenase (NADP(+)‑dependent, decarboxylating) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (12/467); total (12/468) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 483 total aligned reads displayed.
CAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCCGCGTGATT > NC_007793/1614268‑1614461 | tcttccgatctGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTCTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTgg < 1:2188269/90‑1 (MQ=255) tccgatctgTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTgg < 1:1011591/92‑1 (MQ=255) tATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTgg < 1:1837935/100‑1 (MQ=255) tATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTgg < 1:5460742/100‑1 (MQ=255) tATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTgg < 1:2214117/100‑1 (MQ=255) tATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTgg < 1:4823347/100‑1 (MQ=255) tATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTgg < 1:4562353/100‑1 (MQ=255) tCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTggcc < 1:4535126/100‑3 (MQ=255) cAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATg < 1:2079349/100‑1 (MQ=255) aTCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTggggcct < 1:3107328/100‑6 (MQ=255) cGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATgcggg < 1:5185327/100‑5 (MQ=255) cGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAata > 1:510212/1‑100 (MQ=255) gTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATgcacat < 1:1086965/100‑6 (MQ=255) ccGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑ccc > 1:984832/1‑100 (MQ=255) ccgatcTTTGCCTGCTTGAACCATTAATAAAATCTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCt < 1:1585499/95‑1 (MQ=255) aGCTTTACCTGCTTGAACCATTGATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCtttt < 1:1673106/100‑1 (MQ=255) aGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCtttt < 1:1751735/100‑1 (MQ=255) tcTTTACGTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTg < 1:308398/99‑1 (MQ=255) gCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCtttta < 1:424876/100‑2 (MQ=255) gCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTg < 1:263471/100‑1 (MQ=255) gCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTg < 1:1041871/100‑1 (MQ=255) tttACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGAt < 1:125591/100‑1 (MQ=255) tttACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGAt < 1:2656840/100‑1 (MQ=255) aCCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGAttct < 1:3870980/100‑1 (MQ=255) ccTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGAttcag < 1:1506701/100‑3 (MQ=255) ttGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCATTTGATTCTTCAAcc < 1:4425400/100‑1 (MQ=255) gAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGAttcttcctggat < 1:3270986/100‑7 (MQ=255) aaCCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCagc < 1:68320/100‑3 (MQ=255) aCCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCAttt < 1:1438345/100‑2 (MQ=255) aCCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTACAACATTa < 1:1356344/100‑1 (MQ=255) ccATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTat < 1:2475580/100‑2 (MQ=255) ttAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAAtt < 1:5402324/100‑2 (MQ=255) ttAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATc < 1:3449790/100‑1 (MQ=255) ttAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATc < 1:3703782/100‑1 (MQ=255) ataaAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAgg < 1:1141899/100‑2 (MQ=255) taaAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAggc < 1:2364473/100‑3 (MQ=255) taaAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAgcc < 1:3750804/100‑3 (MQ=255) taaAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGtt < 1:4135152/100‑1 (MQ=255) taaAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGtt < 1:2139785/100‑1 (MQ=255) tACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACt < 1:4867129/100‑1 (MQ=255) tACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACt < 1:350098/100‑1 (MQ=255) cGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTg < 1:3040060/100‑1 (MQ=255) cGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTg < 1:478507/100‑1 (MQ=255) cGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTg < 1:504830/100‑1 (MQ=255) cGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTg < 1:3790072/100‑1 (MQ=255) cGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTg < 1:27259/100‑1 (MQ=255) tGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAg < 1:2054138/100‑1 (MQ=255) ggTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAgt < 1:1933030/100‑2 (MQ=255) gTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGca < 1:3547296/100‑2 (MQ=255) tttttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCgg < 1:4898631/100‑1 (MQ=255) ttttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGt < 1:593883/100‑1 (MQ=255) ttttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGt < 1:3982996/100‑1 (MQ=255) ttttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGt < 1:5431737/100‑1 (MQ=255) tttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGtt < 1:3356827/100‑1 (MQ=255) tttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGtt < 1:5234216/100‑1 (MQ=255) tttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGtt < 1:5259359/100‑1 (MQ=255) tttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGtt < 1:2417754/100‑1 (MQ=255) tttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGtt < 1:3187085/100‑1 (MQ=255) tttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGtt < 1:2106258/100‑1 (MQ=255) tttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGtt < 1:3593196/100‑1 (MQ=255) tttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGta < 1:2964610/100‑2 (MQ=255) ttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCggcat < 1:2696855/100‑4 (MQ=255) ttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGttt < 1:2301558/100‑2 (MQ=255) ttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTa < 1:916843/100‑1 (MQ=255) ttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTa < 1:5546936/100‑1 (MQ=255) ttCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTa < 1:5131436/100‑1 (MQ=255) tCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGAAGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTaa < 1:3400011/100‑1 (MQ=255) aaaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTCCACTAGATCggaagagca > 1:1557603/1‑93 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCGACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:2019109/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAGTAc < 1:4074771/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:4267465/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:632124/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:1701369/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:3654503/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:5307239/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:130129/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:4484702/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:4687930/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:823344/100‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAAATTCTTCCAATGAACACATTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATAc < 1:3950403/100‑1 (MQ=255) tAACAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATac < 1:5349393/100‑1 (MQ=255) aaCAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATact < 1:3133571/100‑2 (MQ=255) aCAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATacac < 1:4315527/100‑1 (MQ=255) cAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATacacc < 1:1320966/100‑2 (MQ=255) cAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACt < 1:4394097/100‑1 (MQ=255) cAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACt < 1:4614961/100‑1 (MQ=255) cAAATTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACt < 1:4177771/100‑1 (MQ=255) aaaTTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTTCCCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATaccgt < 1:753260/100‑4 (MQ=255) aaTTCTTCCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACtat < 1:2516217/100‑1 (MQ=255) ttcttcCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTatat < 1:551067/100‑1 (MQ=255) cttcCAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATcc < 1:73265/100‑1 (MQ=255) ccAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCcgcg < 1:1404823/100‑1 (MQ=255) cAATGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCcgggc < 1:2332724/100‑4 (MQ=255) aaTGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCCGCGTg < 1:2850876/100‑1 (MQ=255) aTGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCCGCGTgc < 1:4754887/100‑2 (MQ=255) aTGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCCGCGTGa < 1:4646104/100‑1 (MQ=255) tGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCCGCGTGag < 1:118969/100‑2 (MQ=255) tGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCCGCGTGag < 1:4102534/100‑2 (MQ=255) tGAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCCGCGTGAt < 1:1797631/100‑1 (MQ=255) gAACACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCCGCGTGAtt < 1:5010116/100‑1 (MQ=255) | CAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTT‑CCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTTTCACTTGAGCGGTTAAATACAGATACACTATATCCGCGTGATT > NC_007793/1614268‑1614461 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |