| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 429,073 | C→T | G108D (GGC→GAC) | SAUSA300_RS02020 ← | alkyl hydroperoxide reductase subunit F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 429,073 | 0 | C | T | 99.9% | 2737.2 / NA | 865 | G108D (GGC→GAC) | SAUSA300_RS02020 | alkyl hydroperoxide reductase subunit F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (3/860); total (3/862) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
Only 100 of 871 total aligned reads displayed.
CTCATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGCCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCAA > NC_007793/428974‑429169 | cATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCa < 1:264281/100‑1 (MQ=255) cATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCa < 1:706295/100‑1 (MQ=255) cATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCa < 1:4657205/100‑1 (MQ=255) cATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCa < 1:1751307/100‑1 (MQ=255) ttaagttaagTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCact < 1:1634531/100‑3 (MQ=255) taagttaagtGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATg < 1:5113750/100‑1 (MQ=255) agtGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGagt < 1:2553773/100‑3 (MQ=255) cTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTgccctaaa < 1:5497263/100‑8 (MQ=255) cGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCttt < 1:4054791/100‑1 (MQ=255) cATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAgg < 1:4803304/100‑1 (MQ=255) tCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAggcc < 1:5312097/100‑3 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTGGGTGc < 1:5002866/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAggctg < 1:1000208/100‑4 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:1435633/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:3830173/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:1105649/100‑1 (MQ=255) aGGGCATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTTAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCa < 1:3740653/100‑1 (MQ=255) aGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAggggaa < 1:4309463/100‑5 (MQ=255) aGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCa < 1:2419150/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAGCTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAc < 1:598086/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGcca < 1:1881931/100‑3 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCat < 1:2074064/100‑2 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCag < 1:3947787/100‑2 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCag < 1:3668817/100‑2 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCag < 1:784508/100‑2 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAc < 1:1486011/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAc < 1:91081/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAc < 1:2824122/100‑1 (MQ=255) ggACA‑TTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:2242651/100‑1 (MQ=255) ggcATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:1813957/98‑1 (MQ=255) ggcATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:1570754/98‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGccgt < 1:2294846/100‑4 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCagg < 1:4102530/100‑3 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAct < 1:202790/100‑2 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAcc < 1:4931554/100‑2 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAca < 1:4369976/100‑2 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAca < 1:4185866/100‑2 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAca < 1:1310003/100‑2 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:4410677/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:453528/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:4619833/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:1034182/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:3895256/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:537392/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:5551408/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:3658233/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:2177841/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:2771244/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:3143773/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:3256955/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATCGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:1531221/100‑1 (MQ=255) aCATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACgg < 1:1164199/100‑2 (MQ=255) cATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGat < 1:2370600/100‑2 (MQ=255) aTTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGAcc < 1:4590569/100‑1 (MQ=255) aTTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGAcc < 1:3776742/100‑1 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAGGACCACt < 1:5340062/100‑1 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCatc < 1:5252679/100‑3 (MQ=255) ttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACtg < 1:755427/100‑2 (MQ=255) ttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTa < 1:3194531/100‑1 (MQ=255) ttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTa < 1:358339/100‑1 (MQ=255) ttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTa < 1:4133035/100‑1 (MQ=255) tGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTag < 1:5461593/100‑2 (MQ=255) gACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTagg < 1:3114404/100‑3 (MQ=255) gACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAAc < 1:486174/100‑1 (MQ=255) acacGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAAcc < 1:3976755/100‑1 (MQ=255) acGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTg < 1:141212/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTgg < 1:2476131/100‑2 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:3406651/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:5150607/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:4703812/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGtg < 1:3322556/100‑2 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGtg < 1:4743020/100‑2 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGtc < 1:120936/100‑2 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:5430170/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:1963783/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:3448790/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:4252393/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:3298441/100‑1 (MQ=255) ttAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGttg < 1:2583083/100‑3 (MQ=255) aatgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCt < 1:1928992/100‑1 (MQ=255) atgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:1383684/100‑1 (MQ=255) atgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:824814/100‑1 (MQ=255) tgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTaa < 1:1676903/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:3368854/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:5074685/100‑1 (MQ=255) aaaTGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGt < 1:3024690/100‑1 (MQ=255) aTGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGtca < 1:634548/100‑3 (MQ=255) aaCCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGta < 1:4968655/100‑2 (MQ=255) tccgatcttttttAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGAcc < 1:2137785/93‑1 (MQ=255) tccgatcttttcAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCt < 1:3704113/93‑1 (MQ=255) ttAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATggcctgg < 1:3075975/100‑6 (MQ=255) tAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATggcgccgc < 1:1271379/100‑7 (MQ=255) tttGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGc < 1:3546469/100‑1 (MQ=255) tttGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGc < 1:299073/100‑1 (MQ=255) ttGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCa < 1:5199723/100‑1 (MQ=255) ttGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCa < 1:2912973/100‑1 (MQ=255) tGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCat < 1:4488332/100‑2 (MQ=255) tGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCaa < 1:3505871/100‑1 (MQ=255) tGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCaa < 1:2210491/100‑1 (MQ=255) tGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCaa < 1:2712239/100‑1 (MQ=255) | CTCATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGCCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCAA > NC_007793/428974‑429169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |