Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_007793	1905088	1905090	3	1 [0]	[0] 2	SAUSA300_RS09405	RNA polymerase sigma factor SigS

AAATGCCAACATAATTTTAATTAGTTTATTGTGAAATTTCGGTCGATGTGTTAATGATGTTGAAACACCCTAACATCTTCATATAAATTTATTTTAACCA  >  NC_007793/1905091‑1905190 |                                                                                                    aaaTGCCAACATAATTTTAATTAGTTTATTGTGAAATTTCGGTCGATGTGTTAATGATGTTGAAACACCCTAACATCTTCATATAAATTTATTTTAACCa  >  1:216355/1‑100 (MQ=255) aaaTGCCAACATAATTTTAATTAGTTTATTGTGAAATTTCGGTCGATGTGTTAATGATGTTGAAACACCCTAACATCTTCATATAAATTTATTTTAACCa  >  1:670116/1‑100 (MQ=255) |                                                                                                    AAATGCCAACATAATTTTAATTAGTTTATTGTGAAATTTCGGTCGATGTGTTAATGATGTTGAAACACCCTAACATCTTCATATAAATTTATTTTAACCA  >  NC_007793/1905091‑1905190

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑