Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_007793	2317657	2317666	10	2 [0]	[0] 1	SAUSA300_RS11790	transporter

GCACATAAATGTTTAATTCAATAATTTGAATTTTCTGTGTTGGGTCCCTTCGTATAATTTAATAAATACCACTAAACTAAATTAATGAAGTGCCTTATGTAT  >  NC_007793/2317557‑2317658                                                                                                    |   gCACATAAATGTTTAATTCAATAATTTGAATTTTCTGTGTTGGGTCCCTGCGTATAATTTAATAAATACCACTAAACTAAATTAATGAAGTGCCTTATGt    <  1:5316497/100‑1 (MQ=255)   acaTAAATGTTTAATTCAATAATTTGAATTTTCTGTGTTGGGTCCCTTCGTATAATTTAATAAATACCACTAAACTAAATTAATGAAGTGCCTTATGtgg  <  1:647561/100‑3 (MQ=255)                                                                                                    |   GCACATAAATGTTTAATTCAATAATTTGAATTTTCTGTGTTGGGTCCCTTCGTATAATTTAATAAATACCACTAAACTAAATTAATGAAGTGCCTTATGTAT  >  NC_007793/2317557‑2317658

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑