Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_007793	2111826	2111837	12	4 [0]	[0] 1	SAUSA300_RS10690	membrane protein

ATTCCTCATAGCTCCCTTGAACTTGTTTGAGCTTACTCATAAAAAACATTACTAAAAATGCTATTAAGATATGCGTCTTTTGATGTTTATAAGCAAATGT  >  NC_007793/2111726‑2111825                                                                                                    | aTTCCTCATAGCTCCCTTGAACTTGTTTGAGCTTACTCATAAAAAACATTACTAAAAATGCTATTAAGATATGCGTCTTTTGATGTTTATAAGCAAATGt  <  1:3342874/100‑1 (MQ=255) aTTCCTCATAGCTCCCTTGAACTTGTTTGAGCTTACTCATAAAAAACATTACTAAAAATGCTATTAAGATATGCGTCTTTTGATGTTTATAAGCAAATGt  <  1:4146407/100‑1 (MQ=255) aTTCCTCATAGCTCCCTTGAACTTGTTTGAGCTTACTCATAAAAAACATTACTAAAAATGCTATTAAGATATGCGTCTTTTGATGTTTATAAGCAAATGt  <  1:644570/100‑1 (MQ=255) aTTCCTCATAGCTCCCTTGAACTTGTTTGAGCTTACTCATAAAAAACATTACTAAAAATGCTATTAAGATATGCGTCTTTTGATGTTTATAAGCAAATGt  <  1:777978/100‑1 (MQ=255)                                                                                                    | ATTCCTCATAGCTCCCTTGAACTTGTTTGAGCTTACTCATAAAAAACATTACTAAAAATGCTATTAAGATATGCGTCTTTTGATGTTTATAAGCAAATGT  >  NC_007793/2111726‑2111825

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑