| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,623,552 | 2 bp→AA | intergenic (‑58/+1363) | SAUSA300_RS13500 ← / ← SAUSA300_RS13505 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,623,552 | 0 | T | A | 92.5% | 1167.7 / 46.8 | 425 | intergenic (‑58/+1364) | SAUSA300_RS13500/SAUSA300_RS13505 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/29); new base A (7/386); total (10/415) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.24e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | NC_007793 | 2,623,553 | 0 | G | A | 92.5% | 1085.6 / 30.3 | 425 | intergenic (‑59/+1363) | SAUSA300_RS13500/SAUSA300_RS13505 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/29); new base A (7/386); total (10/415) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.24e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 427 total aligned reads displayed.
GTCCGTGTTTAATCACATCATCCACTGGCTCTTCGATCACTTTTCCTGTGTCTGGATTCTTGATTCCTGGTTTACCTGGTACTTTTTCCGTTTGATCTGTGGGTAAGTTTGGATCAAAGAT‑ATCTTTATGACCTTGCGGTATTTTCTCGCCACCGAATTCTGTTAATTCATTAACTGGATCTTTTGTGATTTCTT > NC_007793/2623455‑2623649 || gtgtTTAATCACATCATCCACTGGCTCTTCGATCACTTTTCCTGTGTCTGGATTCTTGATTCCTGGTTTACCTGGTACTTTTTCCGTTTGATCTGTTGGt < 1:6101237/100‑1 (MQ=255) tgtCTAATCACATCATCCACTGGCTCTTCGATCACTTTTCCTGTGTCTGGATTCTTGATTCCTGGTTTACCTGGTACTTTTTCCGTTTGATCTGTTGGTa < 1:3362945/100‑1 (MQ=255) gaggtgttaccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAGGTTTGGATCGAACTC‑ATCttt < 1:2752051/90‑1 (MQ=255) ggtgttaccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTAt < 1:4777519/92‑1 (MQ=255) gtgttaccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATg < 1:800849/93‑1 (MQ=255) taccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCt < 1:6044347/97‑1 (MQ=255) taccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCt > 1:4271044/4‑100 (MQ=255) taccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCt < 1:3732255/97‑1 (MQ=255) accACTTTACCTGTCTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCtt < 1:4934231/98‑1 (MQ=255) gatcTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTg < 1:5689088/97‑1 (MQ=255) ccgatctgccTGTTCCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTGCCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTg < 1:4851680/92‑1 (MQ=255) ccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCttt < 1:5429747/99‑2 (MQ=255) ccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCtta < 1:3925010/99‑2 (MQ=255) ccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTg < 1:342459/99‑1 (MQ=255) ccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTg < 1:4527681/99‑1 (MQ=255) ccACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGGTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTg < 1:6467723/99‑1 (MQ=255) cACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgt < 1:1697731/100‑2 (MQ=255) cACTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTGCGGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgt < 1:1437981/100‑2 (MQ=255) aCTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgtg < 1:3518587/100‑3 (MQ=255) aCTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgtg < 1:4671697/100‑3 (MQ=255) aCTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgtg < 1:472061/100‑3 (MQ=255) aCTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgtg < 1:5107141/100‑3 (MQ=255) aCTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgtg < 1:5176207/100‑3 (MQ=255) aCTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgtg < 1:1086701/100‑3 (MQ=255) cTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTGCTTCTTCTGTACCATCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTgg < 1:6201759/100‑1 (MQ=255) cTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgtgc < 1:4145529/100‑4 (MQ=255) cTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgtgc < 1:4875083/100‑4 (MQ=255) cTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgtga < 1:2499999/100‑4 (MQ=255) cTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTgg < 1:1583371/100‑1 (MQ=255) cTTTACCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTgg < 1:3593524/100‑1 (MQ=255) ttttCCTGTGTCTGGATTCTTGATTCCTGGTTTACCTGGTACTTTTTCCGTTTGATCTGTTGGTAAGTTTGGATCAAAGAT‑ATCTTTATGACCTTGCGGt < 1:5332459/100‑1 (MQ=255) tttaCCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTTCTTCTTCTGTGCCGACAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTgtagt < 1:6241628/100‑5 (MQ=255) tttaCCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGt < 1:5514649/100‑1 (MQ=255) tttaCCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGt < 1:3254365/100‑1 (MQ=255) tttaCCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGt < 1:1227337/100‑1 (MQ=255) tttaCCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGt < 1:2207569/100‑1 (MQ=255) tttaCCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGt < 1:6430940/100‑1 (MQ=255) tttaCCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGt < 1:1549523/100‑1 (MQ=255) tttaCCTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGt < 1:2674912/100‑1 (MQ=255) ttcccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTGGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGtt < 1:2851823/97‑2 (MQ=255) ttaccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTGAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGtg < 1:1145539/97‑2 (MQ=255) ttaccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGtg < 1:731075/97‑2 (MQ=255) ttaccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGtc < 1:4038626/97‑2 (MQ=255) ttaccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTa < 1:5941365/97‑1 (MQ=255) ttaccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTa < 1:6296634/97‑1 (MQ=255) ttaccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGAT‑AGAGCTCATCTTTATGACCTTGTGGTa < 1:5216038/97‑1 (MQ=255) ctcttccgatCTGGGTTTTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGtg < 1:2277966/91‑2 (MQ=255) taccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGtgg < 1:2916420/98‑3 (MQ=255) taccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGtgg < 1:696555/98‑3 (MQ=255) accTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTact < 1:5974490/99‑3 (MQ=255) ccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGtggca < 1:2897168/100‑5 (MQ=255) ccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTacta < 1:5547763/100‑4 (MQ=255) ccTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTActt < 1:4651702/100‑1 (MQ=255) cTGTTTCTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTAGTAAGTGTGAATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGtgcttc < 1:1464448/100‑6 (MQ=255) cTGGGTTCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTActtcttcagg < 1:4567196/100‑8 (MQ=255) ggttCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCAcc < 1:1775664/98‑1 (MQ=255) gttCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCg < 1:2392586/99‑1 (MQ=255) gttCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCg < 1:2110634/99‑1 (MQ=255) tCTTAATGCCTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGaa < 1:1022881/100‑1 (MQ=255) ttaatgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAAta < 1:3322699/94‑2 (MQ=255) taatgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAAttg < 1:3179344/95‑2 (MQ=255) taatgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGCCAATTGGGAAGTTTGGATCGAACTT‑ATCTTTATGACCTTGTGGCACTTCTTCTCCACCGAAttg > 1:1368088/6‑99 (MQ=255) aatgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCgcgtcgg < 1:6128391/96‑7 (MQ=255) aatgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAAttgt < 1:5843952/96‑3 (MQ=255) aatgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAAttgt < 1:1295243/96‑3 (MQ=255) atgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATtgtg < 1:1757742/97‑1 (MQ=255) atgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATtgtg < 1:4071765/97‑1 (MQ=255) atgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATtgtg < 1:656334/97‑1 (MQ=255) atgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATtgtg < 1:563884/97‑1 (MQ=255) tgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATtgtgc < 1:1887986/98‑2 (MQ=255) tgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATtgtgc < 1:5354050/98‑2 (MQ=255) tgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgt < 1:6214830/98‑1 (MQ=255) tgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgt < 1:6337805/98‑1 (MQ=255) tgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgt < 1:954039/98‑1 (MQ=255) tgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgt < 1:3273640/98‑1 (MQ=255) tgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgt < 1:2140916/98‑1 (MQ=255) tgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgt < 1:4474094/98‑1 (MQ=255) tgccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgt < 1:4117070/98‑1 (MQ=255) tCCTGGTTTACCTGGTACTTTTTCCGTTTGATCTGTTGGTAAGTTTGGATCAAAGAT‑ATCTTTATGACCTTGCGGTATTTTCTCGCCACCGAATTCTGtt < 1:659467/100‑1 (MQ=255) gccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtg < 1:3481947/99‑2 (MQ=255) gccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtg < 1:5717512/99‑2 (MQ=255) gccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtg < 1:5768567/99‑2 (MQ=255) gccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtg < 1:2730193/99‑2 (MQ=255) gccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtg < 1:4617039/99‑2 (MQ=255) gccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtg < 1:4331094/99‑2 (MQ=255) gccTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTAAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGCCCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtg < 1:5249288/99‑2 (MQ=255) cTGGTTTGCCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtgat < 1:834242/100‑4 (MQ=255) cTGGTTTGCCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtgat < 1:3452844/100‑4 (MQ=255) cTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtgat < 1:4488899/100‑4 (MQ=255) cTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtgat < 1:4976967/100‑4 (MQ=255) cTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAAATgtgtgat < 1:3563119/100‑4 (MQ=255) cTGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGAACGAAGTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtgat < 1:5895957/100‑4 (MQ=255) tGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtgatt < 1:3697402/100‑5 (MQ=255) tGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtgatt < 1:1811688/100‑5 (MQ=255) tGGTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTgtgtgata < 1:530441/100‑5 (MQ=255) gTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGATCGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCGCCGAATTGTGTGATTTc < 1:2332987/100‑1 (MQ=255) gTTTACCTGGTACTTCTTCTGTACCGTCAATTGGTAAGTTTGGAGAGAACTC‑ATCTTTATGACCTTGTGGTACTTCTTCTCCACCGAATTGTGTGATTTc < 1:5083377/100‑1 (MQ=255) tACCTGGTACTTTTTCCGTTTGATCTGTTGGTAAGTTTGGATCAAAGAT‑ATCTTTATGACCTTGCGGTATTTTCTCGCCACCGAATTCTGTTAATTCAtt > 1:3127772/1‑100 (MQ=255) gTACTTTTTCCGTTTGATCTGTTGGTAAGTTTGGATCAAAGAT‑ATCTTTATGACCTTGCGGTATTTTCTCGCCACCGAATTCTGTTAATTCATTAACTgg < 1:2979013/100‑1 (MQ=255) gTACTTTTTCCGTTTGATCTGTTGGTAAGTTTGGATCAAAGAT‑ATCTTTATGACCTTGCGGTATTTTCTCGCCACCGAATTCTGTTAATTCATTAACTgg < 1:1999177/100‑1 (MQ=255) || GTCCGTGTTTAATCACATCATCCACTGGCTCTTCGATCACTTTTCCTGTGTCTGGATTCTTGATTCCTGGTTTACCTGGTACTTTTTCCGTTTGATCTGTGGGTAAGTTTGGATCAAAGAT‑ATCTTTATGACCTTGCGGTATTTTCTCGCCACCGAATTCTGTTAATTCATTAACTGGATCTTTTGTGATTTCTT > NC_007793/2623455‑2623649 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |