Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_007793 571,607 A→G Q16R (CAA→CGA)  SAUSA300_RS02740 → DNA repair protein RadA

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_007793571,6070AG99.7% 894.3 / NA 325Q16R (CAA→CGA) SAUSA300_RS02740DNA repair protein RadA
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  major base G (319/5);  minor base C (1/0);  total (320/5)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01

Only 100 of 325 total aligned reads displayed.

TGTTCAAAGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCAATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATGGAG  >  NC_007793/571534‑571699
                                                                         |                                                                                            
 gTTCAAAGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGGTGGGGAAATGTcc                                                                   >  1:6081577/1‑100 (MQ=255)
 atggggaGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGCTCTCCTAAATGGATGGGGCAATGTcc                                                                   >  1:5012821/7‑100 (MQ=255)
      caGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAAtt                                                              >  1:6021710/2‑100 (MQ=255)
      aaGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAAtt                                                              >  1:4501844/1‑100 (MQ=255)
        cgAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATtgt                                                            >  1:2143895/2‑100 (MQ=255)
         ctaaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGGTGGGGAAATGTCCTAATtgtg                                                           >  1:1237121/3‑100 (MQ=255)
           taGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                         >  1:2653207/2‑100 (MQ=255)
           caGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAACAAAGTGATTTTTGAATGCATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                         >  1:3410099/2‑100 (MQ=255)
           aaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                         >  1:3016763/1‑100 (MQ=255)
           aaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                         >  1:2103121/1‑100 (MQ=255)
           aaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                         >  1:152427/1‑100 (MQ=255)
           aaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                         >  1:4722356/1‑100 (MQ=255)
           aaGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGAGAAATGTCCTAATTGTGgc                                                         >  1:6342025/1‑100 (MQ=255)
            cgTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGgcg                                                        >  1:3354672/2‑100 (MQ=255)
            aGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGGTATCGATATCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTTATTGTGgcg                                                        >  1:6458648/1‑100 (MQ=255)
              tGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTTTTGCGCt                                                      >  1:5453003/1‑100 (MQ=255)
               cctggTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCtt                                                     >  1:5860944/4‑100 (MQ=255)
                caGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTg                                                    >  1:3471264/2‑100 (MQ=255)
                  ggTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGa                                                  >  1:3902349/1‑100 (MQ=255)
                  ggTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGa                                                  >  1:240579/1‑100 (MQ=255)
                  ggTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGa                                                  >  1:5623258/1‑100 (MQ=255)
                  ggTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGa                                                  >  1:3530114/1‑100 (MQ=255)
                  ggTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGa                                                  >  1:2590069/1‑100 (MQ=255)
                   gTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGaa                                                 >  1:1080051/1‑100 (MQ=255)
                    ggCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCtagatcg                                                >  1:5317062/2‑94 (MQ=255)
                     gCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATc                                               >  1:5958687/1‑100 (MQ=255)
                      tactgctGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCa                                              >  1:1453419/7‑100 (MQ=255)
                          tttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTTTCGATCTCCTAAATGGAGGGGGAAATGTCCTTATTGTGGCGCTTGGAATCAAATg                                          >  1:649114/1‑100 (MQ=255)
                          tttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATg                                          >  1:6240836/1‑100 (MQ=255)
                          tttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATg                                          >  1:6392935/1‑100 (MQ=255)
                          tttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATg                                          >  1:5342829/1‑100 (MQ=255)
                          tttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATg                                          >  1:3186399/1‑100 (MQ=255)
                          tctGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATg                                          >  1:2815391/3‑100 (MQ=255)
                           ttGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAACgg                                         >  1:2754107/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAGAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:4941125/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGCATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGGCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:2874261/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCGAATgga                                        >  1:666791/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAGATgga                                        >  1:4144212/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:6267187/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:4475895/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:4683883/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:4886374/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:884799/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:5761498/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:6142643/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:2463532/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:3678356/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:5695244/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:3580599/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:2540154/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:2704394/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:4576888/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAAGgga                                        >  1:1385958/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAAAgga                                        >  1:900375/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCCAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:5192553/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGAGGGTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:4981481/1‑100 (MQ=255)
                            tGGCCAAGAAAAAAGAGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATgga                                        >  1:1751031/1‑100 (MQ=255)
                             ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTATTTGTGGCGCTTGGAATCAAACggag                                       >  1:3139177/1‑100 (MQ=255)
                             ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                       >  1:1162903/1‑100 (MQ=255)
                             ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                       >  1:454162/1‑100 (MQ=255)
                             ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                       >  1:375371/1‑100 (MQ=255)
                             ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                       >  1:421954/1‑100 (MQ=255)
                             ggCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggag                                       >  1:426257/1‑100 (MQ=255)
                              tccAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTTCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATggagg                                      >  1:5281697/2‑100 (MQ=255)
                                        tggTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGa                            >  1:1225987/3‑100 (MQ=255)
                                            gATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGGTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGaaaaa                        >  1:3092/1‑100 (MQ=255)
                                              cccttGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAagc                      >  1:1894719/4‑100 (MQ=255)
                                                 cacggggTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAagcagc                   >  1:2345988/7‑100 (MQ=255)
                                                  tGAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGcc                  >  1:5670379/1‑100 (MQ=255)
                                                   gAATGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCa                 >  1:3055758/1‑100 (MQ=255)
                                                      tGTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAGTTGTTGAAAAAGCAGCCAATc              >  1:4782916/1‑100 (MQ=255)
                                                       gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc             >  1:4039035/1‑100 (MQ=255)
                                                       gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc             >  1:4347943/1‑100 (MQ=255)
                                                       gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc             >  1:6117942/1‑100 (MQ=255)
                                                       gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc             >  1:5373575/1‑100 (MQ=255)
                                                       gTATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc             >  1:2612155/1‑100 (MQ=255)
                                                       ctgtGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc             >  1:2214330/4‑100 (MQ=255)
                                                       ctATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc             >  1:815816/2‑100 (MQ=255)
                                                       ccaTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATcc             >  1:2298650/3‑100 (MQ=255)
                                                        tATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTACATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCt            >  1:1702791/1‑100 (MQ=255)
                                                        tATGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGGGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCt            >  1:3974496/1‑100 (MQ=255)
                                                        gaTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCt            >  1:5874179/2‑100 (MQ=255)
                                                        caTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCt            >  1:4190744/2‑100 (MQ=255)
                                                         gtgtggtgtgCTCATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTa           >  1:3996240/7‑100 (MQ=255)
                                                         ctGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGCTGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTa           >  1:1939032/2‑100 (MQ=255)
                                                         aTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTa           >  1:5433098/1‑100 (MQ=255)
                                                         aTGGCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTa           >  1:1627608/1‑100 (MQ=255)
                                                           ggCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTaaa         >  1:3964165/1‑100 (MQ=255)
                                                           ggCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTaaa         >  1:2042734/1‑100 (MQ=255)
                                                           ggCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATC‑AATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAAc        >  1:4311341/1‑100 (MQ=255)
                                                            gCTTGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGGGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAATAAGCAGCCAATCCTAAAc        >  1:2262493/1‑100 (MQ=255)
                                                              ttGTGGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACAt      >  1:4429528/1‑100 (MQ=255)
                                                              ctgtgGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACAt      >  1:3655735/2‑100 (MQ=255)
                                                               tgtgGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTTTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATg     >  1:5238383/1‑100 (MQ=255)
                                                               tgtgGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATg     >  1:2739497/1‑100 (MQ=255)
                                                               tgtgGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATg     >  1:749868/1‑100 (MQ=255)
                                                               tgtgGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATg     >  1:4789915/1‑100 (MQ=255)
                                                               cgtgGTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATg     >  1:2025155/2‑100 (MQ=255)
                                                                  ggTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATGGAg  >  1:6562534/1‑100 (MQ=255)
                                                                  ggTTATCGATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATGGAg  >  1:5828673/1‑100 (MQ=255)
                                                                         |                                                                                            
TGTTCAAAGGAAAGTGGAGGTGCAATTTTGGCCAAGAAAAAAGTGATTTTTGAATGTATGGCTTGTGGTTATCAATCTCCTAAATGGATGGGGAAATGTCCTAATTGTGGCGCTTGGAATCAAATGGAGGAAATTGTTGAAAAAGCAGCCAATCCTAAACATGGAG  >  NC_007793/571534‑571699

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑