| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,698,243 | T→C | Y568H (TAT→CAT) | SAUSA300_RS13855 → | copper‑exporting P‑type ATPase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,698,243 | 0 | T | C | 99.9% | 1850.8 / NA | 690 | Y568H (TAT→CAT) | SAUSA300_RS13855 | copper‑exporting P‑type ATPase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (674/15); minor base A (1/0); total (675/15) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 693 total aligned reads displayed.
TGTCAATTATGCAAAAGAAAAGCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACTATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAACACATTATGAACGAGAT > NC_007793/2698146‑2698335 | ctATGCAAAAGAAAAGCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATAttg > 1:100354/2‑100 (MQ=255) tATGCAAAAGAAAAGCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCCGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATAttgg > 1:5154029/1‑100 (MQ=255) tGCAAAAGAAAAGCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATAttggtt > 1:6058876/1‑100 (MQ=255) gCAAAAGAAAAGCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATAttggttg > 1:2868778/1‑100 (MQ=255) atTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCt > 1:3417308/1‑100 (MQ=255) ctgccTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAACGGCTg < 1:6267069/96‑1 (MQ=255) aaCTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGAc > 1:3892536/1‑100 (MQ=255) aaCTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGAc > 1:5350299/1‑100 (MQ=255) gcgagaCAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACaa > 1:4505477/3‑100 (MQ=255) caacaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGatat > 1:1369590/1‑100 (MQ=255) tacaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATAtt > 1:3981909/2‑100 (MQ=255) tgaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTa > 1:3130031/3‑100 (MQ=255) gcaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTa > 1:4245787/2‑100 (MQ=255) acaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTa > 1:553251/1‑100 (MQ=255) acaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTa > 1:5379374/1‑100 (MQ=255) acaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTa > 1:4178843/1‑100 (MQ=255) acaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTa > 1:2514139/1‑100 (MQ=255) acaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTa > 1:2216363/1‑100 (MQ=255) caacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAg > 1:4848160/1‑100 (MQ=255) aacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGc > 1:580921/1‑100 (MQ=255) aacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGc > 1:260017/1‑100 (MQ=255) aacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGc > 1:4414473/1‑100 (MQ=255) ctaGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTa > 1:3245775/3‑100 (MQ=255) aaaGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTa > 1:4616076/1‑100 (MQ=255) aaaGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTa > 1:2262050/1‑100 (MQ=255) aaaGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTa > 1:4656084/1‑100 (MQ=255) aaaGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTa > 1:6511265/1‑100 (MQ=255) aaaGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGCAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTa > 1:2557789/1‑100 (MQ=255) aaGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTaa > 1:6397760/1‑100 (MQ=255) aGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAg > 1:5424885/1‑100 (MQ=255) gCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGc > 1:1152653/1‑100 (MQ=255) cAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCa > 1:1308917/1‑100 (MQ=255) ggTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCat > 1:474892/2‑100 (MQ=255) aGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCat > 1:2189566/1‑100 (MQ=255) aGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCat > 1:3686362/1‑100 (MQ=255) cgcaccccATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAtt > 1:946299/7‑100 (MQ=255) cccTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAtt > 1:612084/2‑100 (MQ=255) cccTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAtt > 1:4982326/2‑100 (MQ=255) tatGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAttt > 1:2377648/3‑100 (MQ=255) ccTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAttt > 1:1627982/1‑100 (MQ=255) ccTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAttt > 1:3574285/1‑100 (MQ=255) ccTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGCAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAttt > 1:4343582/1‑100 (MQ=255) acTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAttt > 1:5676435/2‑100 (MQ=255) acTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAttt > 1:3851460/2‑100 (MQ=255) ttGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:2300827/2‑100 (MQ=255) cTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGTTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:6450271/1‑100 (MQ=255) cTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:3005090/1‑100 (MQ=255) cTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:2409567/1‑100 (MQ=255) atGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:5482482/2‑100 (MQ=255) tGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCt > 1:4065028/1‑100 (MQ=255) tGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCt > 1:6004542/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCTTCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3629836/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATTTATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTGGCCTAAGCATATTTCtg > 1:2111398/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5440881/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1680742/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5568810/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1740193/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:840661/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5034500/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1868135/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5630154/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5767107/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5858462/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:15702/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1528241/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1445918/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:6575900/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:6639217/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:697763/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:758811/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3294276/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3058879/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3729307/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3768800/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:2935117/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4024311/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:420635/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:2461800/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4320112/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:2151884/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4690115/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:445896/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4796279/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5218380/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5090950/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4931663/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCta > 1:2711019/1‑99 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGCAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1230007/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGAAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:6344729/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGAACATCACAATTTATTGGTTGGTAACCGAAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCGTGCCAAAGCATATTTAtg > 1:3361173/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGCATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:2035260/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGAATTGAAGCACAGATTGATCATCACCATACACTGGCTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:888947/1‑100 (MQ=255) agCCATGGGATTGAAGCAACGATTTATCATCACCATATATTGGTAGTTAACCGTAAATTAATGGCTCACAATGATATTAGCTTGCCTACGCATATTTCtg > 1:6175265/2‑100 (MQ=255) gCCATGGTATTGAAGCAACGCTTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtga > 1:6218162/1‑100 (MQ=255) gCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtga > 1:3504972/1‑100 (MQ=255) gCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtga > 1:5952995/1‑100 (MQ=255) tGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTgatgat > 1:1927761/1‑100 (MQ=255) ttGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAac > 1:179917/1‑100 (MQ=255) tGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGCAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAaca > 1:1061262/1‑100 (MQ=255) aGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAACACAt > 1:2777107/1‑100 (MQ=255) | TGTCAATTATGCAAAAGAAAAGCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACTATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAACACATTATGAACGAGAT > NC_007793/2698146‑2698335 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |