| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 495,541 | C→T | A226T (GCA→ACA) | SAUSA300_RS02370 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 495,541 | 0 | C | T | 100.0% | 46.9 / NA | 18 | A226T (GCA→ACA) | SAUSA300_RS02370 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (0/18); total (0/18) | |||||||||||
TAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAA > NC_007793/495442‑495636 | taGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGc < 1:2896704/100‑1 (MQ=255) gcgcCTAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTATCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCa < 1:6079734/100‑1 (MQ=255) cgcCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCat < 1:5632989/100‑1 (MQ=255) cgcCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTCCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCat < 1:1154353/100‑1 (MQ=255) gcCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCata < 1:4259172/100‑1 (MQ=255) gcCAAGTGAACCTAGTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCatc < 1:4832765/100‑2 (MQ=255) ccAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCatat < 1:6590373/100‑1 (MQ=255) ggCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCt < 1:3002856/100‑1 (MQ=255) cTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCtag < 1:3538278/100‑2 (MQ=255) aTGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGt < 1:3443844/100‑1 (MQ=255) aaaGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCt < 1:3031973/100‑1 (MQ=255) aaaGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCt < 1:3108210/100‑1 (MQ=255) ttccgatctgTTTCATATTTAATGCCTTTACCATTTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTa < 1:5380846/91‑1 (MQ=255) aaGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTa < 1:5607764/100‑1 (MQ=255) aGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTAt < 1:2125146/100‑1 (MQ=255) aGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTAt < 1:6078514/100‑1 (MQ=255) tcttccgaTCTGTCATTTATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGcag < 1:889202/93‑3 (MQ=255) tcttCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTC‑AAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGt < 1:5908663/97‑1 (MQ=255) tCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTag < 1:6058432/100‑2 (MQ=255) | TAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAA > NC_007793/495442‑495636 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |