Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_007793 2,445,965 G→A intergenic (‑474/+13) SAUSA300_RS12570 ← / ← SAUSA300_RS12575 membrane protein/oxidoreductase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0077932,445,9650GA100.0% 13.8 / NA 7intergenic (‑474/+13)SAUSA300_RS12570/SAUSA300_RS12575membrane protein/oxidoreductase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/7);  total (0/7)

AAATACACTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAGCTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCACCGCTAACACCG  >  NC_007793/2445891‑2446008
                                                                          |                                           
aaaTACACTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCGATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGc                    <  1:6543186/100‑1 (MQ=255)
 aaTACACTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGcg                   <  1:191032/100‑2 (MQ=255)
     cacTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTcc               <  1:424238/100‑1 (MQ=255)
     atcTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACtgt               <  1:4177849/98‑3 (MQ=255)
          cACCGATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCAccac          <  1:87457/100‑3 (MQ=255)
            ccAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCACCGCtc        <  1:5870086/100‑2 (MQ=255)
                  cATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCACCGCTAACACCg  <  1:3400497/100‑1 (MQ=255)
                                                                          |                                           
AAATACACTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAGCTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCACCGCTAACACCG  >  NC_007793/2445891‑2446008

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑