| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,146,812 | T→A | intergenic (‑106/‑130) | SAUSA300_RS10930 ← / → SAUSA300_RS10935 | delta‑hemolysin/accessory gene regulator protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,146,812 | 0 | T | A | 100.0% | 22.0 / NA | 10 | intergenic (‑106/‑130) | SAUSA300_RS10930/SAUSA300_RS10935 | delta‑hemolysin/accessory gene regulator protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (4/6); total (4/6) | |||||||||||
CTGTGATCTAGTTATATTAAAACATGCTAAAAGCATTTATTTTCCAATTTTTCTTAACTAGTCGTTTTTTATTCTTAACTGTAATTTTTTTTATGTTAAAATATTAAATACAAATTACATTTAACAGTTAAGTATTTATTTCCTACAGTTAGGCAATATAATGATAAAAGATTGTACTAA > NC_007793/2146728‑2146907 | ctGTGATCTAGTTATATTAAAACATGCTAAAAGCATTTATTTTCCAATTTTTCTTAACTAGTCGTTTTTTATTCTTAACTGTAAATTTTTTTATGTTaaa > 1:5302482/1‑100 (MQ=255)ctGTGATCTAGTTATATTAAAACATGCTAAAAGCATTTATTTTCCAATTTTTCTTAACTAGTCGTTTTTTATTCTTAACTGTAAATTTTTTTATGTTaaa > 1:5715422/1‑100 (MQ=255) ccAGTTTTTCTTAACTAGTCGTTTTTTATTCTTAACTGTAAATTTTTTTATGTTAAAATATTAAATACAAATTACATTTAACAGTTAAGTATTTATTTcc > 1:3149852/1‑100 (MQ=255) ttCTTAACTAGTCGTTTTTTATTCTTAACTGTAAATTTTTTTATGTTAAAATATTAAATACAAATTACATTTAACAGTTAAGTATTTATTTCCTACAGtt < 1:1007418/100‑1 (MQ=255) ttCTTAACTAGTCGTTTTTTATTCTTAACTGTAAATTTTTTTATGTTAAAATATTAAATACAAATTACATTTAACAGTTAAGTATTTATTTCCTACAGtt < 1:5101965/100‑1 (MQ=255) aaCTAGTCGTTTTTTATTCTTAACTGTAAATTTTTTTATGTTAAAATATTAAATACAAATTACATTTAACAGTTAAGTATTTATTTCCTACAGTTAGGCa < 1:2194716/100‑1 (MQ=255) aaCTAGTCGTTTTTTATTCTTAACTGTAAATTTTTTTATGTTAAAATATTAAATACAAATTACATTTAACAGTTAAGTATTTATTTCCTACAGTTAGGCa < 1:5221803/100‑1 (MQ=255) aGTCGTTTTTTATTCTTAACTGTAAATTTTTTTATGTTAAAATATTAAATACAAATTACATTTAACAGTTAAGTATTTATTTCCTACAGTTAGGCAatat > 1:4742695/1‑100 (MQ=255) gTTTTTTATTCTTAACTGTAAATTTTTTTATGTTAAAATATTAAATACAAATTACATTTAACAGTTAAGTATTTATTTCCTACAGTTAGGCAATATAATg < 1:1434588/100‑1 (MQ=255) gTAAATTTTTTTATGTTAAAATATTAAATACAAATTACATTTAACAGTTAAGTATTTATTTCCTACAGTTAGGCAATATAATGATAAAAGATTGTACTaa < 1:1581705/100‑1 (MQ=255) | CTGTGATCTAGTTATATTAAAACATGCTAAAAGCATTTATTTTCCAATTTTTCTTAACTAGTCGTTTTTTATTCTTAACTGTAATTTTTTTTATGTTAAAATATTAAATACAAATTACATTTAACAGTTAAGTATTTATTTCCTACAGTTAGGCAATATAATGATAAAAGATTGTACTAA > NC_007793/2146728‑2146907 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |