| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 429,073 | C→T | G108D (GGC→GAC) | SAUSA300_RS02020 ← | alkyl hydroperoxide reductase subunit F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 429,073 | 0 | C | T | 99.6% | 2740.7 / NA | 984 | G108D (GGC→GAC) | SAUSA300_RS02020 | alkyl hydroperoxide reductase subunit F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (9/970); minor base G (1/3); total (11/973) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.01e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 988 total aligned reads displayed.
CTCATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGCCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCAA > NC_007793/428974‑429169 | cATTAAGTTAAGTGTTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCa < 1:4867014/100‑1 (MQ=255) ttaagttaagTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGcggtg < 1:327105/100‑5 (MQ=255) ttaagttaagTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCaag < 1:5528544/100‑2 (MQ=255) taagttaagtGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCaagg < 1:452719/100‑3 (MQ=255) ttaagtGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTg < 1:2436132/100‑1 (MQ=255) gtGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTg < 1:3968993/100‑1 (MQ=255) gAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGtgggga < 1:2679038/100‑6 (MQ=255) tccgaTCTGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCttt < 1:6495150/96‑1 (MQ=255) cGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCttt < 1:3210509/100‑1 (MQ=255) ggcATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTa > 1:629303/3‑100 (MQ=255) cAGGGCATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:5611475/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAggggt < 1:2201030/100‑4 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:574788/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:4635423/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:3902045/100‑1 (MQ=255) cAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAAGGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGc < 1:3396833/100‑1 (MQ=255) cAGGACA‑TTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCa < 1:610305/100‑1 (MQ=255) tggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCa < 1:5276544/99‑1 (MQ=255) aGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGcc < 1:5368885/100‑2 (MQ=255) aGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCa < 1:1521031/100‑1 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAGAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTgggg < 1:1381482/100‑4 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGctt < 1:3724419/100‑3 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGcca < 1:4780796/100‑3 (MQ=255) ggACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCAc < 1:5404440/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGccgt < 1:6201132/100‑4 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCagg < 1:3089397/100‑3 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:6338402/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:2034747/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:260277/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:4311580/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:708905/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:1143752/100‑1 (MQ=255) gACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAACGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACg < 1:2782043/100‑1 (MQ=255) cATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACgtg < 1:944784/100‑3 (MQ=255) cATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGAc < 1:59779/100‑1 (MQ=255) ttttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCAc < 1:2891911/100‑1 (MQ=255) tttGACACGTTAAATTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACt < 1:4977431/100‑1 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACt < 1:3151845/100‑1 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACt < 1:4472635/100‑1 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACt < 1:134165/100‑1 (MQ=255) tttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACt < 1:6244447/100‑1 (MQ=255) ttGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTa < 1:862613/100‑1 (MQ=255) tGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTag < 1:674208/100‑2 (MQ=255) tGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTag < 1:1981915/100‑2 (MQ=255) tGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTag < 1:1559996/100‑2 (MQ=255) gACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTaag < 1:1437554/100‑2 (MQ=255) cacGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAAcca < 1:776374/100‑2 (MQ=255) cacGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCt < 1:5925117/100‑1 (MQ=255) cacGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCt < 1:6027145/100‑1 (MQ=255) ccGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTg < 1:2285692/99‑1 (MQ=255) acGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAGCCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTg < 1:4274495/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGATCCTTCTTAATTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCTCTAACCTGt < 1:4580723/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTga < 1:4723372/100‑2 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:4167044/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:2145853/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:5081056/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:5316108/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:3311250/100‑1 (MQ=255) cGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTCAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGt < 1:5808655/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTgat < 1:5465664/100‑3 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:2947394/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:4423782/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:4373321/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:2078172/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:225077/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:3552515/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:2489888/100‑1 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATCGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGtt < 1:5883894/100‑2 (MQ=255) gTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTCGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTa < 1:6430527/100‑1 (MQ=255) ttAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGGCTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTaa < 1:1002949/100‑1 (MQ=255) ttAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTaa < 1:1778395/100‑1 (MQ=255) ttAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTaa < 1:1835690/100‑1 (MQ=255) ttAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTaa < 1:2556681/100‑1 (MQ=255) ttAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTGCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGTTTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGtgg < 1:2333465/100‑3 (MQ=255) aatgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCt < 1:5124936/100‑1 (MQ=255) aatgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCt < 1:3017944/100‑1 (MQ=255) aatgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCt < 1:2713971/100‑1 (MQ=255) aatgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAA‑TTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:2378882/100‑1 (MQ=255) atgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:4037269/100‑1 (MQ=255) atgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:1274724/100‑1 (MQ=255) atgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:4940529/100‑1 (MQ=255) atgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:4225502/100‑1 (MQ=255) atgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATGTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGATGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:5681605/100‑1 (MQ=255) atgaacgTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTa < 1:349293/100‑1 (MQ=255) tgaatgTTTCAAAATGGAATGAACCTCCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTaa < 1:3839783/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCCCTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:6153760/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:3778708/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:4108512/100‑1 (MQ=255) tCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTg < 1:5014859/100‑1 (MQ=255) aaaTGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGt < 1:6582732/100‑1 (MQ=255) tGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTag < 1:5190345/100‑2 (MQ=255) tccgatCTAGTTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTg < 1:1680679/95‑1 (MQ=255) aaCCTTCTAATTTTTTAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTg < 1:190445/100‑1 (MQ=255) tAATTTGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAGCAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATAcc < 1:1727582/100‑1 (MQ=255) tttGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGc < 1:4672162/100‑1 (MQ=255) tttGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGc < 1:1230721/100‑1 (MQ=255) ttGGTCAATGATTGACTGTTTGTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCGGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTGAAACGCGTGACCTAATGGAATACCTGCa < 1:3444814/100‑1 (MQ=255) tGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTCAACTCGTGACCTAATGGAATTCCTGCaa < 1:3639422/100‑1 (MQ=255) tGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCaa < 1:1633215/100‑1 (MQ=255) tGGTCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCaa < 1:1067874/100‑1 (MQ=255) | CTCATTAAGTTAAGTGCTTGAACGACATCAGGACATTTTTGACACGTTAAACTAATGAATGTTTCAAAATGGAATGAACCTTCTAATTTTTTAATTTGGCCAATGATTGACTGTTTTTCTTTAGGTGCACGACCACTAACCTGTAAAATTGCTAAAACAAGTGAGTTAAACTCGTGACCTAATGGAATACCTGCAA > NC_007793/428974‑429169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |