Predicted mutation
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RA	NC_007793	2,085,129	A→T	R24S (AGA→AGT)	SAUSA300_RS10510 →	membrane protein

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*	NC_007793	2,085,129	0	A	T	100.0%	81.9 / NA	30	R24S (AGA→AGT)	SAUSA300_RS10510	membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (29/1);  total (29/1)

TTAGACAAAAGGAAGTAATAAAAACGTGAAATTTAAAACAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGAGAAAGTGAAAAGGGTTGTTTATGGGGCATTAGCATGTTGA  >  NC_007793/2085033‑2085169                                                                                                 |                                         ttAAACAAAAGGAAGTAATAAAAACGTGAAATTTAAAACAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGTGaa                                       >  1:6042072/1‑100 (MQ=255) gtaaaCAAAAGGAAGTAATAAAAACGTGAAATTTAAAACAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGTGaa                                       >  1:1892956/5‑100 (MQ=255)  taaaCAAAAGGAAGTAATAAAAACGTGAAATTTAAAACAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGTGaaa                                      >  1:2265175/4‑100 (MQ=255)  cctgcAAAAGGAAGTAATAAAAACGTGAAATTTAAAACAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGTGaaa                                      >  1:5857496/5‑100 (MQ=255) 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                          tGAAATTTAAAACAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATCAATAATAGTGAAAGTGAAAAGGGTTGTTTATGGGGCAt             <  1:1843548/100‑1 (MQ=255)                                    aaaCAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGTGAAAGTGAAAAGGGTTGTTTATGGGGCATTacacttta    >  1:2198798/1‑93 (MQ=255)                                      acaacTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGTGAAAGTGAAAAGGGTTGTTTATGGGGCATTacactttatt  >  1:5846497/1‑91 (MQ=255)                                                                                                 |                                         TTAGACAAAAGGAAGTAATAAAAACGTGAAATTTAAAACAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGAGAAAGTGAAAAGGGTTGTTTATGGGGCATTAGCATGTTGA  >  NC_007793/2085033‑2085169

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑