| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,034,247 | G→T | intergenic (‑177/‑115) | SAUSA300_RS10245 ← / → SAUSA300_RS10250 | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑alanine ligase/non‑heme ferritin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,034,247 | 0 | G | T | 100.0% | 17.6 / NA | 8 | intergenic (‑177/‑115) | SAUSA300_RS10245/SAUSA300_RS10250 | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑alanine ligase/non‑heme ferritin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (0/8); total (0/8) | |||||||||||
GTGTTTCTAAATTATAATCATTCTCATTTAGATAATTAAAAATGATATTTATTCTCAATTAAATATCGCTAAATGATACATTTTCTCAATTAGAGTGCTAAAATAAGGCATTAAATTATAATTATTATTATTTACAATTGAGAATGAGTTTGTTATACTAAGTTTAATTCAT > NC_007793/2034155‑2034326 | gtgtTTCTAAATTATAATCATTCTCATTTAGATAATTAAAAATGATATTTATTCTCAATTAAATATCGCTAAATGATACATTTTCTCAATTATAGTGCTa < 1:6054054/100‑1 (MQ=255) aaTTATAATCATTCTCATTTAGATAATTAAAAATGATATTTATTCTCAATTAAATATCGCTAAATGATACATTTTCTCAATTATAGTGCTAAAATAAGGc < 1:6283545/100‑1 (MQ=255) aaTTATAATCATTCTCATTTACATAATTAAAAATGATATTTATTCTCAATTAAATATCGCTAAATGATACATTTTCTCAATTATAGTGCTAAAATAAGGc < 1:4372347/100‑1 (MQ=255) ataATCATTCTCATTTAGATAATTAAAAATGATATTTATTCTCAATTAAATATCGCTAAATGATACATTTTCTCAATTATAGTGCTAAAATAAGGCATTa < 1:2488370/100‑1 (MQ=255) ataATCATTCTCATTTAGATAATTAAAAATGATATTTATTCTCAATTAAATATCGCTAAATGATACATTTTCTCAATTATAGTGCTAAAATAAGGCATTa < 1:3643094/100‑1 (MQ=255) taATCATTCTCATTTAGATAATTAAAAATGATATTTATTCTCAATTAAATATCGCTAAATGATACATTTTCTCAATTATAGTGCTAAAATAAGGCATTaa < 1:3271769/100‑1 (MQ=255) taATCATTCTCATTTAGATAATTAAAAATGATATTTATTCTCAATTAAATATCGCTAAATGATACATTTTCTCAATTATAGTGCTAAAATAAGGCATTaa < 1:5421041/100‑1 (MQ=255) aTGATACATTTTCTCAATTATAGTGCTAAAATAAGGCATTAAATTATAATTATTATTATTTACAATTGAGAATGAGTTTGTTATACTAAGTTTAATTCAt < 1:4150363/100‑1 (MQ=255) | GTGTTTCTAAATTATAATCATTCTCATTTAGATAATTAAAAATGATATTTATTCTCAATTAAATATCGCTAAATGATACATTTTCTCAATTAGAGTGCTAAAATAAGGCATTAAATTATAATTATTATTATTTACAATTGAGAATGAGTTTGTTATACTAAGTTTAATTCAT > NC_007793/2034155‑2034326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |