Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_007793	1,992,545	C→T	A200A (GCG→GCA)	SAUSA300_RS09900 ←	hypothetical protein

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_007793	1,992,545	0	C	T	100.0%	33.2 / NA	15	A200A (GCG→GCA)	SAUSA300_RS09900	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (2/13);  total (2/13)

AACACAGGCAGCCACTATACCTAGGTTTGCTGCTCCACTTCCTAGTCCGTTTAAACTAATCGCAGTTGCAATCGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGTATAGACATTAACAACGGATTTAAGTCTGTAAAAGAATG  >  NC_007793/1992473‑1992637                                                                         |                                                                                             aaCACAGGCAGCCACTATACCTAGGTTTGCTGCTCCACTTCCTAGTCCGTTTAAACTAATCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCAtt                                                                   <  1:313627/100‑1 (MQ=255)                   aCCTAGGTTTGCTGCTCCACTTCCTAGTCCGTTTAAACTAATCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCcaca                                                 >  1:1091296/1‑100 (MQ=255)                            atctgctCCCCTTCCTAGTCCGTTTAAACTAAGCGCAGTTTCAATTGCTACTAACTATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGt                                        <  1:6079651/98‑1 (MQ=255)                             gctgctCCACTTCCTAGTCCGTTTAAACTAATCGCAGCTGCAATTGCTACTAACGATATTGGAGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAgat                                       >  1:3894375/1‑98 (MQ=255)                               ttccgatcTTCCTAGTCCGTTTAAACTAATCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGtata                                     <  1:6522317/93‑1 (MQ=255)                                 ctCCACTTCCTAGTCCGTTTAAACTAATCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGTATAgg                                   <  1:850509/100‑2 (MQ=255)                                               ccGTTTAAACTAATCGCAGTTGCAATTGCTACGAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCCCGCTAATAAGTATAGACATTAACAACGGAt                     <  1:612402/100‑1 (MQ=255)                                                  tttAAACTAATCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGTATAGACATTAACAACGGATTTa                  <  1:2038809/100‑1 (MQ=255)                                                  tttAAACTAATCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAAGGCCACACTAATAAGTATAGACATTAACAACGGATTTa                  <  1:4540267/100‑1 (MQ=255)                                                          gaTCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGTATAGACATTAACAACGGATTTAAGTCTGTa          <  1:2957927/99‑1 (MQ=255)                                                          aaTCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTGATAAGTATAGACATTAACAACGGATTTAAGTCTGtg          <  1:3781298/100‑2 (MQ=255)                                                          aaTCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGTATAGACATTAACAACGGATTTAAGTCTgga          <  1:5456698/100‑3 (MQ=255)                                                          aaTCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGTATAGACATTAACAACGGATTTAAGTCTGTa          <  1:1747937/100‑1 (MQ=255)                                                            tCGCAGTTGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGTATAGACATTAACAACGGATTTAAGTCTGTaaa        <  1:5624643/100‑1 (MQ=255)                                                                  ttGCAATTGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGTATAGACATTAACAACGGATTTAAGTCTGTAAAAgaata  <  1:4469198/100‑2 (MQ=255)                                                                         |                                                                                             AACACAGGCAGCCACTATACCTAGGTTTGCTGCTCCACTTCCTAGTCCGTTTAAACTAATCGCAGTTGCAATCGCTACTAACGATATTGGTGTTACCATTAATAATGAAAATGCCACACTAATAAGTATAGACATTAACAACGGATTTAAGTCTGTAAAAGAATG  >  NC_007793/1992473‑1992637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑