| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_007793 | 1,863,084 | T→G | K114Q (AAA→CAA) | SAUSA300_RS09220 ← | cell division protein FtsK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_007793 | 1,863,084 | 0 | T | G | 99.7% | 845.3 / NA | 317 | K114Q (AAA→CAA) | SAUSA300_RS09220 | cell division protein FtsK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base G (34/282); minor base A (1/0); total (35/282) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 326 total aligned reads displayed.
CATTAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTATATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACGTTTTTCACTATAATTTTGTTCTTCAGTTGTTTGATTTCTTCTACGGCGATGTCGTTTTTGTGAACGAGAATCGTGGCTTTGTTTGCGATAGTCTCGA > NC_007793/1862985‑1863178 | ttAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTATATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACgttgtt < 1:2889934/100‑1 (MQ=255) ttAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTATATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACgttgtt < 1:5453690/100‑1 (MQ=255) ttAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTATATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACgttgtt < 1:2249097/100‑1 (MQ=255) tAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTATATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACGTTGTTc < 1:5846008/100‑1 (MQ=255) tAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTATATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACGTTGTTc < 1:3099146/100‑1 (MQ=255) tAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTATATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACGTTGTTc < 1:5911949/100‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |