Predicted mutation
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*	NC_007793	1,672,339	0	C	G	100.0%	162.5 / NA	62	V22L (GTT→CTT)	SAUSA300_RS08300	RNA polymerase sigma factor SigA
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base G (0/62);  total (0/62)

CAGAGTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTC  >  NC_007793/1672246‑1672435                                                                                              |                                                                                                 cAGAGTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGCCCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAAGAtctga                                                                                            <  1:3146945/100‑3 (MQ=255)   gagTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAAGATCTTCta                                                                                          <  1:2712430/100‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑