| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 5,010 | C→G | P358A (CCT→GCT) | SAUSA300_RS00025 → | DNA recombination protein RecF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 5,010 | 0 | C | G | 99.7% | 867.4 / ‑5.9 | 328 | P358A (CCT→GCT) | SAUSA300_RS00025 | DNA recombination protein RecF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (314/12); minor base A (1/0); total (316/12) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
TCAAACGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACCCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAATTATGGTG > NC_007793/4916‑5106 | gcaaCGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAAt > 1:3448926/3‑100 (MQ=255) cAAACGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTACAt > 1:1590839/1‑100 (MQ=255) cAAACGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAAt > 1:6034253/1‑100 (MQ=255) cAAACGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAAt > 1:656608/1‑100 (MQ=255) aaCGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAACGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTCGATGGTATTGATCATGAAATCATGGATAACGCTAAAtcg > 1:4933403/1‑98 (MQ=255) aaCGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTg > 1:947799/1‑100 (MQ=255) aaCGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTg > 1:2474986/1‑100 (MQ=255) aaGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAAt > 1:6339146/1‑100 (MQ=255) aCGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAg > 1:1453411/1‑100 (MQ=255) aTTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTg > 1:754429/1‑100 (MQ=255) aTTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTg > 1:4150924/1‑100 (MQ=255) aTTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTg > 1:4573925/1‑100 (MQ=255) ttCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGa > 1:1758631/1‑100 (MQ=255) ttCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGa > 1:685354/1‑100 (MQ=255) tCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaa > 1:6490858/1‑100 (MQ=255) tCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaa > 1:267130/1‑100 (MQ=255) tCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCCGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaa > 1:680762/1‑100 (MQ=255) tCAGCATAAAGAACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGGGaa > 1:5219862/1‑100 (MQ=255) acAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaa > 1:2410703/2‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATTATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:5382765/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:4004879/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:3792384/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:373843/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:4076012/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:4356653/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:4502835/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:4642451/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:5046137/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:5655760/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:6296578/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:6375039/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:217785/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:126733/1‑100 (MQ=255) cAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGaaa > 1:1152847/1‑100 (MQ=255) aGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAAt > 1:1633849/1‑100 (MQ=255) aGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAAt > 1:4770703/1‑100 (MQ=255) aGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAAt > 1:575249/1‑100 (MQ=255) aaaGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAGCGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATaa > 1:5471035/1‑100 (MQ=255) taGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATaaa > 1:585326/2‑100 (MQ=255) gTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGGATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGt > 1:6150281/1‑100 (MQ=255) aCAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTaa > 1:1021457/1‑100 (MQ=255) aaaaCATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAAc > 1:2825204/2‑100 (MQ=255) aaCATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAg < 1:3489156/100‑1 (MQ=255) gtggTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAg > 1:1784390/4‑100 (MQ=255) cccACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGa > 1:3856625/3‑100 (MQ=255) cacccTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGa > 1:323773/5‑100 (MQ=255) cTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGACAGcagatcg > 1:3531938/1‑94 (MQ=255) aCGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAgatcggaaga > 1:4197065/1‑91 (MQ=255) aCGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGa > 1:25474/1‑100 (MQ=255) tCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCAt > 1:5679759/1‑100 (MQ=255) cTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCAtt > 1:1547082/1‑100 (MQ=255) cTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCAtt > 1:1919/1‑100 (MQ=255) cTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCAtt > 1:1950743/1‑100 (MQ=255) cTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCAtt > 1:2130039/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAGATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:3922657/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTCTCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:5094404/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAACGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:4538294/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:2979605/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:2261646/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:167561/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:6417744/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:5621124/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:562397/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:6389689/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:1847955/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:3663109/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:2871431/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:318853/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:3419735/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:4444599/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:3316586/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:6517216/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:2327561/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:4296162/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:4218098/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGCGAAATTATAAAGCAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:4919858/1‑100 (MQ=255) gTAGATGGCATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGt > 1:2567788/1‑100 (MQ=255) tAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTGTCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTc < 1:1123037/100‑1 (MQ=255) tAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTc < 1:3272444/100‑1 (MQ=255) aGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCa > 1:5920638/1‑100 (MQ=255) aTGGTATTGATCATGAGATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGa > 1:895640/1‑100 (MQ=255) aTGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGAAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGa > 1:106728/1‑100 (MQ=255) ggTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATg > 1:3946314/1‑100 (MQ=255) ggTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATg > 1:2066671/1‑100 (MQ=255) ggTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATg > 1:2190413/1‑100 (MQ=255) gTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGt < 1:5287877/100‑1 (MQ=255) aTTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTaa > 1:5888444/1‑100 (MQ=255) aTTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTaa > 1:4489155/1‑100 (MQ=255) tcctgaaatcatgaaTAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAaacaac > 1:487082/4‑100 (MQ=255) acatgaaatcatgaaTAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAaacaac > 1:3060625/2‑100 (MQ=255) atgaaatcatgaaTAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAacac < 1:1297283/100‑1 (MQ=255) tgaaatcatgaaTAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACg > 1:3578734/1‑100 (MQ=255) gaaatcatgaaTAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACgg > 1:4125287/1‑100 (MQ=255) gaatcatgaaTAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACGCGGa > 1:4394724/2‑100 (MQ=255) catgaaTAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAAt > 1:6178047/1‑100 (MQ=255) catgaaTAACGCTAAATTGCATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAacaacaagatcgga > 1:3097303/1‑92 (MQ=255) aTAACGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAATTATgg > 1:853164/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTTACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAATTATGGTg > 1:5514110/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAATTATGGTg > 1:2024479/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAATTATGGTg > 1:2933986/1‑100 (MQ=255) | TCAAACGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACCCTAAATTGTATCGTATTAATCAAGGTGAAATTATAAAGTAACAGAAAGCGATGGTGACTGCATTGTCAGATGTAAACAACACGGATAATTATGGTG > NC_007793/4916‑5106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |