Predicted mutation
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RA	NC_007793	1,666,644	C→A	V86L (GTA→TTA)	SAUSA300_RS08275 ←	zinc ABC transporter ATP‑binding protein

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*	NC_007793	1,666,644	0	C	A	100.0%	131.7 / NA	46	V86L (GTA→TTA)	SAUSA300_RS08275	zinc ABC transporter ATP‑binding protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (0/46);  total (0/46)

GAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCTAGAA  >  NC_007793/1666552‑1666733                                                                                             |                                                                                          gAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCtt                                                                                    <  1:2644357/100‑1 (MQ=255)                                  aacaacTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCa                                                   <  1:4766660/100‑1 (MQ=255)                                  aacaacTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCa                                                   <  1:4600248/100‑1 (MQ=255)                                         tcttTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCtt                                            <  1:4042538/100‑1 (MQ=255)                                         tcttTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCta                                            <  1:768099/100‑2 (MQ=255)                                         tcttTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCta                                            <  1:130300/100‑2 (MQ=255) 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                                              gatcTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTcaacaa                                      <  1:387412/97‑1 (MQ=255)                                                atcTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACaaa                                     <  1:4158087/98‑1 (MQ=255)                                                    tGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACaaaaagc                                 <  1:1170891/100‑3 (MQ=255)                                                         ggAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTcacc                            <  1:1040825/100‑1 (MQ=255)                                                         ggAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTcacc                            <  1:2851082/100‑1 (MQ=255)                                                         ggAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTcacc                            <  1:1431079/100‑1 (MQ=255)                                                         ggAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTcacc                            <  1:5010458/100‑1 (MQ=255)                                                          gAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTcacca                           <  1:2567594/100‑1 (MQ=255)                                                           aaaCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTcaccac                          <  1:4807579/100‑1 (MQ=255)                                                           aaaCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAAACTcaccac                          <  1:404361/100‑1 (MQ=255)                                                            aaCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTcaccaga                         <  1:3963459/100‑3 (MQ=255)                                                            aaCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTcaccaca                         <  1:68246/100‑2 (MQ=255)                                                            aaCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACt                         <  1:26242/100‑1 (MQ=255)                                                            aaCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACt                         <  1:715458/100‑1 (MQ=255)                                                            aaCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACt                         <  1:505275/100‑1 (MQ=255)                                                            aaCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTGCAACAAAAATCTCACCACt                         <  1:5027711/100‑1 (MQ=255)                                                            aaCCTGAATAAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTACTTTAATTGATGTTTTCTTATTGTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACt                         <  1:6535026/100‑1 (MQ=255)                                                             aCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACtt                        <  1:4445163/100‑1 (MQ=255)                                                             aCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACtt                        <  1:5127438/100‑1 (MQ=255)                                                             aCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACtt                        <  1:1550504/100‑1 (MQ=255)                                                             aCCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACtg                        <  1:1705047/100‑2 (MQ=255)                                                              ccTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACttg                       <  1:3641418/100‑2 (MQ=255)                                                                tGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTgg                     <  1:1760543/100‑2 (MQ=255)                                                                tGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGt                     <  1:3999842/100‑1 (MQ=255)                                                                 gAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACCAAAATCTCCCCACTTTgaa                    <  1:3608401/100‑3 (MQ=255)                                                                 gAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTa                    <  1:3668614/100‑1 (MQ=255)                                                                 gAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTa                    <  1:4666911/100‑1 (MQ=255)                                                                 gAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTa                    <  1:6263372/100‑1 (MQ=255) 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                                                                 aaTTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTaa                   <  1:2023682/100‑1 (MQ=255)                                                                               tGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCt      <  1:5835846/100‑1 (MQ=255)                                                                                gCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCtt     <  1:3407217/100‑2 (MQ=255)                                                                                   ttttGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCTAGat  <  1:6289213/100‑2 (MQ=255)                                                                                             |                                                                                          GAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCTAGAA  >  NC_007793/1666552‑1666733

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑