Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_007793	243,550	G→A	A209V (GCA→GTA)	SAUSA300_RS01080 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_007793	243,550	0	G	A	100.0%	20.5 / NA	9	A209V (GCA→GTA)	SAUSA300_RS01080	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (2/7);  total (2/7)

TGATGATTATTGCCTTTTAAATCACTCATTCCCTTTAATTCCACCTTTGTTGATGCGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTGGATTATCGTTCGACAACTTACCAGATAAATTATAATAATCAGTGGTA  >  NC_007793/243496‑243642                                                       |                                                                                             tgatgaTTATTGCCTTTTAAATCACTCATTCCCTTTAATTCCACCTTTGTTGATACGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTg                                                 >  1:4249276/1‑100 (MQ=255)  tgtggttattGCCTTTTAAATCACTCATTCCCTTTAATTCCACCTTTGTTGATACGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTgg                                                <  1:4242529/95‑1 (MQ=255)                       cACTCATTCCCTTTAATTCCACCTTTGTTGATACGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTGGATTATCGTTCGACAACTTAcc                           <  1:3857087/100‑1 (MQ=255)                       cACTCATTCCCTTTAATTCCACCTTTGTTGATACGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTGGATTATCGTTCGACAACTTAcc                           <  1:5081009/100‑1 (MQ=255)                                     aaTTCCACCTTTGTTGATACGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTGGATTATCGTTCGACAACTTACCAGATAAATTataat             >  1:2334849/1‑100 (MQ=255)                                               ttgttgATACGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTGGATTATCGTTCGACAACTTACCAGATAAATTATAATAATCAGTggc   <  1:2821170/100‑2 (MQ=255)                                               ttgttgATACGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTGGATTATCGTTCGACAACTTACCAGATAAATTATAATAATCAGTGGt   <  1:3511807/100‑1 (MQ=255)                                                tgttgATACGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTGGATTATCGTTCGACAACTTCCCAGATAAATTATAATAATCAGTGGTa  <  1:1715311/100‑1 (MQ=255)                                                tgttgATACGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTGGATTATCGTTCGACAACTTACCAGATAAATTATAATAATCAGTGGTa  <  1:3212310/100‑1 (MQ=255)                                                       |                                                                                             TGATGATTATTGCCTTTTAAATCACTCATTCCCTTTAATTCCACCTTTGTTGATGCGTTTTTAGGAATATTATATCTACGTTTTAATTGTTTAACGTTTGGATTATCGTTCGACAACTTACCAGATAAATTATAATAATCAGTGGTA  >  NC_007793/243496‑243642

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑