Predicted mutation
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RA	NC_007793	1,458,928	A→C	Y9717D (TAT→GAT)	SAUSA300_RS07235 ←	hyperosmolarity resistance protein Ebh

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_007793	1,458,928	0	A	C	100.0%	82.1 / NA	33	Y9717D (TAT→GAT)	SAUSA300_RS07235	hyperosmolarity resistance protein Ebh
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base C (3/30);  total (3/30)

AGTTGTGCTTTTGCCTGCTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATATTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTGAACTTGTTTATCAACATCTTGTTTCGC  >  NC_007793/1458840‑1459021                                                                                         |                                                                                              aGTTGTGCTTTTGCCTGCTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCta                                                                                    <  1:114638/100‑2 (MQ=255)          cgatctgtcTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCt                                                                           <  1:1776943/92‑1 (MQ=11)             gCCTGCTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTac                                                                        >  1:5682019/1‑99 (MQ=255)                 gCTCATTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGt                                                                    >  1:2233826/1‑100 (MQ=255)                  ttCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGACTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTAGCTGtt                                                                   <  1:295132/99‑1 (MQ=255)                  ctctATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:2461725/100‑1 (MQ=255)                  ctccgtttCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:2125713/95‑1 (MQ=255)                  cTCACTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:1345110/100‑1 (MQ=255)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:917253/100‑1 (MQ=38)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:6234627/100‑1 (MQ=38)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:5726990/100‑1 (MQ=38)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:1332721/100‑1 (MQ=38)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:5380913/100‑1 (MQ=38)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:4484367/100‑1 (MQ=38)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:4291080/100‑1 (MQ=38)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAAGTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:6574651/100‑1 (MQ=255)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTAATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:2153938/100‑1 (MQ=255)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTAATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:2549532/100‑1 (MQ=255)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCATTATGTCCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:3294458/100‑1 (MQ=255)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGGCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:5714781/100‑1 (MQ=16)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCACATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:3358996/100‑1 (MQ=255)                  cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCACATTGTGAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTggt                                                                   <  1:1088332/100‑3 (MQ=11)                  atCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                                   <  1:2441283/99‑1 (MQ=25)                   tCACTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTa                                                                  <  1:5010577/100‑1 (MQ=255)                                            tGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTAGATCggaagagca                                         >  1:3001808/1‑92 (MQ=11)                                                        tATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTg                             <  1:5799885/100‑1 (MQ=12)                                                         aTGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTgt                            <  1:2933021/100‑2 (MQ=255)                                                         aTGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTgt                            <  1:1579682/100‑2 (MQ=255)                                                         aTGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTgg                            <  1:3693483/100‑2 (MQ=255)                                                           gACCTTGTTGAAGTATTTGGTTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTGTAc                          <  1:707889/100‑1 (MQ=255)                                                           gACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTGTAc                          <  1:5364445/100‑1 (MQ=255)                                                                tgttgAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTGTAcacgtt                     <  1:924520/100‑6 (MQ=14)                                                                                   tacGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTGAACTTGTTTATCAACATCTTGTTTCGc  <  1:1599394/98‑1 (MQ=255)                                                                                         |                                                                                              AGTTGTGCTTTTGCCTGCTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATATTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTGAACTTGTTTATCAACATCTTGTTTCGC  >  NC_007793/1458840‑1459021

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑