Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_007793 1,215,913 T→C Y306H (TAT→CAT)  SAUSA300_RS06010 → 16S rRNA (cytosine(967)‑C(5))‑methyltransferase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0077931,215,9130TC100.0% 179.5 / NA 68Y306H (TAT→CAT) SAUSA300_RS0601016S rRNA (cytosine(967)‑C(5))‑methyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (58/10);  total (58/10)

AGGGCAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAATATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATGAGACATAAGCCGG  >  NC_007793/1215816‑1216003
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aGGGCAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTCAAGCTTTTCAacat                                                                                          >  1:4857600/1‑100 (MQ=255)
 gggCAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACatg                                                                                         >  1:1764475/1‑100 (MQ=255)
  ggCAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTTCGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACatga                                                                                        >  1:6645058/1‑100 (MQ=255)
   tacaGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACatgat                                                                                       >  1:3890182/4‑100 (MQ=255)
   gCAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACatgat                                                                                       >  1:442031/1‑100 (MQ=255)
   gCAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACatgat                                                                                       >  1:3728346/1‑100 (MQ=255)
   ccAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACatgat                                                                                       >  1:5991702/2‑100 (MQ=255)
    cAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACatgatg                                                                                      >  1:97249/1‑100 (MQ=255)
    cAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACatgatg                                                                                      >  1:5925320/1‑100 (MQ=255)
    cAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACatgatg                                                                                      >  1:3420117/1‑100 (MQ=255)
        ttGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGAc                                                                                  >  1:4253432/1‑100 (MQ=255)
        ctGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGAc                                                                                  >  1:5998940/2‑100 (MQ=255)
        ccgACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGAc                                                                                  >  1:559038/3‑100 (MQ=255)
               ctCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCt                                                                           >  1:6398710/2‑100 (MQ=255)
                tCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGAcgagatcgg                                                                          >  1:5888927/1‑92 (MQ=255)
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                 cAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATAT‑AAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTAt                                                                        >  1:5294210/1‑100 (MQ=255)
                 cAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATAT‑AAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTAt                                                                        >  1:3280738/1‑100 (MQ=255)
                   tccataCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATg                                                                       >  1:2849323/4‑100 (MQ=255)
                    atatACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGa                                                                      >  1:4449094/1‑100 (MQ=255)
                     tataCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATAT‑AAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATa                                                                    >  1:1925094/1‑100 (MQ=255)
                     gataCATGATCACAAAATAAACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGAt                                                                     >  1:3598174/2‑100 (MQ=255)
                      ataCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATTCGACAAAACCTTATGATa                                                                    >  1:1428470/1‑100 (MQ=255)
                      ataCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATa                                                                    >  1:6138450/1‑100 (MQ=255)
                      ataCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATa                                                                    >  1:5623804/1‑100 (MQ=255)
                       caCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATaa                                                                   >  1:6037177/2‑100 (MQ=255)
                        aCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATaaa                                                                  >  1:2428138/1‑100 (MQ=255)
                        aCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATaaa                                                                  >  1:35794/1‑100 (MQ=255)
                        aCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATaaa                                                                  >  1:6194813/1‑100 (MQ=255)
                        aCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATaaa                                                                  >  1:3382849/1‑100 (MQ=255)
                        aCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATaaa                                                                  >  1:1472973/1‑100 (MQ=255)
                        aCATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATaaa                                                                  >  1:3620071/1‑100 (MQ=255)
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                                       aGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATa                                                   >  1:1881844/1‑100 (MQ=255)
                                                                 aaTTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGAtt                         <  1:4284296/100‑1 (MQ=255)
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                                                                     aCGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACAGACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGgt                     >  1:2231971/1‑100 (MQ=255)
                                                                          tAACAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAAt                >  1:3755760/1‑100 (MQ=255)
                                                                           aaCAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATg               <  1:4558356/100‑1 (MQ=255)
                                                                           aaCAAATATTAAAGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATg               >  1:3665167/1‑100 (MQ=255)
                                                                                     aaaGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATGAGACATaaac     >  1:5452360/1‑98 (MQ=255)
                                                                                     aaaGCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATGAGACATAGGc     >  1:1369761/1‑100 (MQ=255)
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                                                                                        gCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATGAGACATAGGCCgg  <  1:1231381/100‑1 (MQ=255)
                                                                                        gCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATGAGACATAAGCCgg  <  1:4773868/100‑1 (MQ=255)
                                                                                        gCTTTTCAACATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATGAGACATAACCCgg  <  1:5322571/100‑1 (MQ=255)
                                                                                                 |                                                                                          
AGGGCAAGTTGACGCTTCAGATATACATGATCACAAAATAGACTTAATTAATTTTAATATAAAAAAATTACGATTAACAAATATTAAAGCTTTTCAATATGATGCGACAAAACCTTATGATAAAACATACGATAAGATACTTGTTGATGCACCATGTAGCGGATTAGGTGTAATGAGACATAAGCCGG  >  NC_007793/1215816‑1216003

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑