| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 141,817 | G→A | Q212Q (CAG→CAA) | SAUSA300_RS00635 → | siderophore biosynthesis protein SbnF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 141,817 | 0 | G | A | 99.6% | 782.1 / ‑5.8 | 278 | Q212Q (CAG→CAA) | SAUSA300_RS00635 | siderophore biosynthesis protein SbnF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (267/10); total (268/10) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.64e-01 | |||||||||||
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
AGATAAAGTAGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAGATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTGAAGAA > NC_007793/141721‑141913 | ttcccaGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTATTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAg > 1:6026855/6‑100 (MQ=255) aaaGTAGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAg > 1:218091/1‑100 (MQ=255) aaaGTAGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAg > 1:5292082/1‑100 (MQ=255) aaaGTAGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAg > 1:1601352/1‑100 (MQ=255) gTAGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCAt > 1:3278777/1‑100 (MQ=255) gTAGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCAt > 1:5769749/1‑100 (MQ=255) ctAGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCAt > 1:1260221/2‑100 (MQ=255) caGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATc > 1:608811/2‑100 (MQ=255) aGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCt > 1:6117264/1‑100 (MQ=255) aGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCt > 1:3726419/1‑100 (MQ=255) aGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCt > 1:5578846/1‑100 (MQ=255) aGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCt > 1:4745148/1‑100 (MQ=255) tcctcctcgGTACCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCCAATTGAAGCATCTg > 1:4914842/8‑100 (MQ=255) aaaCGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTgg > 1:4165296/1‑100 (MQ=255) aaCGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGGCTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGc > 1:4604074/1‑100 (MQ=255) aaCGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGc > 1:4706540/1‑100 (MQ=255) aaCGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGc > 1:6152954/1‑100 (MQ=255) acgacgGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCa > 1:1552256/1‑100 (MQ=255) gcgGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAAc > 1:3975159/2‑100 (MQ=255) acgGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAAc > 1:535192/1‑100 (MQ=255) acgGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAAc > 1:3442697/1‑100 (MQ=255) tggTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACa > 1:1392749/2‑100 (MQ=255) cgGTATCAAGAAATATTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCaaata < 1:4140150/100‑3 (MQ=255) aTCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTa > 1:913144/1‑100 (MQ=255) aTCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTa > 1:4590748/1‑100 (MQ=255) cAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTaaa > 1:1418155/1‑100 (MQ=255) ctgttgtAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGt > 1:2572412/2‑100 (MQ=255) gttgtAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTg < 1:5626806/100‑1 (MQ=255) tgtAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTgag > 1:3495424/1‑100 (MQ=255) tgtAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTgag > 1:188299/1‑100 (MQ=255) gtAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGACCATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTgaga > 1:4080114/1‑100 (MQ=255) gtAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTgaga > 1:169766/1‑100 (MQ=255) ccggTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGCACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTgaga > 1:4267226/4‑100 (MQ=255) tAACGGAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATa > 1:5017489/1‑100 (MQ=255) aCGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCa > 1:3143622/1‑100 (MQ=255) gaacaaGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGc > 1:1867512/2‑100 (MQ=255) caacaaGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTCAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATgga > 1:5453051/1‑99 (MQ=255) caacaaGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGc > 1:3262381/1‑100 (MQ=255) caacaaGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGc > 1:5039332/1‑100 (MQ=255) acaaGTTGGCGCTAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCaagatcg > 1:5654995/1‑94 (MQ=255) caaGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAga > 1:146663/1‑99 (MQ=255) aaGTTGGCGAGAAGACTTATGAACATTTTGCAAAGCAAATTGAAGCATCGGGCAAACATGCAAATGATGTCGAGATGATACCAGTATACCCATGGCAGtt > 1:6623984/1‑100 (MQ=255) tgatGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGttt > 1:6603843/4‑100 (MQ=255) tcttGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGttt > 1:6488474/3‑100 (MQ=255) ctctGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGCTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGttt > 1:4036503/4‑100 (MQ=255) aGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTATATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCCTGGCAgatc > 1:3879463/1‑97 (MQ=255) aGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGttt > 1:1004203/1‑100 (MQ=255) aGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGttt > 1:2506809/1‑100 (MQ=255) aGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGCAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGttt > 1:4992681/1‑100 (MQ=255) gctGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTg > 1:2826452/3‑100 (MQ=255) cttGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTg > 1:2461601/2‑100 (MQ=255) cttGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTg > 1:1033352/2‑100 (MQ=255) attGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTg > 1:796750/2‑100 (MQ=255) ttGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGa > 1:5811210/1‑100 (MQ=255) tGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGTAAATTGAAGCACCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGaa > 1:2767088/1‑100 (MQ=255) tGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATGCCTGTACACCCATGGCAGTTTGaa > 1:1131367/1‑100 (MQ=255) tGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATgggcagatcgg > 1:2865043/1‑91 (MQ=255) tGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGaa > 1:5703153/1‑100 (MQ=255) tGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGaa > 1:4846070/1‑100 (MQ=255) tGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGaa > 1:2938436/1‑100 (MQ=255) tGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGaa > 1:4639218/1‑100 (MQ=255) tGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGaa > 1:2368031/1‑100 (MQ=255) tGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGaa > 1:3782687/1‑100 (MQ=255) ggCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGTAGTTTGAAc > 1:6374152/1‑100 (MQ=255) ggCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAAc > 1:2156427/1‑100 (MQ=255) ggCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAAc > 1:5938003/1‑100 (MQ=255) ggCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAAc > 1:4878248/1‑100 (MQ=255) ggCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAAc > 1:1997722/1‑100 (MQ=255) ggCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAAc > 1:6270218/1‑100 (MQ=255) gCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACa > 1:2239362/1‑100 (MQ=255) tAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTc > 1:6402745/1‑100 (MQ=255) ctaGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTc > 1:3407548/3‑100 (MQ=255) aaGACTTATGAACATTTTGTACAGCAGATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCa > 1:2657100/1‑100 (MQ=255) aaGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCa > 1:1497363/1‑100 (MQ=255) aaGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCa > 1:4401024/1‑100 (MQ=255) aaGACTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCa > 1:4460016/1‑100 (MQ=255) gcTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAACCATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCAccc > 1:6557945/2‑100 (MQ=255) cTTATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCa > 1:1316058/1‑100 (MQ=255) tATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAg > 1:2714079/1‑100 (MQ=255) tATGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAg > 1:1229072/1‑100 (MQ=255) acgAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGt > 1:5319680/3‑100 (MQ=255) tGAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGtt > 1:3326227/1‑100 (MQ=255) gAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTg > 1:652231/1‑100 (MQ=255) gAACATTTTGTACAGCAAATTGAAGCATATGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTg > 1:6312604/1‑100 (MQ=255) gTACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTCGGcga < 1:5241124/100‑3 (MQ=255) tACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTga < 1:846454/100‑1 (MQ=255) tACAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTga > 1:5282067/1‑100 (MQ=255) gaCAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTga > 1:3704837/2‑100 (MQ=255) caCAGCAAATTGAAGCAGCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTga > 1:6206039/2‑100 (MQ=255) aaCAGCAAATTGAAGCATCTAGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTga > 1:2090275/2‑100 (MQ=255) aCAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTACATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGcaaaa > 1:3074522/1‑96 (MQ=255) aCAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTgaa > 1:1204093/1‑100 (MQ=255) aCAGCAAATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTgaa > 1:6444766/1‑100 (MQ=255) cggcaaATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTgaag > 1:691541/3‑100 (MQ=255) cagcaaATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTgaag > 1:3220213/1‑100 (MQ=255) cagcaaATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTgaag > 1:3005794/1‑100 (MQ=255) cagcaaATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTgaag > 1:1578875/1‑100 (MQ=255) ggcaaATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTgaaga > 1:5512319/2‑100 (MQ=255) agcaaATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTgaaga > 1:5912982/1‑100 (MQ=255) gcaaATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTgaagaa > 1:3646035/1‑100 (MQ=255) | AGATAAAGTAGAAACGACGGTATCAAGAAATGTTGTAGTTAACGAAATGTTACGTCAACAAGTTGGCGATAAGACTTATGAACATTTTGTACAGCAGATTGAAGCATCTGGCAAACATGTAAATGATGTTGAGATGATACCTGTACACCCATGGCAGTTTGAACATGTCATCCAAGTTGATTTGGCTGAAGAA > NC_007793/141721‑141913 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |