| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 125,406 | G→T | intergenic (+85/‑105) | SAUSA300_RS00570 → / → SAUSA300_RS00575 | transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 125,406 | 0 | G | T | 100.0% | 28.9 / NA | 12 | intergenic (+85/‑105) | SAUSA300_RS00570/SAUSA300_RS00575 | transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (11/1); total (11/1) | |||||||||||
AAGGTTTAATTAAAACAATAATTCGAATCATTATGTGGCATGTTAAACAGCTAAATATAAGCTATGCACATTTAACAAGCGGATACTCCTGACGCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGGCAGAGTGTTATACATAAAATGTAAAGAAA > NC_007793/125313‑125499 | aaGGTTTAATTAAAACAATAATTCGAATCATTATGTGGCATGTTAAACAGCTAAATATAAGCTATGCACATTTAACAAGCGGATACTCCTGACTCAATta > 1:3530509/1‑100 (MQ=255) gcctaatTCGAATCATTATGTGGCATGTTAAACAGCTAAATATAAGCTATGCACATTTAACAAGCGGATACTCCTGACTCAATTATAGTATCATTACata > 1:2526303/4‑100 (MQ=255) gCTATGCACATTTAACAAGCGGATACTCCTGACTCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGGCa > 1:3615333/1‑100 (MQ=255) cTATGCACATTTAACAAGCGGATACTCCTGACTCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGACag < 1:1228234/100‑1 (MQ=255) ttGCACATTTAACAAGCGGATACTCCTGACTCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGGCagag > 1:3069158/2‑100 (MQ=255) aTGCACATTTAACAAGCGGATACTCCTGACTCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGGCagag > 1:168123/1‑100 (MQ=255) aTGCACATTTAACAAGCGGATACTCCTGACTCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGGCagag > 1:6212096/1‑100 (MQ=255) aTGCACATTTAACAAGCGGATACTCCTGACTCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAAAAGGCagat > 1:2425130/1‑99 (MQ=255) aTGCACATTTAACAAGCGGATACTCCGGACTCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGAAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGGCagat > 1:3086852/1‑99 (MQ=255) tAACAAGCGGATACTCCTGACTCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGGCAGAGTGTTATACa > 1:4748524/1‑100 (MQ=255) tCCTGACTCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGGCAGAGTGTTATACATAAAATGTaaggaa > 1:3061911/1‑100 (MQ=255) ccTGACTCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGGCAGAGTGTTATACATAAAATGTaacgaaa > 1:929044/1‑100 (MQ=255) | AAGGTTTAATTAAAACAATAATTCGAATCATTATGTGGCATGTTAAACAGCTAAATATAAGCTATGCACATTTAACAAGCGGATACTCCTGACGCAATTATAGTATCATTACATATTGTTTAATCGTTTGGGGTAATGTAATTAAAAGGTAAAATAGGCAGAGTGTTATACATAAAATGTAAAGAAA > NC_007793/125313‑125499 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |