| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,101,310 | G→A | S83S (AGC→AGT) | SAUSA300_RS05410 ← | divalent metal cation transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,101,310 | 0 | G | A | 89.9% | 1189.7 / 63.0 | 519 | S83S (AGC→AGT) | SAUSA300_RS05410 | divalent metal cation transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (19/33); new base A (3/461); total (22/497) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-18 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.29e-01 | |||||||||||
Only 100 of 526 total aligned reads displayed.
TGCAATGATCCAAAAGATTATAGCAATAGGTCTTGATAAATAATGTCGTGTCATTTGAGCTAAGTCCATACCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGAAATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGCCATATTGGGCGCCACCTTGCATTGATGTTATCCAGTTTCCG > NC_007793/1101211‑1101409 | tGATCCAAAAGATTATAGCAATAGGTCTTGATAAATAATGTCGTGTCATTTGAGCTAAGTCCATACCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCATGCTTTg < 1:2193784/100‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:5891546/90‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:4667878/90‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:4853244/90‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:2991958/90‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:2265853/90‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:2231641/90‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:1586072/90‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:1188852/90‑1 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACTGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:6507441/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:5655233/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:3047009/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:2790707/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:3852591/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:406396/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:6190998/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:5483979/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:4188474/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:1994762/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:1072418/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:4794963/92‑3 (MQ=255) gcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGa < 1:5240384/93‑1 (MQ=255) cttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtggtt < 1:5423671/94‑5 (MQ=255) cttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtaggg < 1:5559185/94‑5 (MQ=255) cttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtagga < 1:3149389/94‑5 (MQ=255) cttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGag < 1:3081199/94‑2 (MQ=255) tGATAAATAATGTCGTGTCATTTGAGCTAAGTCCATACCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGAAATa > 1:3614371/1‑100 (MQ=255) tttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGAttg < 1:5783578/98‑3 (MQ=255) tttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGAtta < 1:1805962/98‑3 (MQ=255) tttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGAtta < 1:3944312/98‑3 (MQ=255) atGTCGTGTCATTTGAGCTAAGTCCATACCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGAAATAAGAATTACg < 1:4598007/100‑1 (MQ=255) tgacGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACgg < 1:1130824/97‑2 (MQ=255) ttAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:6370366/99‑1 (MQ=255) cTAAGTCCATACCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGAAATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGcc < 1:1654097/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:3532440/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:4336440/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:3437372/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:4111014/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:1019785/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:1607154/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:2142857/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:130597/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:2750018/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:6094833/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:2493753/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGGAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:3798811/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTGTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:6321818/100‑1 (MQ=255) tAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCa < 1:3760666/100‑1 (MQ=255) aaatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCat < 1:712155/97‑1 (MQ=255) aaatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCat < 1:824628/97‑1 (MQ=255) aatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCata < 1:4032550/98‑1 (MQ=255) aatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCata < 1:2826383/98‑1 (MQ=255) aatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCata < 1:5946143/98‑1 (MQ=255) aatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCata < 1:2072454/98‑1 (MQ=255) aatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCata < 1:1732658/98‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGGGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatag < 1:6112021/99‑2 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:900215/99‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:5389496/99‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:5852156/99‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:6469161/99‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:5576308/99‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:574723/99‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:4714408/99‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:4528698/99‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:339726/99‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatag < 1:4633296/99‑2 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatag < 1:1049190/99‑2 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatag < 1:1673592/99‑2 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatag < 1:4228338/99‑2 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatag < 1:4394564/99‑2 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCataa < 1:1910652/99‑2 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCGTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:5208299/99‑1 (MQ=255) tCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatatc < 1:2956634/100‑2 (MQ=255) tCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATAtt < 1:1856705/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:2470656/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:6069277/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:5997339/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:6136139/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:5692291/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:3363060/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:6583611/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTCACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:2397897/100‑1 (MQ=255) cATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTgg < 1:5437494/100‑1 (MQ=255) aTACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTgct < 1:6253137/100‑3 (MQ=255) tACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTCGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgc < 1:4147700/100‑1 (MQ=255) aCCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGAAATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGCCATATTGGgcg < 1:3305091/100‑1 (MQ=255) aCCAGTTGCTATTCTTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTggggg < 1:4966324/100‑3 (MQ=255) aCCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgct < 1:3689406/100‑2 (MQ=255) aCCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgct < 1:5036641/100‑2 (MQ=255) aCCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgcc < 1:5310511/100‑2 (MQ=255) aCCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgca < 1:2601796/100‑2 (MQ=255) aCCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgca < 1:4305023/100‑2 (MQ=255) ccggTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgctt < 1:1540256/97‑3 (MQ=255) ccagTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgctc < 1:2874245/97‑3 (MQ=255) cagTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTGCTcc < 1:6535535/98‑1 (MQ=255) agTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgctagt < 1:123319/99‑5 (MQ=255) tCCTAATCTCACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGAAATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGCCATATTGGGCGCCACCTTGCaag < 1:3232664/100‑3 (MQ=255) cACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGAAATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGCCATATTGGGCGCCACCTTGCATTGATGTTATc > 1:5171914/1‑100 (MQ=255) cACTGCCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGAAATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGCCATATTGGGCGCCACCTTGCATTGATGTTATc > 1:3180555/1‑100 (MQ=255) aCTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGAAATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGCCATATTGGGCGCCACCTTGCATTGATGTTATcc < 1:1354062/100‑1 (MQ=255) | TGCAATGATCCAAAAGATTATAGCAATAGGTCTTGATAAATAATGTCGTGTCATTTGAGCTAAGTCCATACCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGAAATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGCCATATTGGGCGCCACCTTGCATTGATGTTATCCAGTTTCCG > NC_007793/1101211‑1101409 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |