| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,101,283 | T→A | T92T (ACA→ACT) | SAUSA300_RS05410 ← | divalent metal cation transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,101,283 | 0 | T | A | 94.0% | 4090.2 / 131.4 | 1465 | T92T (ACA→ACT) | SAUSA300_RS05410 | divalent metal cation transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/85); new base A (5/1372); total (8/1457) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.41e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1467 total aligned reads displayed.
AATATCTGTAGCGATAATTGCTAGTTCTGCAATGATCCAAAAGATTATAGCAATAGG‑TCTTGATAAATAATGTCGTGTCATTTGAGCTAAGTCCATACCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGA‑AATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGCCATATTGGGCG > NC_007793/1101184‑1101379 | atatCTGTAGCGATAATTGCTAGTTCTGCAATGATCCAAAAGATTATAGCAATAGG‑TCTTGATAAATAATGTCGTGTCATTTGAGCTAAGTCCATACCTg < 1:4399817/100‑1 (MQ=255) tatCTGTAGCGATAATTGCTAGTTCTGCAATGATCCAAAAGATTATAGCAATAGG‑TCTTGATAAATAATGTCGTGTCATTTGGGCTAAGTCCATACCTGt < 1:4503605/100‑1 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTACTTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtt < 1:2000339/100‑1 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGGCTTATTTAAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGt < 1:1968736/100‑1 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATCCCAGtc < 1:5308868/100‑2 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtt < 1:5183758/100‑1 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtt < 1:2203819/100‑1 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtt < 1:56427/100‑1 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtg < 1:3650053/100‑2 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtg < 1:4304705/100‑2 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtc < 1:6607020/100‑2 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGGGCTAAATCCATACCAGtt < 1:4355043/100‑1 (MQ=255) atCAGTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATCTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtg < 1:415620/100‑2 (MQ=255) aacagTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAAGCCATACCAGtg < 1:5588306/96‑2 (MQ=255) tcagTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtag < 1:12091/97‑3 (MQ=255) tcagTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtag < 1:5534725/97‑3 (MQ=255) tcagTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTg < 1:3085183/97‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACTTAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:3793753/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATGATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:6191979/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATATTTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:4579327/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTTTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:2235047/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:3156522/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:3374335/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:3446316/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:1001216/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:3950059/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:3913766/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:295162/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:2269870/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:4459162/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:2746569/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:512632/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:5481875/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:5752050/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:1807684/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:5813871/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:1670835/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:5891057/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:6059218/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:1515363/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:6098703/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:6342795/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:82269/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:960643/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGGTGCt < 1:4110154/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAAAAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:372082/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAATTCAGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:1739644/99‑1 (MQ=255) agTAGCGATAATTGCTAAATCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGACATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCt < 1:5360355/99‑1 (MQ=255) gTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATTCCAGTTGCTa < 1:1145666/100‑1 (MQ=255) gTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGtccccc < 1:2403552/100‑6 (MQ=255) gTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTa < 1:4011980/100‑1 (MQ=255) gTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTa < 1:6413848/100‑1 (MQ=255) gTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTa < 1:6148188/100‑1 (MQ=255) gTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTa < 1:4191531/100‑1 (MQ=255) gTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTa < 1:1904114/100‑1 (MQ=255) gTAGCGATAATTGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTa < 1:462907/100‑1 (MQ=255) tGCTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAAtctt < 1:5449228/100‑2 (MQ=255) tGCTAATTCTGCAACAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAAtctt < 1:4935223/100‑2 (MQ=255) cTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTAc < 1:2543839/100‑1 (MQ=255) cTAATTCTGCAATAATCCAGAACATAATTGCTACAGG‑CTTATTTAAAAAATGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTAc < 1:6546289/100‑1 (MQ=255) tCTGCAATGATCCAAAAGATTATAGCAATAGG‑TCTTGATAAATAATGTCGTGTCATTTGAGCTAAGTCCATACCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCa < 1:1045729/100‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:26552/90‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:1585609/90‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:4248730/90‑1 (MQ=255) caggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCt < 1:2991958/90‑1 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:479967/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:3296052/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:2059999/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:3599086/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:3843312/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:775944/92‑3 (MQ=255) ggcttatttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCtag < 1:3047009/92‑3 (MQ=255) tttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GAtta < 1:1100696/98‑3 (MQ=255) tttaaaaaaTGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GAtta < 1:3496140/98‑3 (MQ=255) atGACGTGTCATTTGTGCTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACg < 1:1353936/100‑1 (MQ=255) cTAAGTCCATACCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGA‑AATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGcc < 1:2341124/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTGGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATGGcc < 1:5868606/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGAGACTAAG‑ATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:4674683/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:4734536/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:2493753/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:5782615/100‑1 (MQ=255) cTAAATCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGcc < 1:1627972/100‑1 (MQ=255) aaatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCat < 1:321531/97‑1 (MQ=255) aaatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCat < 1:5252029/97‑1 (MQ=255) aaatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCat < 1:6500136/97‑1 (MQ=255) aaatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCat < 1:1295275/97‑1 (MQ=255) aatCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCata < 1:2826383/98‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatat < 1:5926008/99‑1 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatag < 1:700843/99‑2 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCatag < 1:2445699/99‑2 (MQ=255) atCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCataa < 1:877554/99‑2 (MQ=255) tCCATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATAtt < 1:1856705/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:5997339/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:4063902/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:5692291/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:2142727/100‑1 (MQ=255) ccATACCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATAAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTg < 1:1461259/100‑1 (MQ=255) aCCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCTAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgct < 1:5036641/100‑2 (MQ=255) aCCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGTCATACTTTGTAACAGCATAGCAGATAAGCAAGA‑GATTAAGATTACGAATAACAAGGTATAGCCATATTGTgct < 1:6257001/100‑2 (MQ=255) aCCAGTTGCTATTCCTAATCTTACAGCCATACCTTGTAACAGCATAGCAGATCAGCTAGC‑GATTAAGATTACGAATACCAAGGTATAGCCATATTGTgct < 1:5415181/100‑2 (MQ=255) | AATATCTGTAGCGATAATTGCTAGTTCTGCAATGATCCAAAAGATTATAGCAATAGG‑TCTTGATAAATAATGTCGTGTCATTTGAGCTAAGTCCATACCTGTTGCTATTCCTAATCTCACTGTCATGCTTTGAAGTAACATTGCTGATAAACTTGA‑AATAAGAATTACGAATAGCAAAGTATAGCCATATTGGGCG > NC_007793/1101184‑1101379 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |