| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,069,320 | A→G | S463G (AGT→GGT) | purH → | bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/inosine monophosphate cyclohydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,069,320 | 0 | A | G | 99.8% | 2888.5 / NA | 1094 | S463G (AGT→GGT) | purH | bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/inosine monophosphate cyclohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base G (1064/27); minor base C (2/0); total (1067/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1099 total aligned reads displayed.
CAATGATCATGTAGCGTTAGTATCTGATGGATTTTTCCCTATGGGAGATACAGTTGAACTTGCAGCACAACATGGTATAAAGGCAATTATCCAACCGAGTGGTTCGATTAAAGATCAAGATTCAATTGATATGGCTAATAAACATGGTATTGCAATGGTAGTCACAGGCACTCGACATTTTAAACACTAATTTTAAA > NC_007793/1069223‑1069419 | cAATGATCATGTAGCGTTAGTATCTGATGGATTTTTCCCTATGGGAGATACAGTTGAACTTGCAGCACAACATGGTATAAAGGCAATTATCCAACCGGGt > 1:2677777/1‑100 (MQ=255) cATGTAGCGTTAGTATCTGATGGATTTTTCCCTATGGGAGATACAGTTGAACTTGCAGCACAACATGGTATAAAGGCAATTATCCAACCGGGTGGTTCGa > 1:6517136/1‑100 (MQ=255) cATGTAGCGTTAGTATCTGATGGATTTTTCCCTATGGGAGATACAGTTGAACTTGCAGCACAACATGGTATAAAGGCAATTATCCAACCGGGTAGATCgg > 1:1538540/1‑99 (MQ=255) cATGTAGCGTTAGTATCTGATGGATTTCTCCCTATGGGAGATACAGTTGAACTTGCAGCACAACATGGTATAAAGGCAATTATCCAACCGGGTGGTTCGa > 1:5069853/1‑100 (MQ=255) aTGTAGCGTTAGTATCTGATGGATTTTTCCCTATGGGAGATACAGTTGAACTTGCAGCACAACATGGTATAAAGGCAATTATCCAACCGGGTGGTTCGAt > 1:4541356/1‑100 (MQ=255) gTAGCGTTAGTATCTGATGGGTTTTTCCCTATGGGAGATACAGTTGAACTTGCAGCACAACATGGTATAAAGGCAATTATCCAACCGGGTGGTTCGATTa > 1:6287054/1‑100 (MQ=255) 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aCCGGGTGGTTCGATTAAAGATCAAGATTCAATTGATATGGCTAATAAACATGGTATTGCAATGGTAGTCACAGGCACTCGACATTTTAAACACTAAttt > 1:4666869/1‑100 (MQ=255) aCCGGGTGGTTCGATTAAAGATCAAGATTCAATTGATATGGCTAATAAACATGGTATTGCAATGGTAGTCACAGGCACTCGACATTTTAAACACTAAttt > 1:2599359/1‑100 (MQ=255) aCCGGGTGGCTCGATTAAAGATCAAGATTCAATTGATATGGCTAATAAACATGGTATTGCAATGGTAGTCACAGGCACTCGACATTTTAAACACTAAttt > 1:3228915/1‑100 (MQ=255) ccGGGTGGTTCGATTAAAGATCAAGATTCAATTGATATGGCTAATAAACATGGTATTGCAATGGTAGTCACAGGCACTCGACATTTTAAACACTAAtttt > 1:1814336/1‑100 (MQ=255) | CAATGATCATGTAGCGTTAGTATCTGATGGATTTTTCCCTATGGGAGATACAGTTGAACTTGCAGCACAACATGGTATAAAGGCAATTATCCAACCGAGTGGTTCGATTAAAGATCAAGATTCAATTGATATGGCTAATAAACATGGTATTGCAATGGTAGTCACAGGCACTCGACATTTTAAACACTAATTTTAAA > NC_007793/1069223‑1069419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |