| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 973,232 | A→G | N333S (AAC→AGC) | SAUSA300_RS04775 → | beta‑ketoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthase II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 973,232 | 0 | A | G | 99.5% | 523.1 / NA | 190 | N333S (AAC→AGC) | SAUSA300_RS04775 | beta‑ketoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (184/5); total (185/5) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
TAAATGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAACTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGTGCAACAGGTGGAATTGAAGCAATCTTCTCAGCGCTTTCAATTAAAGACTCTAAAGTCGCACC > NC_007793/973136‑973328 | tAAATGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTc > 1:853495/1‑100 (MQ=255)tAAATGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTc > 1:4340671/1‑100 (MQ=255) taaTGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTca > 1:2941166/2‑100 (MQ=255) aaaTGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTca > 1:4004148/1‑100 (MQ=255) aaaTGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTca > 1:4243976/1‑100 (MQ=255) taTGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaa > 1:965409/2‑100 (MQ=255) aaTGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaa > 1:718434/1‑100 (MQ=255) aaTGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaa > 1:4407844/1‑100 (MQ=255) ttGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaac > 1:6280581/2‑100 (MQ=255) gtGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAACCACTTAAAAGTTAGCTcaac > 1:5470349/2‑100 (MQ=255) ctGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTCAAAGTTAGCTcaac > 1:4978468/2‑100 (MQ=255) aTGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaac > 1:4072267/1‑100 (MQ=255) aTGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaac > 1:102994/1‑100 (MQ=255) aTGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaac > 1:4503291/1‑100 (MQ=255) aTGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGAGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaac > 1:6338466/1‑100 (MQ=255) tGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaaca > 1:2256095/1‑100 (MQ=255) tGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaaca > 1:4688922/1‑100 (MQ=255) tGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGCGACTTAAATGACGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaaca > 1:6111507/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:4477427/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:983474/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:3174076/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:4181157/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:142238/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:167619/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:2670995/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:2081331/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:2046994/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:5669687/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTCAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:5797103/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGCGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:3326377/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGAGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:4031356/1‑100 (MQ=255) gCCCATGGTACAAGTACTCCTGCTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTcaacaa > 1:2287135/1‑100 (MQ=255) cccATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAGGTTAGCTCAACaaa > 1:4888847/1‑100 (MQ=255) tcATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACaaaa > 1:6185303/2‑100 (MQ=255) ccATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACaaaa > 1:2151135/1‑100 (MQ=255) cctGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAAt > 1:4336230/3‑100 (MQ=255) ctGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATc > 1:5847993/2‑100 (MQ=255) ctGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATc > 1:3946050/2‑100 (MQ=255) ctGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATc > 1:3040359/2‑100 (MQ=255) aTGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATc > 1:4699431/1‑100 (MQ=255) aTGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATc > 1:4456673/1‑100 (MQ=255) tGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCa > 1:6084770/1‑100 (MQ=255) ttagcAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCaa > 1:5070532/5‑100 (MQ=255) ggTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAATTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCaa > 1:4619662/1‑100 (MQ=255) ggTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGTTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCaa > 1:5135284/1‑100 (MQ=255) ggTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCaa > 1:1041799/1‑100 (MQ=255) ggTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAACTCAACAAAATCaa > 1:4919916/1‑100 (MQ=255) ggTACAAGTACTCCTGTTGGGGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCaa > 1:3203091/1‑100 (MQ=255) aCAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGCAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGa > 1:2453763/1‑100 (MQ=255) aCAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGa > 1:5630365/1‑100 (MQ=255) aCAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGa > 1:1384764/1‑100 (MQ=255) aCAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGa > 1:1607740/1‑100 (MQ=255) ctaGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGAc > 1:2552332/3‑100 (MQ=255) cAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGAc > 1:2645794/1‑100 (MQ=255) aaaGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGAc > 1:5237552/2‑100 (MQ=255) ccaCTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTgg > 1:3484469/3‑100 (MQ=255) cagccacttGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTc > 1:1849299/8‑100 (MQ=255) aCTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTc > 1:4372267/1‑100 (MQ=255) aCTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTc > 1:1943658/1‑100 (MQ=255) aCTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTc > 1:5579611/1‑100 (MQ=255) aCTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTc > 1:3598205/1‑100 (MQ=255) cTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCCAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCa > 1:5034634/1‑100 (MQ=255) tCCTGTCGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCag < 1:3078960/100‑2 (MQ=255) cccTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCac > 1:6297844/2‑100 (MQ=255) ccTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCact > 1:5722790/1‑100 (MQ=255) ccTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCact > 1:1839404/1‑100 (MQ=255) ccTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCact > 1:5882628/1‑100 (MQ=255) ccTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCact > 1:4854917/1‑100 (MQ=255) ccTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCact > 1:6581635/1‑100 (MQ=255) ttGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCactt > 1:5818357/2‑100 (MQ=255) cTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCactt > 1:6365849/1‑100 (MQ=255) cTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCactt > 1:5596633/1‑100 (MQ=255) gTTGGTGACTAAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGCCacttac > 1:2677738/1‑100 (MQ=255) cctGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCacttac > 1:3841634/3‑100 (MQ=255) tGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCacttactt > 1:6038519/1‑100 (MQ=255) tGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCacttactt > 1:3908558/1‑100 (MQ=255) tGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCacttactt > 1:4695450/1‑100 (MQ=255) tGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCacttactt > 1:6632365/1‑100 (MQ=255) tGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCacttactt > 1:2590583/1‑100 (MQ=255) tGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCacttactt > 1:1045009/1‑100 (MQ=255) tGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGGTAGCTCAACAAAATCAATGGCTGGTCacttactt > 1:4825335/1‑100 (MQ=255) tGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGATAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCacttactt > 1:4747388/1‑100 (MQ=255) aggTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCacttactt > 1:3756945/2‑100 (MQ=255) ggTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTg > 1:787763/1‑100 (MQ=255) ggTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTg > 1:2695663/1‑100 (MQ=255) ggTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTg > 1:1803064/1‑100 (MQ=255) gTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTgt < 1:1255491/100‑2 (MQ=255) gTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTgg > 1:3110141/1‑100 (MQ=255) gTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTgg > 1:456579/1‑100 (MQ=255) gTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTgg > 1:43861/1‑100 (MQ=255) gACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGta > 1:4727635/1‑99 (MQ=255) aCTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGTGc < 1:3700654/100‑1 (MQ=255) cTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGTGCa < 1:3817367/100‑1 (MQ=255) gAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGTGCAACAGGTg < 1:3300478/100‑1 (MQ=255) aaGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAGCACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGGGCAACAgatcggaagag > 1:2545745/1‑90 (MQ=255) ggTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGTGCAACAGGTGGAATTGGAGCAATCTTCTCAGCGCttt > 1:6078415/1‑100 (MQ=255) ggTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGTGCAACAGGTGGAATTGAAGCAATCTTCTCAGCGCttt > 1:2518628/1‑100 (MQ=255) tgcagcTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGTGCAACAGGTGGAATTGAAGCAATCTTCTCAGCGCTTTCAAtt > 1:4023104/2‑100 (MQ=255) agcagcTAAACACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGTGCAACAGGTGGAATTGAAGCAATCTTCTCAGCGCTTTCAAtt > 1:4159968/1‑100 (MQ=255) aaaCACTTAAAAGTTAGCTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGTGCAACAGGTGGAATTGAAGCAATCTTCTCAGCGCTTTCAATTAAAGAct > 1:1197716/1‑100 (MQ=255) | TAAATGCCCATGGTACAAGTACTCCTGTTGGTGACTTAAATGAAGTTAAAGCTATTAAAAATACATTTGGTGAAGCAGCTAAACACTTAAAAGTTAACTCAACAAAATCAATGACTGGTCACTTACTTGGTGCAACAGGTGGAATTGAAGCAATCTTCTCAGCGCTTTCAATTAAAGACTCTAAAGTCGCACC > NC_007793/973136‑973328 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |