| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 824,939 | G→A | G332D (GGC→GAC) | SAUSA300_RS04000 → | excinuclease ABC subunit B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 824,939 | 0 | G | A | 99.1% | 309.8 / NA | 116 | G332D (GGC→GAC) | SAUSA300_RS04000 | excinuclease ABC subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (113/2); minor base T (1/0); total (114/2) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
AGATGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGGCGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGGAGACAGAGCGCGTAAACAAGTTTTGGT > NC_007793/824846‑825035 | ttgtGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACgaaga > 1:6067294/4‑100 (MQ=255)acttGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACgatga > 1:2579328/4‑100 (MQ=255) taTGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACgatgat > 1:3038525/2‑100 (MQ=255) gaTGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACgatgat > 1:2260592/1‑100 (MQ=255) gaTGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTCTGACgagatc > 1:5791114/1‑96 (MQ=255) cttGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACgatggt > 1:846782/3‑98 (MQ=255) aaTGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACgatgat > 1:3915801/2‑100 (MQ=255) aaTGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACgagatc > 1:5781774/2‑96 (MQ=255) ctGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACgaagatc > 1:5478525/2‑99 (MQ=255) aTGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGAtt > 1:3889487/1‑100 (MQ=255) tGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTGCATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACgaagatcg > 1:6285190/1‑98 (MQ=255) tGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTg > 1:4279547/1‑100 (MQ=255) tGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTg > 1:3256156/1‑100 (MQ=255) tGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTg > 1:2807884/1‑100 (MQ=255) tGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTg > 1:2694815/1‑100 (MQ=255) tGGGACTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTg > 1:2384741/1‑100 (MQ=255) ggggATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTg > 1:2771951/2‑100 (MQ=255) gggATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTgg > 1:3347386/1‑100 (MQ=255) gggATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTgg > 1:3035244/1‑100 (MQ=255) ggATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGt > 1:4452447/1‑100 (MQ=255) tCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGt > 1:1007362/1‑100 (MQ=255) tCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGt > 1:4664467/1‑100 (MQ=255) tCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGt > 1:2406769/1‑100 (MQ=255) cTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTa > 1:3945196/1‑100 (MQ=255) cTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTa > 1:2864273/1‑100 (MQ=255) cTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTa > 1:598173/1‑100 (MQ=255) cTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTa > 1:6214602/1‑100 (MQ=255) acacccAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTa > 1:3055425/6‑100 (MQ=255) gTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAAt > 1:5548485/1‑100 (MQ=255) ccAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAAtga > 1:4764824/2‑100 (MQ=255) gctACATTTAACTTTGCGACTACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACa > 1:144130/3‑100 (MQ=255) cGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACa > 1:915937/1‑100 (MQ=255) gTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACAt > 1:5279948/1‑100 (MQ=255) tccgcTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGc > 1:6168065/5‑100 (MQ=255) tAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGAGTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCa < 1:4584810/100‑1 (MQ=255) ttGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTc > 1:6581093/1‑100 (MQ=255) ttGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTc > 1:518807/1‑100 (MQ=255) ttGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTc > 1:4813482/1‑100 (MQ=255) tgcaCCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGa > 1:990118/4‑100 (MQ=255) gCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGa > 1:2416226/1‑100 (MQ=255) cgcgccACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGa > 1:297097/5‑100 (MQ=255) ttaCCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTTGATTACTTTGACGATTATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAg > 1:1352032/3‑100 (MQ=255) tgACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAg > 1:4087530/2‑100 (MQ=255) tgACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAg > 1:2877242/2‑100 (MQ=255) tgACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGGTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAg > 1:4101119/2‑100 (MQ=255) tccccACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACAGCaaagatcgg > 1:5157417/4‑93 (MQ=255) ggACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACACTACCGCAAGTTCGAg > 1:6055172/2‑100 (MQ=255) ctgccACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCgcg > 1:3551613/4‑98 (MQ=255) cGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGTCGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAg > 1:5897893/1‑100 (MQ=255) taCCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAGTCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAgg > 1:4715428/2‑100 (MQ=255) gACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACcacagatcggaag > 1:1745057/1‑91 (MQ=255) gACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAgg > 1:5231137/1‑100 (MQ=255) gACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAgg > 1:3767581/1‑100 (MQ=255) gACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAgg > 1:408047/1‑100 (MQ=255) gACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAgg > 1:3316701/1‑100 (MQ=255) aaCCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAgg > 1:2151698/2‑100 (MQ=255) aCCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGc > 1:370929/1‑100 (MQ=255) aCCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGc > 1:4067638/1‑100 (MQ=255) aCCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGc > 1:1105862/1‑100 (MQ=255) gcACTGGGGTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTGCCGCAAGATCggaaga > 1:3341780/2‑95 (MQ=255) acACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTGCCGCAAGTTCGAGGCa > 1:596121/2‑100 (MQ=255) acACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCa > 1:2976002/2‑100 (MQ=255) gcTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCACAAGATCggaagagc > 1:3787901/2‑93 (MQ=255) ccTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCaag > 1:1411872/2‑98 (MQ=255) aCTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATg > 1:1004442/1‑100 (MQ=255) aCTGGGGTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATg > 1:2725559/1‑100 (MQ=255) 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1:1622843/1‑100 (MQ=255) gggTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGtat > 1:6340683/1‑100 (MQ=255) gggTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGtat > 1:101702/1‑100 (MQ=255) gggTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGtac > 1:3294761/1‑99 (MQ=255) gggTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGtaa > 1:101544/1‑99 (MQ=255) gggTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCACAAGATCggaagagcaca > 1:1967741/1‑90 (MQ=255) acactgcccATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATGACCGCAAGTTCGTGGCATGTATAAc > 1:6080488/8‑100 (MQ=255) tCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTACaagg < 1:5390998/100‑3 (MQ=255) ccGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCaacagatcgg > 1:1928722/2‑91 (MQ=255) acGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCAttagatcgg > 1:1552629/2‑92 (MQ=255) cGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACgg > 1:2923944/1‑100 (MQ=255) cGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACgg > 1:6249950/1‑100 (MQ=255) ttacgcATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGga > 1:5588775/6‑100 (MQ=255) gACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAActag > 1:4234079/1‑97 (MQ=255) cacacCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATTAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGga > 1:6160148/2‑100 (MQ=255) acacCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGCTGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGgag > 1:4053493/1‑100 (MQ=255) acacCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGGAAGTTCGAGGCATGTATACCGgat > 1:1509803/1‑99 (MQ=255) acacCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGGAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGACATGTATATCGgag > 1:4802706/1‑100 (MQ=255) acCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATGACGgagat > 1:4427866/1‑99 (MQ=255) acCATATACTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGgagat > 1:3561315/1‑99 (MQ=255) ataCTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGGAGACAGAgc > 1:1519817/1‑100 (MQ=255) ataCTTTATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTACAACgagatcggaag > 1:1864552/1‑90 (MQ=255) tATTGGATTACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGGAGACAGAGCGCGTaa > 1:1815915/1‑100 (MQ=255) tACTTTGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCACGTTCGAGGCATGTATAACGGAGACAGAGCGCGTAAACAAGttt > 1:3415553/1‑100 (MQ=255) ttGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGGAGACAGAGCGCGTAAACAAGTTTtggt > 1:275654/1‑100 (MQ=255) ttGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGGAGACAGAGCGCGTAAACAAGTTTtggt > 1:4743969/1‑100 (MQ=255) ttGACGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGGAGACAGAGCGCGTAAACAAGTTTtggt > 1:819032/1‑100 (MQ=255) | AGATGGGATTCTGTTCAGGAATTGAAAACTATTCCGTACATTTAACTTTGCGACCACTGGGTTCGACACCATATACTTTATTGGATTACTTTGGCGATGATTGGTTAGTAATGATTGATGAATCACATGTGACATTACCGCAAGTTCGAGGCATGTATAACGGAGACAGAGCGCGTAAACAAGTTTTGGT > NC_007793/824846‑825035 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |