Predicted mutation
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RA	NC_007793	757,599	T→C	T121T (ACT→ACC)	SAUSA300_RS03665 →	DeoR family transcriptional regulator

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_007793	757,599	0	T	C	100.0%	42.7 / NA	18	T121T (ACT→ACC)	SAUSA300_RS03665	DeoR family transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (14/4);  total (14/4)

TCGATGCTGGTTCATCTACATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACTAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACAATTATGCTAGGTGGTCA  >  NC_007793/757532‑757664                                                                    |                                                                  acGATGCTGGTTCATCTACATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTaa                                   >  1:5741984/2‑100 (MQ=255)     ctttGGTTCATCTACATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAACTTTACTTaaaaaa                               >  1:4970594/4‑100 (MQ=255)         ggTTCATCTACATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTa                           >  1:2507570/1‑100 (MQ=255)             cATCTACATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTaa                       >  1:1258138/1‑100 (MQ=255)             cATCTACATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTaa                       >  1:6038464/1‑100 (MQ=255)             cATCTACATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTaa                       >  1:4127363/1‑100 (MQ=255)               tCTACATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTaaaa                     >  1:505732/1‑100 (MQ=255)               cgtACATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTaaaa                     >  1:5655120/3‑100 (MQ=255)                  aCATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGTTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACaa                  >  1:265101/1‑100 (MQ=255)                  aCATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACaa                  >  1:3231541/1‑100 (MQ=255)                  aCATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACaa                  >  1:3197221/1‑100 (MQ=255)                  aCATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACaa                  >  1:5320368/1‑100 (MQ=255)                  aCATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACaa                  >  1:5332590/1‑100 (MQ=255)                  aCATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACaa                  >  1:5374643/1‑100 (MQ=255)                        gAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTT‑AAAAAGGTATTAAAACAATTATGCt           <  1:3978892/100‑1 (MQ=255)                         aGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACAATTATGCt           <  1:1114785/100‑1 (MQ=255)                               ttAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACAATTATGCTAggtgg     <  1:4577014/100‑1 (MQ=255)                                  aaTATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACCAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACAATTATGCTAGGTGGTCa  <  1:1928728/100‑1 (MQ=255)                                                                    |                                                                  TCGATGCTGGTTCATCTACATTGGAGCTAATTAAATATATTCAAGCGAAAGATATCATTGTGGTAACTAATGGTTTAACACATGTAGAAGCTTTACTTAAAAAAGGTATTAAAACAATTATGCTAGGTGGTCA  >  NC_007793/757532‑757664

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑