Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_007793 629,078 A→G I63M (ATA→ATG)  SAUSA300_RS02960 → 3‑hexulose‑6‑phosphate synthase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_007793629,0780AG99.8% 1183.5 / NA 417I63M (ATA→ATG) SAUSA300_RS029603‑hexulose‑6‑phosphate synthase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  major base G (414/2);  minor base C (1/0);  total (415/2)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 421 total aligned reads displayed.

CGGTACGCCAATCATTTACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATAGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTAAAGCAGCT  >  NC_007793/628982‑629174
                                                                                                |                                                                                                
    aCGCCAATCATTTACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGGCAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAg                                                                                           >  1:6476376/1‑100 (MQ=255)
       ccAATCATTTACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTg                                                                                        >  1:6152961/1‑100 (MQ=255)
                           aaccccAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGGAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCa                                                                    >  1:2365553/5‑100 (MQ=255)
                            ttACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCaa                                                                   >  1:5155990/1‑100 (MQ=255)
                            ttACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCaa                                                                   >  1:4068519/1‑100 (MQ=255)
                             tgccAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAAt                                                                  >  1:1749448/3‑100 (MQ=255)
                             tACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAAt                                                                  >  1:719100/1‑100 (MQ=255)
                             tACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAAt                                                                  >  1:3814798/1‑100 (MQ=255)
                             aaCCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAAt                                                                  >  1:5612688/2‑100 (MQ=255)
                              aCCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAAtt                                                                 >  1:142555/1‑100 (MQ=255)
                               ccAGCAGTTAAACATATGGCAGCCAACATTAGTAATGTAAAAGCATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTa                                                                >  1:4213008/1‑100 (MQ=255)
                               ccAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTa                                                                >  1:783407/1‑100 (MQ=255)
                               ccAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTa                                                                >  1:1195410/1‑100 (MQ=255)
                               ccAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTa                                                                >  1:1904363/1‑100 (MQ=255)
                               catgcagTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTa                                                                >  1:1652124/4‑100 (MQ=255)
                                 tgcagTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTaaa                                                              >  1:6048290/2‑100 (MQ=255)
                                   cagTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAAtt                                                            >  1:5004412/1‑100 (MQ=255)
                                        tcaCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgcg                                                       >  1:2652163/3‑100 (MQ=255)
                                        caaCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgcg                                                       >  1:1982259/2‑100 (MQ=255)
                                        aaaCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgcg                                                       >  1:4361054/1‑100 (MQ=255)
                                         gaCATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgcgc                                                      >  1:5710396/2‑100 (MQ=255)
                                          ccATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGcgcg                                                     >  1:1094618/2‑100 (MQ=255)
                                           cATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCgg                                                    >  1:5372986/1‑100 (MQ=255)
                                            ttatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCAGa                                                   >  1:5216596/2‑100 (MQ=255)
                                            gtatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa                                                   >  1:803356/2‑100 (MQ=255)
                                            gtatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTCGGCGCAGa                                                   >  1:4139284/2‑100 (MQ=255)
                                            ctatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa                                                   >  1:418342/2‑100 (MQ=255)
                                            ctatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa                                                   >  1:2110413/2‑100 (MQ=255)
                                            ctatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTCGGCGCAGa                                                   >  1:2868023/2‑100 (MQ=255)
                                            ctatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTCGGCGCAGa                                                   >  1:169919/2‑100 (MQ=255)
                                            ctatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTCGGCGCAGa                                                   >  1:2237318/2‑100 (MQ=255)
                                            atatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa                                                   >  1:300332/1‑100 (MQ=255)
                                            atatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa                                                   >  1:4650033/1‑100 (MQ=255)
                                            agatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGa                                                   >  1:910789/3‑100 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTGTTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTGAATTTGgcagatcg                                                  >  1:4978834/1‑94 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACGTGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTGAATTTGGCGCGGAt                                                  >  1:4796582/1‑100 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTGAATTTGGCGCGGAt                                                  >  1:4808344/1‑100 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt                                                  >  1:3355287/1‑100 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt                                                  >  1:4220063/1‑100 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt                                                  >  1:6202291/1‑100 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCAGAt                                                  >  1:6098136/1‑100 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTCGGCGCAGAt                                                  >  1:5298436/1‑100 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAATTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt                                                  >  1:3604428/1‑100 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAACTGATTATTAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCCCGGAt                                                  >  1:882758/1‑100 (MQ=255)
                                             tatGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGAAGTCATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCAGAt                                                  >  1:3861073/1‑100 (MQ=255)
                                             acaggCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGAt                                                  >  1:1150973/4‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGGAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:3091180/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAGATTTGGcgcgaaga                                                 >  1:4905316/1‑96 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGgcggaagat                                                 >  1:3139762/1‑94 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGcgcgagat                                                 >  1:2740402/1‑96 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGaga                                                 >  1:1492365/1‑98 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGaga                                                 >  1:2568399/1‑98 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:2793843/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:4589699/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:5746970/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:5961038/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:1813419/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:6328753/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:3671220/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:2474104/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:3988391/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:3953157/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATg                                                 >  1:4350310/1‑100 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCAGAtc                                                 >  1:2067166/1‑99 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCAGAtc                                                 >  1:5576950/1‑99 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCAGAtc                                                 >  1:2196363/1‑99 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGACGCAGAtc                                                 >  1:2291517/1‑99 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTCGGCGCAGAtc                                                 >  1:4521737/1‑99 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGACGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCAGAtc                                                 >  1:4729678/1‑99 (MQ=255)
                                              atGGCAGACAACATTAGAAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTCGGCGCAGAtc                                                 >  1:5234146/1‑99 (MQ=255)
                                                ggCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGcgcgagatcg                                               >  1:5135905/1‑94 (MQ=255)
                                                ggCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTa                                               >  1:154995/1‑100 (MQ=255)
                                                ggCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTa                                               >  1:6402936/1‑100 (MQ=255)
                                                ggCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTa                                               >  1:243747/1‑100 (MQ=255)
                                                ggCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTa                                               >  1:3218144/1‑100 (MQ=255)
                                                  ccgACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGGTGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTCGGCGCAGaccggaa                                             >  1:6579657/3‑94 (MQ=255)
                                                  cAGACAACATTAGCAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATAATGGATGCAGCTGATTATGCATTTACCCAAGTTATTAAATTTGCCGCGGATGTact                                             >  1:5908500/1‑98 (MQ=255)
                                                    gACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTa                                           >  1:4566789/1‑100 (MQ=255)
                                                            tAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTGTGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTa                                   >  1:5826090/1‑100 (MQ=255)
                                                              gTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAgg                                 >  1:1068244/1‑100 (MQ=255)
                                                                taTGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGgtg                               >  1:3302467/2‑100 (MQ=255)
                                                                aaTGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGgtg                               >  1:1281051/1‑100 (MQ=255)
                                                                aaTGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCGGATTATGACGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGgtg                               >  1:318489/1‑100 (MQ=255)
                                                                           aTTAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGAt                    >  1:390298/1‑100 (MQ=255)
                                                                             tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGAtcg                  >  1:353777/1‑98 (MQ=255)
                                                                             tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGc                  >  1:625422/1‑100 (MQ=255)
                                                                             tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGc                  >  1:4433125/1‑100 (MQ=255)
                                                                             tAGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGc                  >  1:6646656/1‑100 (MQ=255)
                                                                              ggCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCa                 >  1:534209/2‑100 (MQ=255)
                                                                              aGCAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCa                 >  1:6439258/1‑100 (MQ=255)
                                                                                taGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATc               >  1:2954622/2‑100 (MQ=255)
                                                                                ctgACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATc               >  1:750799/3‑100 (MQ=255)
                                                                                cAGACCTGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATc               >  1:2508898/1‑100 (MQ=255)
                                                                                cAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATc               >  1:548460/1‑100 (MQ=255)
                                                                                cAGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATc               >  1:4259801/1‑100 (MQ=255)
                                                                                 cgACATGAAGATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCa              >  1:3372334/2‑100 (MQ=255)
                                                                                 aGACATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCa              >  1:5981185/1‑100 (MQ=255)
                                                                                    cATGAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAAtt           >  1:3462152/1‑100 (MQ=255)
                                                                                       gAAAATTATGGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAATCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTaaa        >  1:2161265/1‑100 (MQ=255)
                                                                                             tatgGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTAAaacaacg  >  1:2692977/1‑97 (MQ=255)
                                                                                                |                                                                                                
CGGTACGCCAATCATTTACAACGAAGGTTTACCAGCAGTTAAACATATGGCAGACAACATTAGTAATGTAAAAGTATTAGCAGACATGAAAATTATAGATGCAGCTGATTATGAAGTTAGCCAAGCAATTAAATTTGGCGCGGATGTAATTACAATACTAGGTGTTGCAGAAGATGCATCAATTAAAGCAGCT  >  NC_007793/628982‑629174

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑