| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 616,745 | A→G | N797D (AAT→GAT) | SAUSA300_RS02920 → | serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 616,745 | 0 | A | G | 93.0% | 146.2 / 6.0 | 128 | N797D (AAT→GAT) | SAUSA300_RS02920 | serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (9/0); new base G (119/0); total (128/0) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.40e-02 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
AATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCAGGATTCAACTGAAAAAGGTATTTCAGGCGTAACAGT > NC_007793/616655‑616818 | aaTGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATtatgtat > 1:6169068/1‑100 (MQ=255) acaGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTACGGGAAGAtcggaaga > 1:6430834/1‑93 (MQ=255) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:480655/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:2247409/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:2278445/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:2519447/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:334659/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:3618049/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4224633/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4354803/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4573910/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1078459/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5236028/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5347958/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5483742/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5879843/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:6463066/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:820782/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:2110733/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:104246/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1627629/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1758615/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1623825/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1961920/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1306428/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:176072/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:134454/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1419042/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGAACGATTCTAAt > 1:548855/8‑100 (MQ=9) tggcacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1618881/8‑100 (MQ=9) aggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4496684/8‑100 (MQ=9) aggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5674013/8‑100 (MQ=9) aggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:6146463/8‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGTTAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATAGTACGATTCTAATa > 1:4927847/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTGCAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:471529/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAGAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:6402860/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1641915/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:6126280/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:6635829/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:4595533/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:6600050/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1230788/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5283029/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1474613/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5353684/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5376404/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5410959/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:933364/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5523090/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5611643/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5922375/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5951933/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:428385/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2136613/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2365015/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:195907/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2751391/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2961918/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2965223/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2969572/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3226251/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3239940/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3489732/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:4301262/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1719185/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3898412/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3716747/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGCGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3476824/7‑100 (MQ=9) agtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3507286/7‑100 (MQ=9) caTGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGGTGGTAAga > 1:2394225/2‑99 (MQ=255) aaTGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATAC‑AATAAAGATCGGAAgag > 1:2209997/1‑98 (MQ=21) gATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATTAAGATCGGAAgagcacacgtc > 1:5120659/1‑90 (MQ=18) gACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCAGAATTCAACTGaaaaa > 1:4827596/1‑100 (MQ=255) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:458013/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:598353/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:1379578/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:5867380/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:4724715/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:5568816/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:5451988/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:5595585/1‑100 (MQ=9) gaGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:6236295/2‑100 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAGATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGGACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:1982653/1‑99 (MQ=2) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:2394953/1‑99 (MQ=2) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:2160550/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:790008/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:2165247/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:3146026/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:3098494/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:6352395/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:6302212/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:2576655/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:3385712/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:4761131/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:280835/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:4616051/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:5767901/1‑99 (MQ=2) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:2811448/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:3889604/1‑99 (MQ=9) aCAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCAGGATTCAACTGAAAAAGGTATTTCAGGCGTAACAGt > 1:3409248/1‑100 (MQ=255) | AATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCAGGATTCAACTGAAAAAGGTATTTCAGGCGTAACAGT > NC_007793/616655‑616818 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |