| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 616,697 | 0 | A | T | 75.7% | 36.3 / 53.7 | 107 | M781L (ATG→TTG) | SAUSA300_RS02920 | serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/2); new base T (81/0); total (105/2) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.73e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ATACACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCAGGATTCAA > NC_007793/616608‑616790 | ataCACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGa > 1:6072362/1‑100 (MQ=255)ataCACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGa > 1:2799076/1‑100 (MQ=255)ataCACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGa > 1:877543/1‑100 (MQ=255)ataCACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGa > 1:1642730/1‑100 (MQ=255)ataCACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGa > 1:4192834/1‑100 (MQ=255) acacCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATa > 1:2748361/1‑100 (MQ=255) acacCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATa > 1:5757266/1‑100 (MQ=255) tAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACaa > 1:3533487/1‑100 (MQ=255) cTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAc‑‑‑c > 1:5817783/1‑100 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAc‑‑‑ctg < 1:314720/100‑3 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:3648373/1‑100 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:5916651/1‑100 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:6500643/1‑100 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:1884537/1‑100 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:1005359/1‑100 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:863172/1‑100 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:1629297/1‑100 (MQ=255) aacggCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCCACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:5301384/5‑100 (MQ=255) aaaaGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATaacacacct < 1:1933035/100‑8 (MQ=255) aaTGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATtatgtat > 1:6169068/1‑100 (MQ=255) acaGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTACGGGAAGAtcggaaga > 1:6430834/1‑93 (MQ=255) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:3413456/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:480655/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4728212/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5339909/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5879843/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5347958/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4573910/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4354803/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5483742/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:3618049/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5236028/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4224633/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:2110733/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:134454/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1758615/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:176072/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1419042/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1306428/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1961920/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:6463066/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:820782/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1078459/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:2247409/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1627629/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:104246/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1623825/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:2519447/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGAACGATTCTAAt > 1:548855/8‑100 (MQ=9) tggcacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1618881/8‑100 (MQ=9) aggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5674013/8‑100 (MQ=9) aggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:6146463/8‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGTTAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATAGTACGATTCTAATa > 1:4927847/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTGCAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:471529/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAGAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:6402860/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5353684/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:933364/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5410959/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:767473/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5523090/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:6635829/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5611643/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:6600050/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5896878/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5922375/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5951933/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:625212/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2961918/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1230788/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1311091/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1474613/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1513036/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:163664/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1719185/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:179796/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:195907/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2136613/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2365015/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:256506/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2751391/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:29410/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5283029/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2969572/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:4608962/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:4595533/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:4494639/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:4301262/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:428385/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3898412/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3716747/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2965223/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3489732/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3239940/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3226251/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGCGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3476824/7‑100 (MQ=9) agtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3507286/7‑100 (MQ=9) caTGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGGTGGTAAga > 1:2394225/2‑99 (MQ=255) aaTGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATAC‑AATAAAGATCGGAAgag > 1:2209997/1‑98 (MQ=21) gATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAGATAAAGATCGGAAgagcacacgtc > 1:201334/1‑90 (MQ=18) gATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATTAAGATCGGAAgagcacacgtc > 1:5120659/1‑90 (MQ=18) | ATACACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCAGGATTCAA > NC_007793/616608‑616790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |