| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_007793 | 616,684 | 0 | T | A | 76.4% | 35.5 / 53.6 | 106 | N776K (AAT→AAA) | SAUSA300_RS02920 | serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (23/2); new base A (81/0); total (104/2) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.39e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.06e-06 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TGAATTTACTACACCAGAAGGCTATACACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCA > NC_007793/616585‑616782 | tGAATTTACTACACCAGAAGGCTATACACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAAt > 1:3706409/1‑100 (MQ=255) ttACTACACCAGAAGGCTATACACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGc > 1:1087128/1‑100 (MQ=255) ataCACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGa > 1:877543/1‑100 (MQ=255) ataCACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGa > 1:2799076/1‑100 (MQ=255) ataCACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGa > 1:4192834/1‑100 (MQ=255) ataCACCGACTACAGTAACATCTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGa > 1:6072362/1‑100 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |