Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_007793	1266075	1266077	3	3 [0]	[0] 92	SAUSA300_RS06250/SAUSA300_RS06255	phosphatidate cytidylyltransferase/zinc metalloprotease

CAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCAATC  >  NC_007793/1266068‑1266177           |                                                                                                    cagaactccttttGAAGATTATACGCAATATAAACATTGAAACTTTGACGTTATATTTCGTGATATGTCAGTATCAAATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1713271/11‑100 (MQ=21) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGACAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATTACTTATGTTACGta            >  1:4973818/11‑100 (MQ=25) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTTTATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:908211/11‑100 (MQ=25) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTGTATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1386657/11‑100 (MQ=25) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTCTATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGTCTGATGTTACGta            >  1:6082925/11‑100 (MQ=21) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:5026426/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:5616950/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:459640/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:4508000/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:4506230/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:4363757/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:4119750/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:4111600/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:4043581/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:4032604/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3992508/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3922371/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3813841/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:377727/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3771400/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3654726/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3595153/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:6392295/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:971051/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:958597/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:922427/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:803895/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:775112/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:744815/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:736314/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:696325/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:508227/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:6208783/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:6146193/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:5917593/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:5693938/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:5664623/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3937065/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:5413071/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2074718/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1343023/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2329689/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2225043/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2213248/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2190617/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3498999/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2181263/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2159489/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1590589/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1702212/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2072361/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1777370/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2070251/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1801779/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1847119/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1864912/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2423578/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3460249/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3383656/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3263704/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3185561/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:3135877/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2920350/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2856364/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2665114/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2613051/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:2460709/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1305855/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:1333304/11‑100 (MQ=255) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATAACTTATGTTACGta            >  1:4962645/11‑100 (MQ=25) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATAACTTATGTTACGta            >  1:4920977/11‑100 (MQ=25) cagaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGCATCATATTATAATGACTTATGTTACGta            >  1:5496465/11‑100 (MQ=25)  agaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGtat           >  1:4336577/10‑100 (MQ=255)  agaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGtat           >  1:133352/10‑100 (MQ=255)  agaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGAGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGtat           >  1:1117337/10‑100 (MQ=25)   gaactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGGTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGtata          >  1:1137118/9‑100 (MQ=25)    atctccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATAc         <  1:5152091/93‑1 (MQ=255)    aactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATAc         >  1:6583728/8‑100 (MQ=255)    aactccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATAc         >  1:5686187/8‑100 (MQ=255)     actccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACa        >  1:6264059/7‑100 (MQ=255)     aatccttttGAAAATTATACGCAAAATTAACTTTGAAAATTAGAAGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACa        >  1:5921453/7‑100 (MQ=37)       tccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGc      <  1:455962/96‑1 (MQ=255)        ccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCa     >  1:5934013/4‑100 (MQ=255)        ccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCa     >  1:5891748/4‑100 (MQ=255)        ccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCa     >  1:738367/4‑100 (MQ=255)        ccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCa     >  1:1417205/4‑100 (MQ=255)        ccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCa     >  1:2365416/4‑100 (MQ=255)        ccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCa     >  1:2397878/4‑100 (MQ=255)        ccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCa     >  1:4180772/4‑100 (MQ=255)        ccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCa     >  1:3642631/4‑100 (MQ=255)        ccttttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGATATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACATATACAGCa     >  1:4132024/4‑100 (MQ=255)           tttGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCAATc  >  1:1370823/1‑100 (MQ=255)           |                                                                                                    CAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTAGACGTTATATTTTGTGATTTGTCAGTATCATATTATAATGACTTATGTTACGTATACAGCAATC  >  NC_007793/1266068‑1266177

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑