Missing coverage evidence...
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GGCTTGGCGAAAAAATAGGGTGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCATTA  >  NC_007793/862105‑862208     |                                                                                                    tgcctggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGc      >  1:2757235/5‑100 (MQ=255)  ttatggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCa     >  1:5253030/4‑100 (MQ=255)  acgtggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCa     >  1:1871204/4‑100 (MQ=255)   tgtggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAgatc    >  1:4646194/3‑97 (MQ=255)   tctggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCAt    >  1:4621336/3‑100 (MQ=255)   catggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAGAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCAt    >  1:1216283/3‑100 (MQ=255)   actggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGACAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCAt    >  1:4471825/3‑100 (MQ=255)   actggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCAt    >  1:3280864/3‑100 (MQ=255)    gtggcGAAAACATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCAtt   >  1:1773316/2‑100 (MQ=255)    ctggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCaga   >  1:284164/2‑98 (MQ=255)    ctggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCAtt   >  1:404381/2‑100 (MQ=255)     tggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTCGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGATCATTa  >  1:6626236/1‑100 (MQ=255)     tggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCATTa  >  1:1029716/1‑100 (MQ=255)     tggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCATTa  >  1:24443/1‑100 (MQ=255)     tggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCATTa  >  1:2985049/1‑100 (MQ=255)     tggcGAAAAAATAGGGGGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCATTa  >  1:4091963/1‑100 (MQ=255)     |                                                                                                    GGCTTGGCGAAAAAATAGGGTGTAAGGTAGGTTGTTAATTAGGGAAAATTAAGGAGAAAATACAGTTGAAAAATAAATTGCTAGTTTTATCATTGGGAGCATTA  >  NC_007793/862105‑862208

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑